More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2913 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2913  major facilitator transporter  100 
 
 
454 aa  888    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  38.36 
 
 
451 aa  296  4e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  38.63 
 
 
454 aa  290  3e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  37.47 
 
 
451 aa  287  2.9999999999999996e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1331  major facilitator transporter  39.86 
 
 
451 aa  280  4e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107576  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  35.14 
 
 
441 aa  277  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  39.95 
 
 
453 aa  276  6e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2523  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  36.64 
 
 
461 aa  276  6e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.108392 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2369  4-hydroxybenzoate transporter  37.5 
 
 
452 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.708273  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2418  4-hydroxybenzoate transporter  37.5 
 
 
452 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364564  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  36.42 
 
 
475 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3271  transporter, major facilitator family  36.18 
 
 
452 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.557085 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2325  4-hydroxybenzoate transporter  37.5 
 
 
452 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4217  major facilitator transporter  39.49 
 
 
453 aa  274  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4149  major facilitator transporter  39.49 
 
 
453 aa  274  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0152976  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2414  4-hydroxybenzoate transporter  37.5 
 
 
452 aa  273  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2434  major facilitator transporter  35.96 
 
 
452 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0149  major facilitator superfamily transporter  41.1 
 
 
441 aa  272  7e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2304  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  36.93 
 
 
452 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  36.16 
 
 
449 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  36.3 
 
 
453 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4243  major facilitator transporter  40 
 
 
455 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.104244  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1885  major facilitator transporter  38.39 
 
 
453 aa  270  4e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  37.33 
 
 
447 aa  270  5e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  36.4 
 
 
450 aa  268  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  36.18 
 
 
453 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  35.83 
 
 
452 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  35.83 
 
 
452 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1396  4-hydroxybenzoate transporter  36.94 
 
 
579 aa  266  5e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  35.6 
 
 
453 aa  266  7e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  36.85 
 
 
451 aa  266  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  36.85 
 
 
451 aa  266  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  36.76 
 
 
455 aa  266  7e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  36.85 
 
 
451 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  36.85 
 
 
451 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  36.85 
 
 
451 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  36.85 
 
 
451 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  37.05 
 
 
452 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  36.85 
 
 
451 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  35.96 
 
 
453 aa  263  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5283  major facilitator transporter  36.16 
 
 
452 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.595477  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  36.85 
 
 
449 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4260  putative hydroxybenzoate transporter  35.06 
 
 
461 aa  262  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6976  major facilitator transporter  36.38 
 
 
453 aa  261  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2526  4-hydroxybenzoate transporter  37.72 
 
 
452 aa  261  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  33.99 
 
 
452 aa  260  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3124  major facilitator transporter  35.59 
 
 
452 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  37.56 
 
 
454 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6469  benzoate transport  36.2 
 
 
460 aa  259  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  38 
 
 
468 aa  258  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4472  major facilitator transporter  35.14 
 
 
452 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5751  major facilitator transporter  35.14 
 
 
452 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.126582 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5108  major facilitator transporter  35.14 
 
 
452 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0051  4-hydroxybenzoate transporter  37.09 
 
 
452 aa  256  7e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3163  major facilitator transporter  34.71 
 
 
452 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1137  major facilitator transporter  39.21 
 
 
457 aa  253  6e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1029  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  34.29 
 
 
452 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000542182  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7571  major facilitator transporter  36.45 
 
 
450 aa  252  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749151  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5022  major facilitator transporter  34.47 
 
 
452 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4438  major facilitator transporter  37.9 
 
 
453 aa  251  3e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456474  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0913  general substrate transporter  34.61 
 
 
465 aa  250  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  35.99 
 
 
449 aa  249  8e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6034  major facilitator transporter  33.65 
 
 
458 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  33.79 
 
 
448 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6221  major facilitator transporter  33.49 
 
 
467 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8635  major facilitator superfamily MFS_1  39.75 
 
 
458 aa  243  5e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0703703  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6623  major facilitator transporter  33.49 
 
 
467 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6390  major facilitator transporter  33.49 
 
 
467 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.536228  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  33.79 
 
 
448 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2690  major facilitator transporter  35.63 
 
 
455 aa  242  9e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3901  major facilitator superfamily 4- hydroxybenzoate transporter  34.39 
 
 
454 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.112817 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2696  MFS superfamily protocatechuate transporter  36.05 
 
 
458 aa  241  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309624  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1266  benzoate transport  34.55 
 
 
448 aa  241  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6628  major facilitator transporter  35.09 
 
 
460 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.990266 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6226  major facilitator transporter  34.29 
 
 
460 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6395  major facilitator transporter  35.09 
 
 
460 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01667  4-hydroxybenzoate transporter  36.71 
 
 
458 aa  240  4e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  34.73 
 
 
457 aa  240  5e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4438  benzoate transport  34.01 
 
 
448 aa  239  8e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  36.39 
 
 
449 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3941  major facilitator transporter  35.46 
 
 
449 aa  237  4e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.939508 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0779  major facilitator superfamily MFS_1  35.49 
 
 
454 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0733  major facilitator transporter  34.26 
 
 
454 aa  236  6e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6105  major facilitator transporter  33.18 
 
 
465 aa  236  7e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.84268 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  32.71 
 
 
438 aa  235  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1368  major facilitator superfamily MFS_1  33.88 
 
 
439 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00531865  normal  0.175653 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2512  major facilitator transporter  31.57 
 
 
452 aa  234  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.851571  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5312  major facilitator superfamily MFS_1  32.82 
 
 
458 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1488  4-hydroxybenzoate transporter  37.75 
 
 
451 aa  233  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1205  4-hydroxybenzoate transporter  37.75 
 
 
451 aa  233  5e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0050  4-hydroxybenzoate transporter  37.75 
 
 
451 aa  233  5e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  35.61 
 
 
455 aa  233  5e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0061  4-hydroxybenzoate transporter  37.75 
 
 
451 aa  233  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.586422  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  33.56 
 
 
454 aa  233  6e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02900  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  35.35 
 
 
448 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00278203 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1432  major facilitator superfamily MFS_1  33.64 
 
 
439 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.528546  normal  0.24074 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2095  major facilitator superfamily MFS_1  32.09 
 
 
447 aa  231  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4450  major facilitator transporter  35.49 
 
 
460 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.489654  normal  0.0331479 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1016  benzoate transport  33.64 
 
 
447 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0402464  hitchhiker  0.0000294981 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  32.96 
 
 
459 aa  231  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.201063 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>