More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0438 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0438  lysine biosynthesis enzyme LysX  100 
 
 		 281 aa  576  1.0000000000000001e-163  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00025755 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2724  lysine biosynthesis enzyme LysX  90.68 
 
 		 281 aa  519  1e-146  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1151  lysine biosynthesis enzyme LysX  62.59 
 
 		 292 aa  341  7e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.492268  normal  0.326079 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3597  lysine biosynthesis enzyme LysX  54.42 
 
 		 283 aa  321  9.999999999999999e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.109467 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3306  lysine biosynthesis enzyme LysX  54.84 
 
 		 287 aa  306  3e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0316  lysine biosynthesis enzyme LysX  52.5 
 
 		 282 aa  300  2e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1059  lysine biosynthesis enzyme LysX  52.67 
 
 		 282 aa  296  3e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.411939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3469  lysine biosynthesis enzyme LysX  51.59 
 
 		 285 aa  293  1e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0318  lysine biosynthesis enzyme LysX  49.64 
 
 		 288 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2616  lysine biosynthesis enzyme LysX  44.4 
 
 		 294 aa  247  1e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0328  lysine biosynthesis enzyme LysX  42.86 
 
 		 294 aa  245  6e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0444  lysine biosynthesis enzyme LysX  47.46 
 
 		 272 aa  244  8e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0001654  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1761  lysine biosynthesis enzyme LysX  42.49 
 
 		 296 aa  243  3e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1502  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  42.5 
 
 		 291 aa  243  3e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0772  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  39.39 
 
 		 312 aa  232  6e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.788078 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6289  lysine biosynthesis enzyme LysX  44.8 
 
 		 293 aa  227  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1295  lysine biosynthesis enzyme LysX  42.5 
 
 		 280 aa  223  3e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00562119 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1288  lysine biosynthesis enzyme LysX  36.69 
 
 		 285 aa  195  7e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0210035 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1137  lysine biosynthesis enzyme LysX  36.23 
 
 		 283 aa  185  8e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0237722  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  39.19 
 
 		 282 aa  179  4e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  39.11 
 
 		 283 aa  177  1e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0168  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  35.04 
 
 		 283 aa  176  3e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000151287  normal  0.111818 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  37.96 
 
 		 267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  36.63 
 
 		 302 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1991  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  30.8 
 
 		 281 aa  163  3e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.317152  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1704  lysine biosynthesis enzyme LysX  31.52 
 
 		 282 aa  159  5e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3971  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1298  lysine biosynthesis enzyme LysX  36.3 
 
 		 271 aa  158  8e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.18194  normal  0.20368 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1118  alpha-L-glutamate ligase  41.26 
 
 		 292 aa  136  4e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.36995  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1729  alpha-L-glutamate ligase  35.45 
 
 		 292 aa  126  5e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0182  alpha-L-glutamate ligase  35 
 
 		 292 aa  123  4e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0874  SSU ribosomal protein S6P modification protein  35.45 
 
 		 292 aa  123  4e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205884  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0564  alpha-L-glutamate ligase  30.43 
 
 		 293 aa  122  5e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.194605  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0136  alpha-L-glutamate ligase  32.16 
 
 		 265 aa  116  3e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0680474 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3203  SSU ribosomal protein S6P modification protein  36.95 
 
 		 329 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398244  normal  0.0345991 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1185  alpha-L-glutamate ligase  32.27 
 
 		 265 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1580  alpha-L-glutamate ligase  36.32 
 
 		 292 aa  112  6e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0145  alpha-L-glutamate ligase  32 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.563722  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  32.62 
 
 		 324 aa  109  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0692  SSU ribosomal protein S6P modification protein  35.24 
 
 		 296 aa  109  6e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.136634  hitchhiker  0.0000298511 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0158  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  34.78 
 
 		 295 aa  104  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.314526  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2302  alpha-L-glutamate ligase  33.17 
 
 		 292 aa  104  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0136928 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1276  SSU ribosomal protein S6P modification protein  32.8 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2754  alpha-L-glutamate ligase  31.76 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0894554  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0721  alpha-L-glutamate ligase  28.91 
 
 		 292 aa  103  4e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.609176 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68660  ribosomal protein S6 modification protein  32.77 
 
 		 301 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5941  ribosomal protein S6 modification protein  32.77 
 
 		 301 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2610  SSU ribosomal protein S6P modification protein  38.69 
 
 		 306 aa  101  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360533  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  32.87 
 
 		 300 aa  99.8  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05140  ribosomal protein S6 modification enzyme RimK  32.55 
 
