More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4622 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4622  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
299 aa  599  1e-170  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.772942 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3026  alpha/beta hydrolase fold  89.3 
 
 
299 aa  550  1e-155  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3221  alpha/beta hydrolase fold  69.79 
 
 
303 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3232  alpha/beta hydrolase fold  69.79 
 
 
303 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118412  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3283  alpha/beta hydrolase fold  69.79 
 
 
303 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.115306  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0315  alpha/beta hydrolase fold  70.85 
 
 
300 aa  428  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4592  alpha/beta hydrolase fold  70.85 
 
 
296 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1777  alpha/beta hydrolase fold  45.58 
 
 
291 aa  235  8e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0284717 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7313  Alpha/beta hydrolase fold  47.28 
 
 
303 aa  224  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2766  non-heme peroxidase  44.86 
 
 
293 aa  219  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2096  alpha/beta hydrolase fold  42.28 
 
 
290 aa  219  5e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.52093  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0994  alpha/beta hydrolase fold  44.37 
 
 
285 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131767  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4609  alpha/beta hydrolase fold  42.96 
 
 
294 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.235001  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4320  alpha/beta hydrolase fold  44.78 
 
 
312 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4090  alpha/beta hydrolase fold  44.78 
 
 
312 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0153093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4166  alpha/beta hydrolase fold  44.78 
 
 
312 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1365  alpha/beta hydrolase  42.57 
 
 
290 aa  214  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3063  alpha/beta hydrolase fold  44.76 
 
 
305 aa  212  7e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.41057  normal  0.789243 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1033  alpha/beta hydrolase fold  45.45 
 
 
280 aa  211  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  42.81 
 
 
292 aa  205  6e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5402  alpha/beta hydrolase fold  44.72 
 
 
286 aa  204  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5311  alpha/beta hydrolase fold  45.99 
 
 
285 aa  199  5e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.106317 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13510  peroxidase bpoA (non-haem peroxidase)  42.32 
 
 
289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5259  alpha/beta hydrolase fold  41.96 
 
 
288 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956924  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4507  alpha/beta hydrolase fold  43.06 
 
 
295 aa  192  8e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1862  alpha/beta hydrolase fold  41.95 
 
 
301 aa  192  8e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308971  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3907  alpha/beta hydrolase fold  44.65 
 
 
294 aa  189  4e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11146  peroxidase bpoB (non-haem peroxidase)  40.49 
 
 
302 aa  181  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.354208  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01664  hydrolase, alpha/beta fold family, putative  41.67 
 
 
272 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.178176  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4458  alpha/beta hydrolase fold  39.51 
 
 
302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7311  Alpha/beta hydrolase  39.46 
 
 
303 aa  159  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.602855  normal  0.723346 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6042  alpha/beta hydrolase fold  33.59 
 
 
298 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567915  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0865  alpha/beta hydrolase fold  32.81 
 
 
298 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5586  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 
326 aa  95.9  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5753  alpha/beta hydrolase fold  32.1 
 
 
298 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.766272  normal  0.921974 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5377  alpha/beta hydrolase fold  32.1 
 
 
298 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5466  alpha/beta hydrolase fold  32.1 
 
 
298 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0306241 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  26.69 
 
 
258 aa  90.1  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10044  hydrolase  31.23 
 
 
298 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  29.23 
 
 
408 aa  87  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1876  hypothetical protein  27.31 
 
 
300 aa  77.4  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 
289 aa  77  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  25.89 
 
 
327 aa  76.3  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3150  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
311 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1867  hypothetical protein  26.15 
 
 
300 aa  73.9  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  26.37 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  31.18 
 
 
299 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  31.18 
 
 
299 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  28.47 
 
 
285 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0541  alpha/beta hydrolase fold protein  27.67 
 
 
344 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.271487 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2497  alpha/beta hydrolase fold protein  29.67 
 
 
311 aa  71.6  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2348  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  24.31 
 
 
296 aa  69.3  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  24.65 
 
 
296 aa  69.3  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
289 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2707  Alpha/beta hydrolase fold  29.32 
 
 
264 aa  68.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  23.53 
 
 
296 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 
282 aa  68.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  24.31 
 
 
296 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1012  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 
607 aa  67  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  24.33 
 
 
253 aa  67  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1898  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 
300 aa  66.6  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.033526 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4365  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 
292 aa  65.5  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  26.41 
 
 
290 aa  65.1  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0356  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 
256 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122696  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2704  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 
309 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0111794  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2538  alpha/beta hydrolase fold  28.92 
 
 
306 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1577  putative hydrolase protein  28.16 
 
 
296 aa  64.3  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5476  alpha/beta hydrolase fold  37.07 
 
 
333 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.294136  normal  0.797092 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 
300 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.11 
 
 
277 aa  63.9  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0398174  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0254  alpha/beta hydrolase fold protein  37.14 
 
 
348 aa  63.5  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328235  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  26.52 
 
 
267 aa  63.5  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1356  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 
297 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0361  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 
290 aa  62  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0918  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 
255 aa  62  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.891406  normal  0.241554 
 
 
-
 
NC_003296  RS01917  putative hydrolase protein  28.94 
 
 
305 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.602694  normal  0.0615168 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0827  cation diffusion facilitator family transporter  22.79 
 
 
626 aa  60.8  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  26.49 
 
 
270 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2070  alpha/beta hydrolase  27.4 
 
 
299 aa  60.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2777  hypothetical protein  35.14 
 
 
206 aa  60.1  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.958453  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2243  alpha/beta hydrolase fold  26.75 
 
 
274 aa  60.1  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134722  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2402  hypothetical protein  35.14 
 
 
206 aa  60.1  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1872  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
299 aa  59.7  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0521053  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0043  alpha/beta hydrolase fold  38.94 
 
 
301 aa  60.1  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1587  alpha/beta hydrolase fold  29 
 
 
330 aa  60.1  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  26.12 
 
 
270 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2622  alpha/beta hydrolase fold  35.24 
 
 
314 aa  59.3  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.790671  normal  0.924395 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2479  alpha/beta hydrolase fold  26.6 
 
 
256 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.261597 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  26.24 
 
 
265 aa  58.9  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0821  esterase/lipase/thioesterase  26.6 
 
 
256 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  24.41 
 
 
270 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 
308 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0871  alpha/beta fold family hydrolase  21.62 
 
 
285 aa  58.5  0.0000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0195486  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1430  hypothetical protein  24.91 
 
 
295 aa  58.5  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.227801  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2831  Alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 
284 aa  57.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.871853  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2777  proline-specific peptidase  26.01 
 
 
306 aa  57.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159674  decreased coverage  0.000853285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 
294 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01088  hypothetical esterase/lipase ybfF  25.1 
 
 
230 aa  58.2  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000642463  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1396  alpha/beta hydrolase fold  25.61 
 
 
298 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>