118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0058 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0058  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  357  3e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0647  type VI secretion system effector, Hcp1 family  80.81 
 
 
172 aa  306  9e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0344  type VI secretion system effector, Hcp1 family  80.23 
 
 
172 aa  306  1e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3239  type VI secretion system effector, Hcp1 family  80.23 
 
 
172 aa  306  1e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0061  type VI secretion system effector, Hcp1 family  80.81 
 
 
172 aa  305  2e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4256  type VI secretion system effector, Hcp1 family  80.81 
 
 
172 aa  305  2e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2697  type VI secretion system effector, Hcp1 family  80.23 
 
 
172 aa  305  2e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.788661  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1606  type VI secretion system effector, Hcp1 family  80.23 
 
 
172 aa  305  2e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2826  type VI secretion system effector, Hcp1 family  79.65 
 
 
172 aa  304  4e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1501  type VI secretion system effector, Hcp1 family  79.65 
 
 
172 aa  304  4e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2558  type VI secretion system effector, Hcp1 family  79.65 
 
 
172 aa  304  4e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1163  type VI secretion system effector, Hcp1 family  79.65 
 
 
172 aa  304  4e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.838462  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0417  type VI secretion system effector, Hcp1 family  79.65 
 
 
172 aa  304  4e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0054  type VI secretion system effector, Hcp1 family  79.07 
 
 
172 aa  304  5e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0180  hypothetical protein  79.65 
 
 
172 aa  301  2e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3906  hypothetical protein  79.07 
 
 
172 aa  297  4e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0312  hypothetical protein  79.07 
 
 
172 aa  297  4e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0385  Hcp1 family type VI secretion system effector  79.07 
 
 
172 aa  297  4e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1113  hcp  78.49 
 
 
172 aa  294  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1233  hypothetical protein  78.49 
 
 
172 aa  294  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.189483 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0243  hypothetical protein  77.91 
 
 
172 aa  292  2e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0241  hypothetical protein  77.91 
 
 
172 aa  292  2e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0249  hypothetical protein  77.91 
 
 
172 aa  292  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2514  Hcp1 family type VI secretion system effector  73.26 
 
 
172 aa  282  2e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.908248  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3233  Hcp1 family type VI secretion system effector  70 
 
 
171 aa  271  3e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1025  hcp protein  70.93 
 
 
172 aa  266  1e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0116  hcp protein  70.35 
 
 
172 aa  265  2e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2118  hypothetical protein  68.82 
 
 
171 aa  258  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4082  hcp protein  69.23 
 
 
171 aa  258  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  9.15297e-05 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2615  hcp protein  69.23 
 
 
171 aa  258  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0191752 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1153  Hcp1 family type VI secretion system effector  68.05 
 
 
171 aa  254  4e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.465729  normal  0.823154 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1211  hypothetical protein  64.53 
 
 
172 aa  245  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1195  hypothetical protein  64.53 
 
 
172 aa  245  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1182  hypothetical protein  64.53 
 
 
172 aa  245  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1188  secreted protein Hcp  62.87 
 
 
173 aa  229  2e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4487  hypothetical protein  58.72 
 
 
172 aa  222  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5435  secreted protein Hcp  60 
 
 
172 aa  215  3e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2328  hypothetical protein  57.65 
 
 
171 aa  214  6e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69560  secreted protein Hcp  59.41 
 
 
172 aa  213  1e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00260129  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43070  secreted protein Hcp  59.41 
 
 
172 aa  213  1e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  4.28975e-12  normal  0.177262 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03240  secreted protein Hcp  59.41 
 
 
172 aa  213  1e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000126332  hitchhiker  9.98491e-17 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44890  secreted protein Hcp  59.41 
 
 
172 aa  213  1e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00654526  normal  0.188551 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2045  hypothetical protein  57.06 
 
 
171 aa  213  1e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1247  secreted protein Hcp  58.82 
 
 
172 aa  212  3e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.129436  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000449  Hcp protein  54.65 
 
 
172 aa  204  4e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  1.34513e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_35  secreted protein Hcp-2 (haemolysin co-regulated protein)  51.74 
 
 
172 aa  196  1e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1357  secreted protein Hcp-2 (haemolysin co-regulated protein)  51.74 
 
 
172 aa  196  2e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1202  secreted protein Hcp-1 (haemolysin co-regulated protein)  50.58 
 
 
173 aa  194  5e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05871  hypothetical protein  53.01 
 
 
166 aa  191  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0533  type VI secretion system effector, Hcp1 family  74.07 
 
 
124 aa  181  4e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0868  hcp protein  38.46 
 
 
162 aa  139  2e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2539  secreted protein Hcp  40.61 
 
