More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1030 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_1030  50S ribosomal protein L3  100 
 
 
217 aa  437  1e-122  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1013  50S ribosomal protein L3  100 
 
 
217 aa  437  1e-122  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1040  50S ribosomal protein L3  100 
 
 
217 aa  437  1e-122  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  94.93 
 
 
218 aa  422  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  94.04 
 
 
218 aa  410  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  88.02 
 
 
217 aa  398  1e-110  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  78.97 
 
 
218 aa  337  6e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  75 
 
 
219 aa  335  3e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  74.53 
 
 
213 aa  315  5e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  72.64 
 
 
216 aa  306  2e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4507  50S ribosomal protein L3  72.17 
 
 
221 aa  301  7e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787031  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0582  50S ribosomal protein L3  68.72 
 
 
235 aa  300  1e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1123  ribosomal protein L3  70.97 
 
 
220 aa  299  2e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  69.19 
 
 
216 aa  298  4e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  68.42 
 
 
219 aa  294  7e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  67.92 
 
 
215 aa  293  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6049  50S ribosomal protein L3  68.12 
 
 
236 aa  291  4e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.185718  normal  0.220559 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3905  50S ribosomal protein L3  67.14 
 
 
223 aa  291  4e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  64.52 
 
 
218 aa  290  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2646  50S ribosomal protein L3  66.67 
 
 
216 aa  289  2e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  65.57 
 
 
217 aa  288  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17160  50S ribosomal protein L3  65.71 
 
 
216 aa  286  1e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29740  LSU ribosomal protein L3P  65.38 
 
 
219 aa  282  2e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5124  50S ribosomal protein L3  65.24 
 
 
216 aa  282  3e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0688  ribosomal protein L3  67.14 
 
 
219 aa  281  5e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2687  50S ribosomal protein L3  64.29 
 
 
216 aa  279  3e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.740328 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23810  LSU ribosomal protein L3P  65.55 
 
 
226 aa  278  4e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  64.76 
 
 
222 aa  277  7e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2975  50S ribosomal protein L3  63.81 
 
 
216 aa  277  8e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1185  50S ribosomal protein L3  67.14 
 
 
220 aa  271  8e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2659  50S ribosomal protein L3  63.46 
 
 
219 aa  270  9e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3143  ribosomal protein L3  63.46 
 
 
220 aa  268  4e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0896196  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3923  50S ribosomal protein L3  64.25 
 
 
219 aa  266  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4315  50S ribosomal protein L3  63.77 
 
 
219 aa  266  1e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  61.9 
 
 
219 aa  265  3e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0627  ribosomal protein L3  62.5 
 
 
217 aa  264  7e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1707  50S ribosomal protein L3  60.19 
 
 
213 aa  256  2e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00287886  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0255  50S ribosomal protein L3  58.77 
 
 
216 aa  254  8e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10020  LSU ribosomal protein L3P  52.91 
 
 
206 aa  226  3e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  4.02835e-07  hitchhiker  3.18342e-09 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  53.62 
 
 
209 aa  224  7e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  2.70125e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0398  ribosomal protein L3  52.11 
 
 
213 aa  224  9e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0458  50S ribosomal protein L3P  55.56 
 
 
218 aa  223  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.310193  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0847  50S ribosomal protein L3P  52.11 
 
 
214 aa  223  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  4.79377e-07  decreased coverage  1.16579e-05 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  54.29 
 
 
209 aa  221  8e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  53.05 
 
 
212 aa  220  2e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  52.15 
 
 
210 aa  216  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0295  ribosomal protein L3  53.11 
 
 
212 aa  216  3e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  4.79422e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001742  LSU ribosomal protein L3p (L3e)  52.15 
 
 
209 aa  215  4e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  1.45621e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  54.85 
 
 
206 aa  215  4e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  2.66904e-09  hitchhiker  5.67921e-07 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  49.53 
 
 
211 aa  215  5e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  3.30884e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  50.95 
 
 
210 aa  213  1e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  9.81122e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00730  50S ribosomal protein L3  51.67 
 
 
209 aa  213  2e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  51.67 
 
 
209 aa  213  2e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.9924e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00445  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 
212 aa  212  3e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000559916  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  52.86 
 
