More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2885 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2885  amidohydrolase 3  100 
 
 
569 aa  1152  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00571861  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3625  amidohydrolase 3  84.39 
 
 
556 aa  925  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433177  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3404  Amidohydrolase 3  54.2 
 
 
586 aa  592  1e-168  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  8.97209e-06  hitchhiker  1.315e-05 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0756  amidohydrolase 3  41.18 
 
 
536 aa  346  5e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398429  normal  0.248868 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0742  amidohydrolase 3  41.18 
 
 
536 aa  346  5e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838024  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0736  amidohydrolase 3  41.18 
 
 
536 aa  346  5e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656369  normal  0.367651 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10562  hypothetical protein  40.04 
 
 
537 aa  330  3e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.036236 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  30.35 
 
 
583 aa  214  4e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  32.73 
 
 
584 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4035  Amidohydrolase 3  32.8 
 
 
556 aa  209  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787006  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  32.01 
 
 
601 aa  192  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  32.9 
 
 
538 aa  189  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1985  amidohydrolase 3  31.77 
 
 
554 aa  185  2e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.98 
 
 
575 aa  184  5e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.8 
 
 
575 aa  181  3e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4359  Amidohydrolase 3  29.35 
 
 
552 aa  171  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.747715 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4766  amidohydrolase 3  31.53 
 
 
545 aa  169  9e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7627  amidohydrolase-like  30.94 
 
 
555 aa  165  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.137819 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0099  hypothetical protein  27.67 
 
 
577 aa  162  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.119429  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3250  amidohydrolase 3  30.7 
 
 
542 aa  161  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383305  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6052  amidohydrolase 3  29.8 
 
 
555 aa  160  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.863749  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0134  amidohydrolase-like  32.09 
 
 
547 aa  160  6e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.900918  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0108  Amidohydrolase 3  32.01 
 
 
547 aa  158  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134206  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1040  amidohydrolase 3  31.44 
 
 
590 aa  157  7e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.80433  normal  0.260287 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5757  amidohydrolase:amidohydrolase-like  30.96 
 
 
547 aa  157  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4036  amidohydrolase 3  27.67 
 
 
601 aa  154  4e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0100  hypothetical protein  27.77 
 
 
604 aa  153  7e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1885  Amidohydrolase 3  27.99 
 
 
587 aa  146  9e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.5166  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  31.2 
 
 
539 aa  144  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2000  twin-arginine translocation pathway signal  27.18 
 
 
638 aa  144  6e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1541  putative amidohydrolase 3  29.66 
 
 
648 aa  143  1e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.260198  normal  0.229672 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004324  metal-dependent hydrolase  28.47 
 
 
581 aa  142  1e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  30.91 
 
 
537 aa  142  2e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3889  Amidohydrolase 3  27.75 
 
 
624 aa  141  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4287  amidohydrolase 3  29.89 
 
 
544 aa  141  4e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.275898  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1124  amidohydrolase 3  30.09 
 
 
625 aa  140  4e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70056  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  29.11 
 
 
542 aa  140  8e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  26.16 
 
 
564 aa  139  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1096  Amidohydrolase 3  30.15 
 
 
525 aa  136  9e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2185  Amidohydrolase 3  25.26 
 
 
563 aa  133  9e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  29.79 
 
 
548 aa  133  1e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  28.29 
 
 
553 aa  132  1e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0420  amidohydrolase-like  26.59 
 
 
581 aa  130  8e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  25.58 
 
 
539 aa  129  1e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  24.54 
 
 
520 aa  128  2e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3462  amidohydrolase 3  30.73 
 
 
650 aa  127  7e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5666  amidohydrolase 3  27.38 
 
 
554 aa  127  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498872  normal  0.0259745 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4295  amidohydrolase 3  28.12 
 
 
557 aa  127  8e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  26.61 
 
 
569 aa  125  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2078  hypothetical protein  25.68 
 
 
576 aa  125  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  26.37 
 
 
527 aa  119  1e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0760  amidohydrolase 3  27.99 
 
 
592 aa  119  1e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  28.01 
 
 
583 aa  117  4e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  28.01 
 
 
583 aa  117  4e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  27.05 
 
 
596 aa  116  1e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2329  Amidohydrolase 3  27.39 
 
 
530 aa  116  1e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  27.69 
 
 
603 aa  115  2e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3968  amidohydrolase 3  22.57 
 
 
560 aa  114  4e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  28.11 
 
 
543 aa  114  4e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1737  Amidohydrolase 3  25.61 
 
 
618 aa  114  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.493619  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2836  amidohydrolase 3  24.78 
 
 
597 aa  113  8e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214714 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  28.42 
 
 
620 aa  112  1e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  24.65 
 
 
557 aa  112  2e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  27.12 
 
 
532 aa  112  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  6.08926e-07 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2075  putative lipoprotein  26.26 
 
 
585 aa  111  4e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.860152  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3346  amidohydrolase family  24.74 
 
 
568 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  28.35 
 
 
548 aa  110  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  27.23 
 
 
560 aa  110  5e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4231  Amidohydrolase 3  25.98 
 
 
626 aa  110  7e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  24.65 
 
 
544 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  2.98357e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  27.03 
 
 
568 aa  109  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  28.65 
 
 
543 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  25.93 
 
 
573 aa  109  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  27.61 
 
 
522 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2742  hypothetical protein  24.6 
 
 
531 aa  108  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.166091  hitchhiker  0.000567669 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  28.75 
 
 
556 aa  108  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  24.91 
 
 
543 aa  108  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  25.81 
 
 
545 aa  108  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  27.39 
 
 
583 aa  107  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  26.74 
 
 
606 aa  106  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  24.45 
 
 
543 aa  105  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1028  amidohydrolase 3  25.5 
 
 
565 aa  105  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34970  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  29.26 
 
 
541 aa  105  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134464  normal  0.645084 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  24.03 
 
 
533 aa  105  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  23.7 
 
 
522 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0654  Amidohydrolase 3  26.87 
 
 
540 aa  105  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.214598 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  26.29 
 
 
560 aa  105  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1693  hypothetical protein  25.04 
 
 
533 aa  103  9e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1072  Amidohydrolase 3  23.08 
 
 
505 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.185661  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  27.8 
 
 
569 aa  103  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  28.55 
 
 
535 aa  103  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  23.71 
 
 
522 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  24.18 
 
 
522 aa  102  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1075  exoenzymes regulatory protein aepa  27.18 
 
 
543 aa  102  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00663021  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  24.95 
 
 
549 aa  101  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  27.55 
 
 
569 aa  101  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  25.05 
 
 
546 aa  100  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  27.03 
 
 
543 aa  100  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0253  amidohydrolase 3  27.58 
 
 
551 aa  100  6e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  26.22 
 
 
552 aa  100  7e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>