More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2125 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  100 
 
 		 398 aa  819    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  70.85 
 
 		 396 aa  580  1e-164  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  67.62 
 
 		 399 aa  557  1e-157  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  65.9 
 
 		 396 aa  554  1e-156  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  67.63 
 
 		 384 aa  546  1e-154  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  66.08 
 
 		 398 aa  546  1e-154  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  67.37 
 
 		 384 aa  543  1e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  64.69 
 
 		 398 aa  535  1e-151  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  64.69 
 
 		 398 aa  535  1e-151  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  65.36 
 
 		 404 aa  529  1e-149  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  62.94 
 
 		 394 aa  526  1e-148  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  63.71 
 
 		 393 aa  518  1e-146  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  61.83 
 
 		 394 aa  513  1e-144  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  61.54 
 
 		 390 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  58.78 
 
 		 398 aa  488  1e-137  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  58.82 
 
 		 393 aa  487  1e-136  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  58.9 
 
 		 392 aa  486  1e-136  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  59.14 
 
 		 414 aa  483  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  59.48 
 
 		 402 aa  473  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  56.92 
 
 		 392 aa  473  1e-132  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  60.16 
 
 		 398 aa  474  1e-132  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  57.59 
 
 		 396 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  56.2 
 
 		 400 aa  449  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  57.66 
 
 		 394 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  58.06 
 
 		 409 aa  443  1e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  58.87 
 
 		 392 aa  439  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  54.9 
 
 		 388 aa  435  1e-121  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  54.19 
 
 		 382 aa  432  1e-120  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  55.76 
 
 		 382 aa  434  1e-120  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  53.77 
 
 		 403 aa  429  1e-119  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  56.63 
 
 		 395 aa  426  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  52.84 
 
 		 389 aa  419  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  54.43 
 
 		 388 aa  420  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  52.09 
 
 		 383 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  51.39 
 
 		 396 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  52.11 
 
 		 389 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  51.57 
 
 		 383 aa  403  1e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  52.37 
 
 		 404 aa  404  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  54.15 
 
 		 417 aa  404  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  52.79 
 
 		 379 aa  404  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  52.39 
 
 		 394 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  51.04 
 
 		 400 aa  394  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  50.92 
 
 		 400 aa  392  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  50 
 
 		 407 aa  394  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  50.26 
 
 		 391 aa  393  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  51.58 
 
 		 401 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  50.78 
 
 		 399 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  51.17 
 
 		 400 aa  394  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  51.58 
 
 		 401 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  49.49 
 
 		 404 aa  390  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  52.16 
 
 		 394 aa  388  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  51.97 
 
 		 398 aa  389  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  50.26 
 
 		 391 aa  387  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  50.79 
 
 		 400 aa  386  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  50 
 
 		 389 aa  386  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  51.31 
 
 		 384 aa  385  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  48.18 
 
 		 393 aa  385  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  49.74 
 
 		 388 aa  383  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  48.96 
 
 		 402 aa  382  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  51.73 
 
 		 381 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  51.32 
 
 		 401 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  49.74 
 
 		 389 aa  382  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  49.87 
 
 		 386 aa  380  1e-104  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1344  aminotransferase class V  48.59 
 
 		 406 aa  379  1e-104  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  50.13 
 
 		 400 aa  378  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3062  cysteine desulfurase IscS  50.9 
 
 		 403 aa  380  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.635367  unclonable  0.000000859331 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  48.95 
 
 		 402 aa  378  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  48.18 
 
 		 391 aa  376  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1297  aminotransferase class V  48.05 
 
 		 403 aa  373  1e-102  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.216598  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0872  cysteine desulfurase  51.86 
 
 		 380 aa  373  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0149083 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3581  cysteine desulfurase NifS  49.74 
 
 		 404 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157563  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  50.66 
 
 		 381 aa  369  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4292  aminotransferase, class V  50.4 
 
 		 381 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000991667  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  50.4 
 
 		 381 aa  369  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  50.93 
 
 		 381 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4626  aminotransferase, class V  50.4 
 
 		 381 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  50.4 
 
 		 381 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  50.66 
 
 		 381 aa  370  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  47.91 
 
 		 380 aa  368  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  50.13 
 
 		 381 aa  366  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2317  cysteine desulfurase  48.59 
 
 		 404 aa  365  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.459864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0907  aminotransferase, class V  50.27 
 
 		 383 aa  365  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000245321  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  47.41 
 
 		 402 aa  364  2e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  44.91 
 
 		 388 aa  363  4e-99  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  49.6 
 
 		 380 aa  363  4e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  49.07 
 
 		 381 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4517  aminotransferase, class V  49.34 
 
 		 381 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0024603  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1225  cysteine desulfurase NifS  47.27 
 
 		 397 aa  361  1e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000944956 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  48.45 
 
 		 403 aa  361  1e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1493  cysteine desulfurase IscS  48.84 
 
 		 419 aa  361  1e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0673  cysteine desulfurase IscS  47.55 
 
 		 407 aa  361  1e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  48.06 
 
 		 407 aa  360  2e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0822  cysteine desulfurase IscS  47.55 
 
 		 421 aa  360  2e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.02372  normal  0.880264 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5089  cysteine desulfurase NifS  47.61 
 
 		 410 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0469  cysteine desulfurase IscS  48.84 
 
 		 419 aa  360  3e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00221025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  48.81 
 
 		 381 aa  360  3e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1776  cysteine desulfurase  48.33 
 
 		 404 aa  359  4e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.743071  hitchhiker  0.0000439392 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0688  cysteine desulfurase NifS  47.94 
 
 		 388 aa  359  5e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0297222  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  48.19 
 
 		 405 aa  359  5e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  47.04 
 
 		 386 aa  359  6e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>