 		 301 aa  97.8  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0948  ribosomal protein S6 modification protein  33.8 
 
 		 300 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1009  ribosomal protein S6 modification protein  33.8 
 
 		 300 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0980  ribosomal protein S6 modification protein  33.8 
 
 		 300 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0524519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1028  ribosomal protein S6 modification protein  33.8 
 
 		 300 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.275544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0619  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33.18 
 
 		 302 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.875829  normal  0.913535 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0912  ribosomal protein S6 modification protein  33.8 
 
 		 300 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0481  hypothetical protein  29.82 
 
 		 302 aa  96.7  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0457  hypothetical protein  29.82 
 
 		 302 aa  96.7  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1687  S6 modification enzyme RimK  31.02 
 
 		 310 aa  96.7  4e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2074  alpha-L-glutamate ligase  32 
 
 		 292 aa  96.3  5e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0604  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  32.72 
 
 		 302 aa  96.3  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1871  ribosomal protein S6 modification protein  31.94 
 
 		 301 aa  96.3  6e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1297  alpha-L-glutamate ligase  26.91 
 
 		 266 aa  95.5  9e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.276689 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0363  SSU ribosomal protein S6P modification protein  32.37 
 
 		 301 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1643  alpha-L-glutamate ligase  33.33 
 
 		 300 aa  95.1  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2289  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.94 
 
 		 300 aa  95.1  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1549  S6 modification enzyme RimK  32.26 
 
 		 301 aa  95.1  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0924  ribosomal protein S6 modification protein  32.41 
 
 		 300 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1299  ribosomal protein S6 modification protein  31.48 
 
 		 301 aa  94.7  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.186898  normal  0.0117357 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1956  ribosomal protein S6 modification protein  31.8 
 
 		 303 aa  95.1  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0386  ribosomal protein S6 modification protein  29.88 
 
 		 301 aa  94.4  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.786331  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1808  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  27.27 
 
 		 269 aa  94.7  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3661  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.94 
 
 		 301 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3081  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  32.43 
 
 		 317 aa  94.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2039  SSU ribosomal protein S6P modification protein  31.8 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.014544 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1791  ribosomal protein S6 modification protein  29.88 
 
 		 301 aa  94.4  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1944  alpha-L-glutamate ligase  28.47 
 
 		 292 aa  94  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0760  ribosomal protein S6 modification protein  33.18 
 
 		 301 aa  94.7  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00088888  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2143  alpha-L-glutamate ligase  30.83 
 
 		 301 aa  93.6  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000119851  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1690  ribosomal protein S6 modification protein  31.02 
 
 		 303 aa  93.6  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1366  ribosomal protein S6 modification protein  32.87 
 
 		 300 aa  93.6  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00857  ribosomal protein S6 modification protein  31.94 
 
 		 300 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2790  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.94 
 
 		 300 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2391  alpha-L-glutamate ligase  30.43 
 
 		 301 aa  93.2  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000134298  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2480  ribosomal protein S6 modification protein  31.94 
 
 		 300 aa  93.2  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1967  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.43 
 
 		 301 aa  93.2  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000256532  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0955  ribosomal protein S6 modification protein  31.94 
 
 		 300 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1006  ribosomal protein S6 modification protein  31.94 
 
 		 300 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.195269 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2744  ribosomal protein S6 modification protein  31.94 
 
 		 300 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.155924 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2380  alpha-L-glutamate ligase  30.43 
 
 		 301 aa  93.2  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000191941  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00863  hypothetical protein  31.94 
 
 		 300 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2496  alpha-L-glutamate ligase  30.43 
 
 		 301 aa  93.2  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000126065  normal  0.0109329 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2353  alpha-L-glutamate ligase  33.18 
 
 		 301 aa  93.2  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000863949  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2270  ribosomal protein S6 modification protein  30.83 
 
 		 299 aa  92.8  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2364  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  34.83 
 
 		 267 aa  92.8  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1745  SSU ribosomal protein S6P modification protein  30.83 
 
 		 299 aa  92  9e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000225359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1825  SSU ribosomal protein S6P modification protein  30.83 
 
 		 299 aa  92  9e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000123784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0879  ribosomal protein S6 modification protein  31.94 
 
 		 300 aa  92  9e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2274  SSU ribosomal protein S6P modification protein  30.83 
 
 		 299 aa  92  9e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000086692  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0234  ribosomal protein S6 modification protein  29.64 
 
 		 301 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23180  SSU ribosomal protein S6P modification protein  30.56 
 
 		 411 aa  91.7  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>