53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0277 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0277  periplasmic binding protein  100 
 
 		 394 aa  810    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.035667  normal  0.0566476 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3086  periplasmic binding protein  48.55 
 
 		 434 aa  358  9e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.074128 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2248  periplasmic binding protein  48.85 
 
 		 434 aa  355  1e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226593  normal  0.029127 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0161  periplasmic binding protein  46.89 
 
 		 400 aa  345  6e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5372  periplasmic binding protein  40.06 
 
 		 390 aa  280  4e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1299  periplasmic binding protein  39.09 
 
 		 414 aa  261  1e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3336  periplasmic binding protein  37.81 
 
 		 389 aa  259  4e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3541  periplasmic binding protein  39.38 
 
 		 398 aa  248  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1003  periplasmic binding protein  36.44 
 
 		 405 aa  241  2e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0182612  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5230  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  37.32 
 
 		 414 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0344  periplasmic binding protein  35.21 
 
 		 437 aa  227  4e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0083  periplasmic binding protein  34.86 
 
 		 380 aa  223  6e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622653  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3498  periplasmic binding protein  36.83 
 
 		 401 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12513  periplasmic-binding protein of ABC transporter  32.86 
 
 		 378 aa  214  1.9999999999999998e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1024  putative iron complex transport system substrate-binding protein  31.3 
 
 		 397 aa  194  3e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264421  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1006  putative iron complex transport system substrate-binding protein  30.11 
 
 		 396 aa  187  3e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.568283  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0670  putative lipoprotein  31.02 
 
 		 379 aa  186  5e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.174257 
 
 
-
 
NC_002950  PG0648  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  31.27 
 
 		 391 aa  176  9e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.515203 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1296  putative iron complex transport system substrate-binding protein  30.47 
 
 		 393 aa  172  1e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.220074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0277  periplasmic binding protein  30.84 
 
 		 371 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0800726  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2110  periplasmic binding protein  28.91 
 
 		 435 aa  127  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.529465  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0118  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  27.44 
 
 		 454 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2136  periplasmic binding protein  28.57 
 
 		 442 aa  103  7e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0131  periplasmic binding protein  24.54 
 
 		 411 aa  100  5e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.400899  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1093  periplasmic binding protein  28.2 
 
 		 428 aa  98.6  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00000816511  hitchhiker  0.00387756 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1954  periplasmic binding protein  27.82 
 
 		 428 aa  97.1  5e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0336724  hitchhiker  2.0036600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1519  periplasmic binding protein  27.06 
 
 		 435 aa  94  4e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000588293 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24460  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  25.61 
 
 		 405 aa  91.7  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48322  predicted protein  24.09 
 
 		 456 aa  84.7  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0111  periplasmic binding protein  23.44 
 
 		 421 aa  82  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1256  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  25.89 
 
 		 374 aa  76.6  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0748  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  23.3 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  24.32 
 
 		 331 aa  55.5  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2146  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  30.32 
 
 		 297 aa  55.1  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.543136  normal  0.254057 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27076  predicted protein  28.35 
 
 		 505 aa  52.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000736705  hitchhiker  0.0000360443 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  25 
 
 		 334 aa  52.8  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  31.47 
 
 		 483 aa  52  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  27.07 
 
 		 384 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1180  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  23.83 
 
 		 304 aa  50.8  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000254745  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  23.92 
 
 		 335 aa  50.8  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  27.44 
 
 		 478 aa  49.7  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0844  periplasmic binding protein  23.94 
 
 		 299 aa  48.9  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0867  periplasmic binding protein  23.94 
 
 		 297 aa  48.5  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2132  periplasmic binding protein  23.98 
 
 		 299 aa  46.6  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334395 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1679  periplasmic binding protein  23.85 
 
 		 363 aa  45.8  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2367  periplasmic binding protein  24.6 
 
 		 322 aa  45.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  25.62 
 
 		 341 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0166  periplasmic binding protein  21.47 
 
 		 323 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0250  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  24.4 
 
 		 356 aa  43.9  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0491648  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0560  periplasmic binding protein  23.89 
 
 		 339 aa  43.1  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  28.03 
 
 		 682 aa  43.1  0.008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0227  periplasmic binding protein  28.67 
 
 		 682 aa  43.1  0.009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0299459  normal  0.536447 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  21.45 
 
 		 309 aa  43.1  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>