More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0043 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0043  Rhs element Vgr protein  100 
 
 
320 aa  646  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0838  Rhs element Vgr protein  85.13 
 
 
697 aa  518  1e-146  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0650  Rhs element Vgr protein  88.93 
 
 
727 aa  493  1e-138  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0732792  normal  0.0253872 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1145  Rhs element Vgr protein  88.19 
 
 
706 aa  465  1e-130  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3719  Rhs element Vgr protein  62.36 
 
 
723 aa  334  1e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331309  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2151  Rhs element Vgr protein  55 
 
 
706 aa  306  4e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2579  Rhs element Vgr protein  58.25 
 
 
687 aa  305  1e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0472026  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2572  Rhs element Vgr protein  58.25 
 
 
687 aa  305  1e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0544876  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2565  Rhs element Vgr protein  58.25 
 
 
687 aa  305  1e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125293  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1026  vgrG protein  54.24 
 
 
1095 aa  296  4e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0115  vgrG protein  49.03 
 
 
694 aa  289  5e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0014  vgrG protein  53.57 
 
 
1017 aa  287  2e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1183  Rhs element Vgr protein  48.05 
 
 
694 aa  286  3e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1212  Rhs element Vgr protein  45.65 
 
 
699 aa  278  6e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1194  Rhs element Vgr protein  48.55 
 
 
655 aa  278  8e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5436  Rhs element Vgr protein  50.56 
 
 
680 aa  273  3e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0107  Rhs element Vgr protein  50 
 
 
693 aa  272  5e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4385  Rhs element Vgr protein  47.78 
 
 
763 aa  263  4e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  44.93 
 
 
683 aa  263  4e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  42.76 
 
 
683 aa  262  7e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21450  hypothetical protein  48.68 
 
 
688 aa  257  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18985  hypothetical protein  50.18 
 
 
808 aa  256  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  2.61066e-08  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2631  Rhs element Vgr protein  46.44 
 
 
684 aa  252  5e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2538  Rhs element Vgr protein  46.43 
 
 
680 aa  252  6e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5415  Rhs element Vgr protein  49 
 
 
678 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0820  Rhs element Vgr protein  49.64 
 
 
694 aa  249  4e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.476122  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3454  type VI secretion system Vgr family protein  44.74 
 
 
655 aa  249  4e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2044  Rhs element Vgr protein  48.54 
 
 
680 aa  248  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.909849  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2513  type VI secretion system Vgr family protein  41.39 
 
 
682 aa  248  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67230  hypothetical protein  49.63 
 
 
790 aa  242  5e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69550  hypothetical protein  49.64 
 
 
680 aa  242  5e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256731  normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43080  hypothetical protein  49.64 
 
 
680 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.76027e-09  normal  0.282542 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3238  type VI secretion system Vgr family protein  39.41 
 
 
678 aa  241  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2825  type VI secretion system Vgr family protein  40.39 
 
 
678 aa  241  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2188  type VI secretion system Vgr family protein  43.98 
 
 
656 aa  241  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.33539  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4488  Rhs element Vgr protein  46.61 
 
 
702 aa  238  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5574  Rhs element Vgr protein  47.83 
 
 
741 aa  238  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3849  Rhs element Vgr protein  43.07 
 
 
675 aa  223  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1162  type VI secretion system Vgr family protein  41.5 
 
 
617 aa  220  2e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.754803  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1502  type VI secretion system Vgr family protein  41.11 
 
 
617 aa  218  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0418  type VI secretion system Vgr family protein  40.71 
 
 
617 aa  215  8e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_36  VgrG protein, VgrG-2  36.31 
 
 
754 aa  213  2e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4257  type VI secretion system Vgr family protein  41.76 
 
 
610 aa  214  2e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0345  type VI secretion system Vgr family protein  42.02 
 
 
619 aa  213  4e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3482  Rhs element Vgr protein  42.28 
 
 
675 aa  213  5e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0192027  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1358  VgrG preotein, VgrG-2  33.16 
 
 
754 aa  211  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01965  hypothetical protein  40.98 
 
 
771 aa  211  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1607  type VI secretion system Vgr family protein  40.94 
 