 
209 aa  212  4e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  52.63 
 
 
214 aa  212  4e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  6.58885e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  53.55 
 
 
212 aa  211  5e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0691  50S ribosomal protein L3  50.47 
 
 
211 aa  211  6e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208666  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 
211 aa  211  6e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.94381e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  53.33 
 
 
210 aa  211  7e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  7.29954e-06 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3909  50S ribosomal protein L3  51.67 
 
 
209 aa  210  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.031884  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2460  50S ribosomal protein L3  51.64 
 
 
209 aa  210  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  53.33 
 
 
210 aa  209  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0715  ribosomal protein L3  51.92 
 
 
204 aa  209  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0405  50S ribosomal protein L3P  53.08 
 
 
214 aa  209  3e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  unclonable  3.24929e-11  normal  0.15101 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  51.9 
 
 
211 aa  208  5e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  1.51121e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0320  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 
209 aa  208  5e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0285067  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0487  50S ribosomal protein L3  51.67 
 
 
211 aa  207  7e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  8.38631e-08  normal  0.0709669 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0454  50S ribosomal protein L3  51.67 
 
 
211 aa  207  7e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00952841  unclonable  2.09689e-07 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0484  50S ribosomal protein L3  51.67 
 
 
211 aa  207  7e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000200613  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3524  ribosomal protein L3  50.72 
 
 
212 aa  207  1e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  1.5584e-06  hitchhiker  7.58128e-06 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1067  50S ribosomal protein L3  50.48 
 
 
211 aa  207  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  3.74639e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  51.9 
 
 
209 aa  207  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  3.70606e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4749  50S ribosomal protein L3  50.72 
 
 
211 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000212363  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0962  ribosomal protein L3  51.94 
 
 
206 aa  206  2e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  6.08869e-05  hitchhiker  2.69964e-11 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2559  50S ribosomal protein L3  50.98 
 
 
211 aa  206  2e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101168  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4548  50S ribosomal protein L3  50.72 
 
 
211 aa  206  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00256892  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6721  50S ribosomal protein L3  53.99 
 
 
243 aa  206  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2857  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 
210 aa  206  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  49.29 
 
 
210 aa  206  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  7.29631e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0276  50S ribosomal protein L3  49.53 
 
 
279 aa  206  3e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.948053  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0873  ribosomal protein L3  50.72 
 
 
212 aa  206  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.339067  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0405  ribosomal protein L3  50.24 
 
 
209 aa  206  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0225  ribosomal protein L3  52.11 
 
 
213 aa  206  3e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0960  50S ribosomal protein L3  52.15 
 
 
214 aa  206  3e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  6.7151e-11  hitchhiker  1.66028e-07 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2903  50S ribosomal protein L3  48.34 
 
 
212 aa  205  4e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  4.77342e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0626  ribosomal protein L3  50.24 
 
 
211 aa  205  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  1.65351e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0421  50S ribosomal protein L3P  50.72 
 
 
212 aa  205  4e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00399818  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08850  50S ribosomal protein L3  50.72 
 
 
211 aa  204  6e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  2.30335e-05  normal  0.0234155 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0837  50S ribosomal protein L3  50.72 
 
 
211 aa  204  6e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0361687  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16240  LSU ribosomal protein L3P  54.85 
 
 
206 aa  204  8e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0560879  hitchhiker  7.37829e-06 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0469  50S ribosomal protein L3  49.28 
 
 
212 aa  204  9e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  5.09154e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  47.91 
 
 
212 aa  204  9e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  2.33446e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2333  50S ribosomal protein L3  47.39 
 
 
212 aa  203  1e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  2.41734e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0323  ribosomal protein L3  49.76 
 
 
209 aa  203  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  2.22247e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3915  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 
209 aa  202  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.44377e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0584  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 
209 aa  202  3e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  1.83333e-10  normal  0.0735815 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5079  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 
211 aa  202  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  3.74535e-10  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_002950  PG1938  50S ribosomal protein L3  47.57 
 
 
205 aa  202  3e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  50.95 
 
 
209 aa  202  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.95061e-14  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>