51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B3284 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



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Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B3284  hcp  100 
 
 
66 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.360217  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0241  hypothetical protein  82.61 
 
 
172 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0249  hypothetical protein  82.61 
 
 
172 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0243  hypothetical protein  82.61 
 
 
172 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1233  hypothetical protein  82.61 
 
 
172 aa  87.8  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.189483 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1113  hcp  82.61 
 
 
172 aa  87.8  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0312  hypothetical protein  78.26 
 
 
172 aa  85.5  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3906  hypothetical protein  78.26 
 
 
172 aa  85.5  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0385  Hcp1 family type VI secretion system effector  78.26 
 
 
172 aa  85.5  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2558  type VI secretion system effector, Hcp1 family  65.22 
 
 
172 aa  78.2  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0180  hypothetical protein  71.74 
 
 
172 aa  78.6  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1501  type VI secretion system effector, Hcp1 family  65.22 
 
 
172 aa  78.2  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2826  type VI secretion system effector, Hcp1 family  65.22 
 
 
172 aa  78.2  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1163  type VI secretion system effector, Hcp1 family  65.22 
 
 
172 aa  78.2  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.838462  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0417  type VI secretion system effector, Hcp1 family  65.22 
 
 
172 aa  78.2  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0054  type VI secretion system effector, Hcp1 family  67.39 
 
 
172 aa  77.4  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3239  type VI secretion system effector, Hcp1 family  67.39 
 
 
172 aa  77  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0647  type VI secretion system effector, Hcp1 family  67.39 
 
 
172 aa  77  0.00000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0061  type VI secretion system effector, Hcp1 family  67.39 
 
 
172 aa  76.6  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0344  type VI secretion system effector, Hcp1 family  67.39 
 
 
172 aa  76.6  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0533  type VI secretion system effector, Hcp1 family  67.39 
 
 
124 aa  76.3  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2514  Hcp1 family type VI secretion system effector  50.79 
 
 
172 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.908248  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4256  type VI secretion system effector, Hcp1 family  65.22 
 
 
172 aa  75.1  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2697  type VI secretion system effector, Hcp1 family  63.04 
 
 
172 aa  74.7  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.788661  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0058  hypothetical protein  67.39 
 
 
172 aa  74.7  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1606  type VI secretion system effector, Hcp1 family  63.04 
 
 
172 aa  74.7  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1025  hcp protein  65.22 
 
 
172 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0116  hcp protein  65.22 
 
 
172 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1153  Hcp1 family type VI secretion system effector  62.79 
 
 
171 aa  67  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.465729  normal  0.823154 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1211  hypothetical protein  56.52 
 
 
172 aa  66.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1182  hypothetical protein  56.52 
 
 
172 aa  66.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_1195  hypothetical protein  56.52 
 
 
172 aa  66.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3233  Hcp1 family type VI secretion system effector  50 
 
 
171 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4487  hypothetical protein  54.17 
 
 
172 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007492  Pfl01_2328  hypothetical protein  57.14 
 
 
171 aa  57.8  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2045  hypothetical protein  57.14 
 
 
171 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4082  hcp protein  51.02 
 
 
171 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000915297 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2615  hcp protein  51.02 
 
 
171 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0191752 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1188  secreted protein Hcp  57.5 
 
 
173 aa  56.2  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5435  secreted protein Hcp  54.76 
 
 
172 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_1247  secreted protein Hcp  54.76 
 
 
172 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.129436  n/a   
 
 
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NC_009512  Pput_2118  hypothetical protein  46 
 
 
171 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69560  secreted protein Hcp  54.76 
 
 
172 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00260129  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44890  secreted protein Hcp  54.76 
 
 
172 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00654526  normal  0.188551 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43070  secreted protein Hcp  54.76 
 
 
172 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000428975  normal  0.177262 
 
 
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NC_008463  PA14_03240  secreted protein Hcp  54.76 
 
 
172 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000126332  hitchhiker  9.98491e-17 
 
 
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NC_009784  VIBHAR_05871  hypothetical protein  47.73 
 
 
166 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011312  VSAL_I1202  secreted protein Hcp-1 (haemolysin co-regulated protein)  45.45 
 
 
173 aa  42.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013457  VEA_000449  Hcp protein  45.45 
 
 
172 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000134513  n/a   
 
 
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NC_011312  VSAL_I1357  secreted protein Hcp-2 (haemolysin co-regulated protein)  43.18 
 
 
172 aa  40.8  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011311  VSAL_p840_35  secreted protein Hcp-2 (haemolysin co-regulated protein)  43.18 
 
 
172 aa  40.8  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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