 
616 aa  209  4e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2696  type VI secretion system Vgr family protein  40.48 
 
 
615 aa  209  4e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.187576  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2559  type VI secretion system Vgr family protein  40.71 
 
 
618 aa  209  5e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3949  Rhs element Vgr protein  41.14 
 
 
691 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0401  type VI secretion system Vgr family protein  39.78 
 
 
740 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0328  Rhs element Vgr protein  39.78 
 
 
740 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0648  type VI secretion system Vgr family protein  39.92 
 
 
609 aa  204  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000448  VgrG protein  41.91 
 
 
692 aa  204  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  1.07078e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0764  type VI secretion system Vgr family protein  41.77 
 
 
741 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0696  putative VgrG protein  41.77 
 
 
741 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0339  putative VgrG protein  39.54 
 
 
732 aa  203  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05870  hypothetical protein  41.08 
 
 
692 aa  202  6e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0153  Rhs element Vgr protein  43.51 
 
 
689 aa  202  8e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3533  type VI secretion system Vgr family protein  41.13 
 
 
725 aa  199  4e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2557  type VI secretion system Vgr family protein  34.92 
 
 
726 aa  197  2e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.482945  normal  0.0643046 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0053  type VI secretion system Vgr family protein  40 
 
 
617 aa  196  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0454  Rhs element Vgr protein  40.15 
 
 
671 aa  196  4e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3234  type VI secretion system Vgr family protein  36.62 
 
 
722 aa  196  5e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1155  type VI secretion system Vgr family protein  49.22 
 
 
706 aa  195  8e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0542625  normal  0.843476 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1114  type VI secretion system Vgr family protein  46.46 
 
 
713 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  35.81 
 
 
669 aa  193  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1234  Vgr family type VI secretion system  37.82 
 
 
704 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.270466 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2858  type VI secretion system Vgr family protein  36.62 
 
 
692 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.374803  normal  0.207801 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0649  type VI secretion system Vgr family protein  40.43 
 
 
633 aa  192  6e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.823903  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2439  type VI secretion system Vgr family protein  34.64 
 
 
712 aa  191  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  46.27 
 
 
771 aa  191  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.79673e-08 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2202  type VI secretion system Vgr family protein  37.09 
 
 
702 aa  190  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0264417  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2614  vgrG protein  37.1 
 
 
722 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0110775 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2371  Rhs element Vgr protein  34.73 
 
 
725 aa  190  3e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3386  vgrG protein  35.26 
 
 
725 aa  190  3e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.160309  normal  0.824381 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2117  Rhs element Vgr protein  37.1 
 
 
722 aa  190  3e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1726  Rhs element Vgr protein  39.93 
 
 
642 aa  189  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2064  type VI secretion system Vgr family protein  36.73 
 
 
702 aa  189  6e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.201838  normal  0.0713545 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3077  type VI secretion system Vgr family protein  40.07 
 
 
633 aa  189  8e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0616  type VI secretion system Vgr family protein  40.07 
 
 
633 aa  188  9e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0499415  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0243  type VI secretion system Vgr family protein  36.43 
 
 
713 aa  188  9e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4049  vgrG protein  37.13 
 
 
771 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.253476  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0587  type VI secretion system Vgr family protein  40.07 
 
 
633 aa  188  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0251  type VI secretion system Vgr family protein  36.43 
 
 
713 aa  188  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.830075 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  35.59 
 
 
668 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0245  type VI secretion system Vgr family protein  36.43 
 
 
713 aa  188  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1638  type VI secretion system Vgr family protein  37.09 
 
 
702 aa  187  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.674786  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  40.23 
 
 
646 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5597  Rhs element Vgr protein  41.76 
 
 
1118 aa  187  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50870  Rhs element Vgr protein  37.73 
 
 
668 aa  186  5e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  36.36 
 
 
668 aa  186  6e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  42.86 
 
 
794 aa  185  7e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3392  vgrG protein  47.73 
 
 
695 aa  185  8e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.92482  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  39.46 
 
 
643 aa  185  1e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  40.81 
 
 
756 aa  183  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  33.22 
 
 
714 aa  183  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  39.67 
 
 
741 aa  182  4e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  44.44 
 
 
774 aa  182  9e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>