More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0512 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0512  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 
154 aa  310  4e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.318275 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0527  Lytic transglycosylase catalytic  93.71 
 
 
155 aa  273  6e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.193488 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3565  Lytic transglycosylase catalytic  64.49 
 
 
158 aa  185  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2959  lytic transglycosylase catalytic  60.17 
 
 
280 aa  139  1e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  48.06 
 
 
202 aa  114  5e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  52.17 
 
 
206 aa  112  2e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  49.6 
 
 
247 aa  111  4e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2727  lytic transglycosylase, catalytic  54.31 
 
 
192 aa  109  1e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.742597  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  47.73 
 
 
244 aa  109  2e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  46.36 
 
 
191 aa  108  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  50 
 
 
202 aa  108  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  45.74 
 
 
442 aa  108  4e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2210  lytic transglycosylase, catalytic  53.57 
 
 
218 aa  107  7e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  55.05 
 
 
325 aa  106  9e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0443  lytic transglycosylase, catalytic  57.01 
 
 
218 aa  106  9e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.270121  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  46.83 
 
 
242 aa  106  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  47.93 
 
 
226 aa  106  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  49.56 
 
 
218 aa  106  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  39.86 
 
 
283 aa  105  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  45.05 
 
 
174 aa  105  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9819  type IV system transglycosylase  42.86 
 
 
362 aa  105  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  52.54 
 
 
278 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  50.79 
 
 
281 aa  105  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  53.04 
 
 
199 aa  105  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  50.91 
 
 
291 aa  105  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  46.77 
 
 
285 aa  104  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  49.59 
 
 
260 aa  104  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  44.8 
 
 
204 aa  103  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  47.46 
 
 
207 aa  103  7e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6881  Lytic transglycosylase catalytic  50.88 
 
 
271 aa  103  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987079  normal  0.0912273 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 
318 aa  103  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  46.72 
 
 
370 aa  103  7e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6404  lytic transglycosylase catalytic  45.67 
 
 
362 aa  103  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0649822  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1919  Lytic transglycosylase catalytic  43.65 
 
 
199 aa  103  8e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1794  putative lytic transglycosylase  46.4 
 
 
204 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.391793  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0440  lytic transglycosylase, catalytic  46.4 
 
 
204 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  48.18 
 
 
211 aa  103  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  40.74 
 
 
202 aa  102  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0452  lytic transglycosylase, catalytic  45.6 
 
 
204 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0428943 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  44.8 
 
 
204 aa  102  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  45.45 
 
 
280 aa  102  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  7.67564e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  47.01 
 
 
196 aa  102  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  49.09 
 
 
438 aa  101  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2827  Lytic transglycosylase catalytic  46.96 
 
 
263 aa  101  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0748  lytic transglycosylase, catalytic  45.3 
 
 
146 aa  100  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00376609  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2520  lytic transglycosylase, catalytic  47.15 
 
 
280 aa  100  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22403  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  51.89 
 
 
200 aa  100  6e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  44.35 
 
 
296 aa  100  7e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  44.35 
 
 
296 aa  100  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3807  lytic transglycosylase, catalytic  49.54 
 
 
215 aa  100  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  41.22 
 
 
203 aa  100  9e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  5.18233e-15  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  44.26 
 
 
249 aa  99.4  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  49.22 
 
 
327 aa  100  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  45.38 
 
 
216 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4176  lytic transglycosylase, catalytic  44.88 
 
 
354 aa  99  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500833  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  40.28 
 
 
198 aa  98.2  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  4.27479e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4758  transglycosylase SLT domain-containing protein  47.66 
 
 
217 aa  97.8  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1332  Lytic transglycosylase catalytic  47.32 
 
 
194 aa  97.8  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0695277  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  44.72 
 
 
261 aa  98.2  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  45.45 
 
 
239 aa  97.8  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  45.53 
 
 
243 aa  97.8  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4205  Lytic transglycosylase catalytic  45.08 
 
 
251 aa  97.4  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  45.08 
 
 
251 aa  97.4  6e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3607  lytic transglycosylase, catalytic  45.38 
 
 
326 aa  97.4  6e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  45.38 
 
 
204 aa  97.4  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  45.45 
 
 
239 aa  97.4  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  45.45 
 
 
239 aa  97.4  6e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  46.28 
 
 
239 aa  97.1  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  46.83 
 
 
245 aa  97.4  7e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  45.05 
 
 
189 aa  97.1  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  45.08 
 
 
251 aa  97.1  8e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  42.74 
 
 
222 aa  97.1  8e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1424  lytic transglycosylase, catalytic  47.27 
 
 
191 aa  96.7  9e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0284128  normal  0.0259883 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3860  lytic transglycosylase, catalytic  46.15 
 
 
329 aa  96.7  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  38.51 
 
 
201 aa  96.3  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  50.45 
 
 
217 aa  96.7  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2008  transglycosylase SLT domain-containing protein  46.03 
 
 
214 aa  95.9  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  42.02 
 
 
233 aa  95.5  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3973  lytic transglycosylase catalytic  50.48 
 
 
204 aa  95.5  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  47.06 
 
 
208 aa  95.9  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  47.75 
 
 
206 aa  94.7  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  45.9 
 
 
245 aa  95.5  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2342  lytic transglycosylase, catalytic  48.31 
 
 
272 aa  95.5  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0393  lytic transglycosylase, catalytic  42.5 
 
 
305 aa  94.7  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.168274  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  48.11 
 
 
368 aa  94.7  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3638  lytic transglycosylase catalytic  50.48 
 
 
206 aa  94.7  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.237 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3427  Lytic transglycosylase catalytic  45.53 
 
 
295 aa  94.7  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0352  lytic transglycosylase  41.67 
 
 
273 aa  94.4  5e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  45.11 
 
 
215 aa  94  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  7.7507e-05  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  42.96 
 
 
197 aa  94  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  44.35 
 
 
235 aa  93.6  8e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  43.65 
 
 
212 aa  93.6  9e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5084  lytic transglycosylase catalytic  46.83 
 
 
290 aa  93.2  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0436378  normal  0.0244706 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0367  lytic transglycosylase, catalytic  36.81 
 
 
215 aa  92.8  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4561  lytic transglycosylase catalytic  45.67 
 
 
360 aa  93.6  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.000593543  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  43.36 
 
 
261 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  42.48 
 
 
261 aa  92  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  2.81259e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  43.36 
 
 
259 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  5.72163e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  36.84 
 
 
197 aa  92  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  44.35 
 
 
208 aa  91.7  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>