More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2367 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 291 aa  583  1e-166  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  83.69 
 
 		 290 aa  485  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  69.26 
 
 		 287 aa  389  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  65.12 
 
 		 291 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  65.12 
 
 		 291 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  65.12 
 
 		 291 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  67.7 
 
 		 295 aa  364  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  47.04 
 
 		 301 aa  251  9.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  50 
 
 		 333 aa  240  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  46.08 
 
 		 350 aa  235  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  45.67 
 
 		 361 aa  234  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  48.78 
 
 		 298 aa  231  9e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  46.64 
 
 		 340 aa  226  3e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  47.64 
 
 		 309 aa  226  4e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  44.01 
 
 		 314 aa  225  6e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  44.44 
 
 		 340 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  44.44 
 
 		 340 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  45.36 
 
 		 340 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  45.58 
 
 		 340 aa  222  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  45.02 
 
 		 350 aa  221  8e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  43.62 
 
 		 341 aa  218  1e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  44.33 
 
 		 322 aa  199  3.9999999999999996e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  34.81 
 
 		 296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  32.98 
 
 		 308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  32.16 
 
 		 284 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  25.44 
 
 		 281 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 		 340 aa  119  9e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  30.45 
 
 		 340 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.05 
 
 		 372 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  29.58 
 
 		 275 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  31.37 
 
 		 278 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  30.39 
 
 		 339 aa  112  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1023  alpha/beta hydrolase fold  30.51 
 
 		 284 aa  112  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  31.27 
 
 		 283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  30.5 
 
 		 315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 		 287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  29.14 
 
 		 287 aa  109  5e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  29.49 
 
 		 276 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 316 aa  108  8.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  28.29 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  26.64 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  26.39 
 
 		 300 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 		 276 aa  106  5e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  28.95 
 
 		 345 aa  105  6e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  33.92 
 
 		 290 aa  105  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  28.79 
 
 		 263 aa  105  7e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  26.3 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2104  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 300 aa  103  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000418183  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3237  alpha/beta hydrolase fold protein  27.92 
 
 		 284 aa  102  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  27.92 
 
 		 313 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  26.3 
 
 		 300 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  26.04 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  26.64 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  26.3 
 
 		 300 aa  101  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  26.04 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 		 339 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.48 
 
 		 369 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1079  alpha/beta hydrolase fold  29.82 
 
 		 283 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.622662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  26.6 
 
 		 286 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2792  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  25.61 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.27 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 		 270 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  26.84 
 
 		 297 aa  99.8  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 		 299 aa  99.4  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 		 329 aa  99  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  28.18 
 
 		 270 aa  99  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  30 
 
 		 302 aa  98.6  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  27.69 
 
 		 309 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 312 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  27.17 
 
 		 313 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  30.66 
 
 		 304 aa  97.4  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 		 270 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  30.6 
 
 		 284 aa  96.7  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 		 286 aa  96.7  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 		 316 aa  96.3  5e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 288 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3083  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 		 292 aa  95.9  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000632175  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2696  alpha/beta hydrolase fold protein  31.52 
 
 		 268 aa  95.9  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094894  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2918  alpha/beta hydrolase fold protein  31.82 
 
 		 310 aa  96.3  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000917268  normal  0.0712608 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 		 278 aa  95.9  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.03 
 
 		 372 aa  95.9  8e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0656  alpha/beta hydrolase fold protein  28.14 
 
 		 258 aa  95.5  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  27.94 
 
 		 266 aa  95.5  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  29.09 
 
 		 271 aa  95.1  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  27.49 
 
 		 270 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 284 aa  95.5  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  28.21 
 
 		 264 aa  94.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  26.51 
 
 		 504 aa  94.4  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0273  alpha/beta fold family hydrolase  25.65 
 
 		 258 aa  94  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000365907  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  26.96 
 
 		 267 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4748  alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 		 295 aa  93.6  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.97 
 
 		 370 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  29.47 
 
 		 283 aa  93.2  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  29.47 
 
 		 283 aa  93.2  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0475  alpha/beta hydrolase fold protein  32.04 
 
 		 290 aa  92.8  6e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  27.51 
 
 		 323 aa  92.8  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2284  2-hydroxy-6-oxohepta-24-dienoate hydrolase  28.67 
 
 		 303 aa  92.4  7e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.29683  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>