More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3929 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3855  helicase c2  100 
 
 
665 aa  1307  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210682  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3841  helicase c2  99.85 
 
 
665 aa  1304  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478709  normal  0.0359375 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1957  helicase c2  59.71 
 
 
699 aa  719  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0276528  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4298  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  79.07 
 
 
666 aa  977  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.641288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0995  helicase c2  59.26 
 
 
681 aa  754  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900844  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1280  helicase c2  62.22 
 
 
677 aa  712  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0225088  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29270  DNA helicase, Rad3  59.5 
 
 
684 aa  724  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.318454 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17400  DNA helicase, Rad3  56.39 
 
 
765 aa  654  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0589917  normal  0.041503 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6530  putative ATP-dependent helicase  60.54 
 
 
674 aa  734  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290122  normal  0.0410108 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3929  helicase c2  100 
 
 
665 aa  1307  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0336304  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1504  helicase c2  56.32 
 
 
672 aa  651  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328202  normal  0.416282 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2167  helicase c2:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  56.28 
 
 
706 aa  647  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2205  helicase c2  63.58 
 
 
676 aa  728  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.632178  normal  0.363279 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11361  ATP-dependent helicase dinG  74.22 
 
 
664 aa  893  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00520548  normal  0.0965757 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3345  DEAD/DEAH box helicase domain protein  57.31 
 
 
694 aa  712  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127637  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2347  helicase c2  78.48 
 
 
670 aa  973  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.490547  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1812  helicase c2  51.79 
 
 
706 aa  634  1e-180  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1467  helicase c2  51.97 
 
 
690 aa  600  1e-170  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0659778  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1469  helicase c2  51.68 
 
 
685 aa  590  1e-167  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42659e-09 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23060  DNA helicase, Rad3  52.1 
 
 
692 aa  582  1e-165  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0774743 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1256  helicase c2  53.03 
 
 
696 aa  573  1e-162  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1480  helicase c2  53.4 
 
 
710 aa  567  1e-160  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.124092  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0280  helicase c2  50.51 
 
 
683 aa  566  1e-160  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0332575 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0323  helicase c2  50.9 
 
 
699 aa  559  1e-158  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000323796 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10610  DNA helicase, Rad3  50.89 
 
 
673 aa  561  1e-158  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.382167  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3824  helicase c2  52.63 
 
 
676 aa  556  1e-157  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00296278  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2435  helicase c2  52.86 
 
 
679 aa  549  1e-155  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.184328  normal  0.864461 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1563  helicase c2  50.42 
 
 
728 aa  550  1e-155  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192384  decreased coverage  0.00181092 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07310  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  51.32 
 
 
699 aa  546  1e-154  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0239  helicase c2  47.27 
 
 
664 aa  542  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1052  helicase c2  49.19 
 
 
669 aa  514  1e-144  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.325194 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1566  helicase c2  55.05 
 
 
844 aa  423  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102401  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  34.7 
 
 
674 aa  314  3e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0709  helicase c2  35.47 
 
 
650 aa  306  7e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.968194 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1106  helicase c2  31.12 
 
 
636 aa  305  2e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.243566 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0820  helicase c2  35.31 
 
 
650 aa  304  3e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2677  helicase c2  32.66 
 
 
646 aa  291  2e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.4 
 
 
930 aa  289  1e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  33.43 
 
 
639 aa  288  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1342  helicase c2  32.86 
 
 
754 aa  287  5e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1921  helicase c2  33.48 
 
 
725 aa  287  5e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.782434  normal  0.028244 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0897  helicase c2  35.93 
 
 
647 aa  285  1e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2763  helicase c2  33.94 
 
 
634 aa  285  3e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0359097  hitchhiker  0.00537714 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0532  helicase c2  37.17 
 
 
649 aa  282  1e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  33.33 
 
 
707 aa  281  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1235  helicase c2  33 
 
 
743 aa  281  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895293  normal  0.149585 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0636  helicase c2  33.8 
 
 
660 aa  281  3e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2228  helicase c2  34.98 
 
 
639 aa  281  3e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.232993  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1933  helicase c2  34.69 
 