 
171 aa  131  4e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0301409  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3174  hcp protein  33.73 
 
 
161 aa  119  2e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5212  hypothetical protein  37.06 
 
 
161 aa  112  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0280  hypothetical protein  32.54 
 
 
161 aa  111  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3644  type VI secretion system effector, Hcp1 family  36.53 
 
 
159 aa  105  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.272221  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1626  type VI secretion system effector, Hcp1 family  34.73 
 
 
161 aa  104  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4078  type VI secretion system effector, Hcp1 family  33.53 
 
 
159 aa  104  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00339373  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3506  type VI secretion system effector, Hcp1 family  35.93 
 
 
159 aa  103  8e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1304  Hcp1 family type VI secretion system effector  35.29 
 
 
159 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.543696  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0406  hypothetical protein  35.29 
 
 
159 aa  102  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.91771e-05  hitchhiker  2.30132e-05 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1198  hypothetical protein  35.29 
 
 
159 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00141696  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0741  type VI secretion system effector, Hcp1 family  35.54 
 
 
155 aa  100  7e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.155948  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3060  Hcp1 family type VI secretion system effector  34.12 
 
 
159 aa  99.8  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0441  type VI secretion system effector, Hcp1 family  35.19 
 
 
159 aa  99.8  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2983  hypothetical protein  34.12 
 
 
159 aa  99.8  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1885  hypothetical protein  34.3 
 
 
190 aa  99  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0109727  hitchhiker  6.06082e-05 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0013  secreted protein Hcp, potential oxidative stress protein  33.73 
 
 
172 aa  98.2  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5261  hypothetical protein  29.52 
 
 
161 aa  97.4  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0226  hypothetical protein  33.92 
 
 
160 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0224  hypothetical protein  33.92 
 
 
160 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.156413  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2696  type VI secretion system effector, Hcp1 family  34.13 
 
 
159 aa  97.1  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.441294  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4049  type VI secretion system effector, Hcp1 family  34.13 
 
 
157 aa  94.7  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0159  hypothetical protein  30.54 
 
 
161 aa  94.7  5e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.354123  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0619  hypothetical protein  28.92 
 
 
161 aa  94  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0130418 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1346  hypothetical protein  32.14 
 
 
159 aa  90.9  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1459  Hcp1 family type VI secretion system effector  32.14 
 
 
159 aa  90.9  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.303873  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2816  hypothetical protein  30.22 
 
 
161 aa  90.5  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0574  type VI secretion system effector, Hcp1 family  31.55 
 
 
182 aa  88.2  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.237126  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3977  type VI secretion system effector, Hcp1 family  31.93 
 
 
159 aa  87.8  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0251  Hcp1 family type VI secretion system effector  31.14 
 
 
159 aa  87.8  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3645  Hcp1 family type VI secretion system effector  28.92 
 
 
161 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.265959  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3256  Hcp1 family type VI secretion system effector  28.14 
 
 
167 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3128  hypothetical protein  27.11 
 
 
163 aa  84.7  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4027  type VI secretion system effector, Hcp1 family  32.74 
 
 
159 aa  84  8e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.363751  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4093  type VI secretion system effector, Hcp1 family  33.33 
 
 
159 aa  82.8  2e-15  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0803  Hcp1 family type VI secretion system effector  27.11 
 
 
163 aa  83.2  2e-15  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0782  hypothetical protein  26.51 
 
 
163 aa  82.8  2e-15  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2506  hypothetical protein  27.11 
 
 
163 aa  83.2  2e-15  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0731  hypothetical protein  27.11 
 
 
163 aa  83.2  2e-15  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1216  HNH endonuclease domain-containing protein  29.41 
 
 
159 aa  82  4e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.516867  normal  0.131262 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1588  hypothetical protein  28.65 
 
 
163 aa  82  4e-15  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00504704  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2981  hypothetical protein  26.35 
 
 
163 aa  80.5  1e-14  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  2.97859e-05 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0171  hypothetical protein  26.35 
 
 
163 aa  80.5  1e-14  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  1.04194e-05 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2272  type VI secretion system effector, Hcp1 family  29.76 
 
 
159 aa  79.3  2e-14  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0019  hypothetical protein  30.52 
 
 
162 aa  78.6  4e-14  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.965697  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1788  hypothetical protein  26.51 
 
 
163 aa  78.2  6e-14  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3004  hypothetical protein  30 
 
 
132 aa  74.7  5e-13  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00118578  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3284  hcp  67.39 
 
 
66 aa  74.7  6e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.360217  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1097  type VI secretion system effector, Hcp1 family  28.24 
 
 
159 aa  74.7  6e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>