More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0014 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0014  ammonium transporter  100 
 
 
455 aa  885    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.138738 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0114  ammonium transporter  72.41 
 
 
453 aa  619  1e-176  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00188634  normal  0.233192 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2529  ammonium transporter  65.22 
 
 
454 aa  512  1e-144  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.537146  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0899  ammonium transporter  54.5 
 
 
436 aa  415  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  53.37 
 
 
434 aa  399  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2054  ammonium transporter  52.66 
 
 
431 aa  394  1e-108  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  49.88 
 
 
451 aa  383  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  52.46 
 
 
462 aa  381  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  50.91 
 
 
467 aa  379  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  49.41 
 
 
457 aa  381  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  47.37 
 
 
461 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2068  ammonium transporter  49.51 
 
 
406 aa  362  5.0000000000000005e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000438744  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  48.9 
 
 
449 aa  362  6e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3995  ammonium transporter  47.72 
 
 
445 aa  355  6.999999999999999e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1686  ammonium transporter  47.03 
 
 
402 aa  354  2e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.531823  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  46.94 
 
 
464 aa  350  2e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  49.88 
 
 
463 aa  350  3e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1270  ammonium transporter  51.06 
 
 
461 aa  350  4e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  48.02 
 
 
444 aa  348  8e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  47.28 
 
 
405 aa  348  9e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  47.61 
 
 
501 aa  348  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0659  ammonium transporter  47.27 
 
 
439 aa  347  2e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2342  ammonium transporter  49.53 
 
 
455 aa  346  4e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.602093 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2956  ammonium transporter  50 
 
 
470 aa  346  6e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.328394  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2468  ammonium transporter  48.17 
 
 
470 aa  345  1e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  46.89 
 
 
429 aa  343  5e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  46.12 
 
 
515 aa  343  5e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  46.89 
 
 
500 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  46.89 
 
 
500 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  46.89 
 
 
500 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  46.89 
 
 
500 aa  339  5e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  45.65 
 
 
515 aa  339  7e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0294  ammonium transporter  47.33 
 
 
436 aa  338  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  46.38 
 
 
410 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  46.59 
 
 
410 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  46.41 
 
 
469 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  46.83 
 
 
410 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  46.65 
 
 
438 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  46.65 
 
 
438 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0778  ammonium transporter  45.52 
 
 
466 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  46.54 
 
 
504 aa  336  5e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  46.89 
 
 
502 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2464  ammonium transporter  50.23 
 
 
456 aa  335  7e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_943  ammonium transporter  48.65 
 
 
408 aa  335  7e-91  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3728  ammonium transporter  46.54 
 
 
437 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1125  ammonium transporter  48.4 
 
 
408 aa  335  1e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335009  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  46.59 
 
 
410 aa  335  1e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  46.59 
 
 
410 aa  335  1e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  45.41 
 
 
410 aa  335  1e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  46.49 
 
 
434 aa  335  1e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0807  ammonium transporter  45.58 
 
 
466 aa  335  1e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1566  ammonium transporter  45.33 
 
 
432 aa  335  1e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436096  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  45.93 
 
 
466 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0706  ammonium transporter  46.54 
 
 
437 aa  334  2e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  46.59 
 
 
410 aa  334  2e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  45.93 
 
 
444 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  45.93 
 
 
466 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  45.93 
 
 
478 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3605  ammonium transporter  46.78 
 
 
437 aa  334  2e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  45.93 
 
 
500 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1952  ammonium transporter  48.29 
 
 
411 aa  334  2e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3160  ammonium transporter  45.58 
 
 
466 aa  334  2e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  45.93 
 
 
500 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  45.93 
 
 
466 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  46.34 
 
 
410 aa  333  4e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3537  ammonium transporter  46.3 
 
 
437 aa  332  6e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.945825  decreased coverage  0.00000925998 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  46.41 
 
 
499 aa  333  6e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2376  ammonium transporter  51.82 
 
 
456 aa  332  7.000000000000001e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0302487  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1491  ammonium transporter  49.77 
 
 
456 aa  332  7.000000000000001e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.936264  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  45.65 
 
 
411 aa  332  1e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  45.06 
 
 
432 aa  332  1e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0954  ammonium transporter  48.29 
 
 
408 aa  331  2e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1303  ammonium transporter  48.19 
 
 
459 aa  331  2e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0541  ammonium transporter  45.67 
 
 
462 aa  330  3e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  44.24 
 
 
488 aa  330  3e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1490  ammonium transporter  47.27 
 
 
472 aa  330  4e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0776  ammonium transporter  45.45 
 
 
431 aa  329  6e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446987  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  46.68 
 
 
405 aa  329  7e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  46.1 
 
 
431 aa  329  8e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0221  ammonium transporter  45.66 
 
 
446 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1831  ammonium transporter  48.89 
 
 
402 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  46.83 
 
 
435 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  43.79 
 
 
494 aa  327  3e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04231  hypothetical protein  45.54 
 
 
449 aa  327  3e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.152204  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0531  ammonia permease  46.45 
 
 
411 aa  327  3e-88  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000144186  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  45.6 
 
 
436 aa  327  4.0000000000000003e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23800  ammonium transporter  45.73 
 
 
441 aa  325  7e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0789552  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0276  ammonium transporter  44.88 
 
 
443 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0849  ammonium transporter  46.65 
 
 
474 aa  325  1e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0084  ammonium transporter  45.52 
 
 
402 aa  325  1e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  46.77 
 
 
507 aa  325  1e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  44.6 
 
 
489 aa  324  2e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0158  ammonium transporter  50.61 
 
 
397 aa  323  3e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  46.19 
 
 
496 aa  323  5e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0866  ammonium transporter  49.01 
 
 
402 aa  322  7e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.366572 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2311  ammonium transporter  49.01 
 
 
401 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.191525  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2782  ammonium transporter  46.54 
 
 
503 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0900246  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2920  ammonium transporter  46.54 
 
 
497 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617737  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1699  ammonia permease  47.28 
 
 
413 aa  322  9.999999999999999e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000279978  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  43.76 
 
 
485 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>