 
639 aa  281  3e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1593  helicase c2  33.67 
 
 
725 aa  281  3e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.601772  normal  0.0255754 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1626  ATP-dependent DNA helicase-related protein  33.94 
 
 
713 aa  281  4e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0023  Rad3-related DNA helicases  33.62 
 
 
851 aa  279  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.66591e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4478  helicase c2  36.14 
 
 
633 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.647625  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2013  helicase c2  35.29 
 
 
639 aa  278  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.479282  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4323  helicase c2  35.16 
 
 
631 aa  278  3e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4459  helicase c2  35.2 
 
 
633 aa  276  6e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157065  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01374  ATP-dependent helicase  32.74 
 
 
644 aa  275  2e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  35.45 
 
 
643 aa  274  3e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004095  DinG family ATP-dependent helicase YoaA  32.13 
 
 
646 aa  274  4e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.65 
 
 
921 aa  273  5e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1380  hypothetical protein  33.74 
 
 
636 aa  273  7e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434814  normal  0.350106 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2406  hypothetical protein  33.59 
 
 
634 aa  273  9e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00282147  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2034  hypothetical protein  33.54 
 
 
636 aa  273  1e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1825  helicase c2  33.54 
 
 
636 aa  273  1e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979985  normal  0.491186 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1835  helicase c2  33.54 
 
 
636 aa  272  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00837342  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01778  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  33.54 
 
 
636 aa  273  1e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.548012  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2535  hypothetical protein  33.54 
 
 
636 aa  273  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50615  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1412  helicase c2  33.48 
 
 
658 aa  273  1e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102914  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2017  hypothetical protein  33.59 
 
 
634 aa  272  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.451998  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01766  hypothetical protein  33.54 
 
 
636 aa  273  1e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479225  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1896  hypothetical protein  33.54 
 
 
636 aa  273  1e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1575  putative ATP-dependent helicase  32.69 
 
 
646 aa  271  2e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.718112  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0911  putative ATP-dependent helicase  32.68 
 
 
651 aa  271  4e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2128  helicase c2  33.43 
 
 
634 aa  270  5e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2455  helicase c2  30.1 
 
 
641 aa  270  8e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1409  helicase c2  35.46 
 
 
651 aa  270  8e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2316  helicase c2  35.44 
 
 
670 aa  269  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2068  hypothetical protein  33.38 
 
 
636 aa  269  1e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2535  helicase C2  31.44 
 
 
645 aa  269  1e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801549  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  27.7 
 
 
957 aa  268  3e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1364  helicase c2  33.38 
 
 
640 aa  267  4e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4122  helicase c2  32.52 
 
 
843 aa  266  7e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  9.77416e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1942  helicase c2  27.21 
 
 
832 aa  265  1e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.357662  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3167  helicase c2  32.25 
 
 
876 aa  265  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000644587  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3621  helicase c2  32.38 
 
 
838 aa  265  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3886  ATP-dependent helicase  31.62 
 
 
647 aa  265  3e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  34.61 
 
 
659 aa  265  3e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3093  helicase c2  34.55 
 
 
681 aa  263  6e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.649657 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2022  hypothetical protein  32.26 
 
 
636 aa  263  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6889  normal  0.891564 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1990  helicase c2  34.76 
 
 
649 aa  263  1e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1495  hypothetical protein  32.26 
 
 
636 aa  262  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1990  ATP-dependent helicase DinG  27.07 
 
 
709 aa  262  1e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1965  hypothetical protein  32.26 
 
 
636 aa  263  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1310  hypothetical protein  32.36 
 
 
636 aa  262  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.027986  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0562  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.48 
 
 
921 aa  261  2e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1961  hypothetical protein  32.26 
 
 
636 aa  262  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.915388  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2378  helicase c2  33.49 
 
 
636 aa  262  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2302  ATP-dependent helicase, DinG family protein  31.88 
 
 
662 aa  262  2e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.783815  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2172  helicase c2  30.1 
 
 
659 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1651  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  31.35 
 
 
952 aa  261  3e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>