More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1704 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  42.21 
 
 
871 aa  661    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  42.02 
 
 
863 aa  709    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  43.26 
 
 
823 aa  655    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  45.33 
 
 
858 aa  767    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  46.05 
 
 
871 aa  775    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1626  DNA mismatch repair protein MutS  39.46 
 
 
857 aa  639    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.25405 
 
 
-
 
NC_002950  PG0095  DNA mismatch repair protein MutS  39.11 
 
 
891 aa  658    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0480084 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  46 
 
 
868 aa  807    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  40.77 
 
 
873 aa  714    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  42.14 
 
 
854 aa  642    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  40.72 
 
 
856 aa  652    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  40.91 
 
 
872 aa  696    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  42.3 
 
 
892 aa  707    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4137  DNA mismatch repair protein MutS  39.8 
 
 
872 aa  639    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757749  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  44.33 
 
 
881 aa  751    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  39.95 
 
 
855 aa  643    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3114  DNA mismatch repair protein MutS  40.43 
 
 
855 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0090493 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4058  DNA mismatch repair protein MutS  39.8 
 
 
855 aa  643    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  42.72 
 
 
892 aa  710    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  42.81 
 
 
890 aa  711    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  42.62 
 
 
894 aa  711    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4050  DNA mismatch repair protein MutS  39.91 
 
 
857 aa  645    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.593835  hitchhiker  0.000000000609956 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4152  DNA mismatch repair protein MutS  39.46 
 
 
857 aa  640    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.121513 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3098  DNA mismatch repair protein MutS  40.55 
 
 
855 aa  638    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603568  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1376  DNA mismatch repair protein MutS  39.86 
 
 
859 aa  644    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  47.44 
 
 
867 aa  825    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  40.91 
 
 
872 aa  696    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  40.27 
 
 
859 aa  657    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  52.9 
 
 
872 aa  917    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  66.22 
 
 
900 aa  1218    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2107  DNA mismatch repair protein MutS  42.29 
 
 
882 aa  638    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0317076 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1169  DNA mismatch repair protein MutS  49.37 
 
 
864 aa  805    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.29255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  42.41 
 
 
854 aa  670    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  45.05 
 
 
882 aa  725    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  40.5 
 
 
863 aa  643    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1134  DNA mismatch repair protein MutS  39.64 
 
 
860 aa  637    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3030  DNA mismatch repair protein MutS  40.55 
 
 
855 aa  638    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  45.72 
 
 
870 aa  794    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3059  DNA mismatch repair protein MutS  40.43 
 
 
855 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.725135 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  41.52 
 
 
854 aa  640    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  41.52 
 
 
873 aa  660    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1753  DNA mismatch repair protein MutS  42.18 
 
 
837 aa  676    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.581518  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  47.03 
 
 
872 aa  783    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  40.75 
 
 
904 aa  658    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  40.27 
 
 
871 aa  659    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  42.72 
 
 
892 aa  710    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  43.4 
 
 
895 aa  733    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2247  DNA mismatch repair protein MutS  43.16 
 
 
882 aa  677    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0873729  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  40.5 
 
 
856 aa  650    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  40.09 
 
 
855 aa  635    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  46.73 
 
 
863 aa  749    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  41.24 
 
 
875 aa  658    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  42.57 
 
 
878 aa  671    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  40.11 
 
 
856 aa  641    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  50.9 
 
 
892 aa  876    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  44.73 
 
 
870 aa  733    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1216  DNA mismatch repair protein MutS  50.39 
 
 
903 aa  834    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0405457 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  41.22 
 
 
872 aa  652    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  40.39 
 
 
871 aa  657    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  41.72 
 
 
887 aa  662    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  46.61 
 
 
869 aa  816    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1519  DNA mismatch repair protein MutS  41.49 
 
 
854 aa  637    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00861946  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  40.72 
 
 
856 aa  652    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000830859 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1723  DNA mismatch repair protein MutS  40.75 
 
 
855 aa  676    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  43.18 
 
 
853 aa  737    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03081  DNA mismatch repair protein(MutS)  40.64 
 
 
863 aa  659    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 
887 aa  1825    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  44.77 
 
 
858 aa  746    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  40.11 
 
 
859 aa  647    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  42.41 
 
 
890 aa  709    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  40.34 
 
 
861 aa  646    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  40.72 
 
 
856 aa  652    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  42.48 
 
 
928 aa  734    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  43.33 
 
 
882 aa  728    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3218  DNA mismatch repair protein MutS  40.55 
 
 
855 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.864156  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3816  DNA mismatch repair protein MutS  42.72 
 
 
892 aa  708    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  42.68 
 
 
881 aa  702    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  48.3 
 
 
870 aa  850    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  40.11 
 
 
859 aa  646    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  48.24 
 
 
932 aa  795    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0147  DNA mismatch repair protein MutS  42.35 
 
 
856 aa  703    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.692226  normal  0.372979 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  43.07 
 
 
910 aa  742    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  43.14 
 
 
910 aa  736    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0005  DNA mismatch repair protein MutS  39.07 
 
 
856 aa  638    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3645  DNA mismatch repair protein MutS  42.54 
 
 
901 aa  667    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.473403 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  40.36 
 
 
861 aa  642    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  40.25 
 
 
861 aa  640    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0632  DNA mismatch repair protein MutS  39.29 
 
 
855 aa  635    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0530533  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  39.77 
 
 
861 aa  650    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  44.78 
 
 
859 aa  766    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  42.18 
 
 
872 aa  682    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1179  DNA mismatch repair protein MutS  39.34 
 
 
880 aa  636    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.809456 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  39.95 
 
 
855 aa  644    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  44.57 
 
 
872 aa  730    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  41.36 
 
 
857 aa  683    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1576  DNA mismatch repair protein MutS  42.09 
 
 
854 aa  682    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0068  DNA mismatch repair protein MutS  39.05 
 
 
852 aa  642    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  46.28 
 
 
872 aa  778    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  47.46 
 
 
857 aa  818    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  42.76 
 
 
889 aa  723    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>