More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0413 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1480  N-6 DNA methylase  58.91 
 
 		 777 aa  670    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0604  type I restriction-modification system, M subunit; N-6 adenine-specific DNA methylase  63.87 
 
 		 655 aa  861    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1155  N-6 DNA methylase  78.78 
 
 		 659 aa  1108    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1016  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  47.65 
 
 		 680 aa  650    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1328  N-6 DNA methylase  50.57 
 
 		 806 aa  740    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.909053  normal  0.133174 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2687  N-6 DNA methylase  78.42 
 
 		 661 aa  1072    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.965628  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2608  N-6 DNA methylase  57.66 
 
 		 683 aa  776    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.648611  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0795  N-6 DNA methylase  50.15 
 
 		 673 aa  667    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364287 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1550  N-6 DNA methylase  50.9 
 
 		 673 aa  678    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.677514 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0075  N-6 DNA methylase  78.78 
 
 		 658 aa  1092    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0234  N-6 DNA methylase  96.52 
 
 		 661 aa  1325    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0413  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 661 aa  1373    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.190573  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1060  type I restriction-modification  51.44 
 
 		 675 aa  632  1e-180  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000030221  normal  0.0378969 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0960  N-6 DNA methylase  48.1 
 
 		 670 aa  632  1e-180  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3984  N-6 DNA methylase  46.75 
 
 		 676 aa  634  1e-180  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  0.0238771 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3935  N-6 DNA methylase  46.75 
 
 		 676 aa  634  1e-180  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1495  N-6 DNA methylase  48.82 
 
 		 661 aa  628  1e-178  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.304059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4253  N-6 DNA methylase  45.3 
 
 		 708 aa  622  1e-177  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196682  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0751  N-6 DNA methylase  48.45 
 
 		 686 aa  617  1e-175  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.309292 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  46.46 
 
 		 663 aa  616  1e-175  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0684916  normal  0.490543 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4760  type I restriction-modification system DNA methylase  46.21 
 
 		 659 aa  596  1e-169  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.362482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2680  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  45.59 
 
 		 676 aa  595  1e-168  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.558636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2604  N-6 DNA methylase  43.37 
 
 		 728 aa  592  1e-167  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.205723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0488  N-6 DNA methylase  61.3 
 
 		 580 aa  590  1e-167  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19026 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1792  N-6 DNA methylase  42.01 
 
 		 725 aa  572  1.0000000000000001e-162  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0174866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2868  type I restriction-modification system DNA methylase  46.04 
 
 		 675 aa  571  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0465984  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1857  N-6 DNA methylase  55.19 
 
 		 611 aa  561  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.618647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4454  N-6 DNA methylase  44.1 
 
 		 675 aa  547  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3359  N-6 DNA methylase  41.36 
 
 		 709 aa  542  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.270263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4916  N-6 DNA methylase  55.31 
 
 		 607 aa  540  9.999999999999999e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.660274 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22800  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  41.6 
 
 		 644 aa  523  1e-147  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.386245 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19060  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  51.88 
 
 		 586 aa  506  9.999999999999999e-143  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0947092 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0192  N-6 DNA methylase  47.11 
 
 		 583 aa  469  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341004 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4473  N-6 DNA methylase  40.27 
 
 		 677 aa  466  9.999999999999999e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1025 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0276  N-6 DNA methylase  47.47 
 
 		 569 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2941  restriction/modification methyltransferase  35.96 
 
 		 783 aa  450  1e-125  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6258  N-6 DNA methylase  35.42 
 
 		 787 aa  437  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1367  putative DNA methylase HsdM  34.72 
 
 		 793 aa  432  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1861  type I restriction-modification system specificity subunit  37.1 
 
 		 710 aa  429  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1517  N-6 DNA methylase  36.02 
 
 		 691 aa  431  1e-119  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.140297 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0776  type I restriction-modification system, M subunit  36.5 
 
 		 636 aa  416  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0115537  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0641  N-6 DNA methylase  45.68 
 
 		 587 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0263  N-6 DNA methylase  45.47 
 
 		 589 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1782  N-6 DNA methylase  33.37 
 
 		 829 aa  414  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.368234 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3442  N-6 DNA methylase  44.07 
 
 		 592 aa  405  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  0.982345 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3570  N-6 DNA methylase  38.27 
 
 		 647 aa  402  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0657  N-6 DNA methylase  35.1 
 
 		 725 aa  395  1e-108  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003234  type I restriction-modification system DNA-methyltransferase subunit M  32.82 
 
 		 794 aa  387  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2227  N-6 DNA methylase  51.06 
 
 		 371 aa  385  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2201  N-6 DNA methylase  41.44 
 
 		 778 aa  374  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0841  hypothetical protein  41.17 
 
 		 608 aa  373  1e-102  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0027333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2177  N-6 DNA methylase  40.49 
 
 		 793 aa  372  1e-102  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0278  type I restriction-modification system, M subunit  41.32 
 
 		 790 aa  366  1e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2269  type I restriction-modification system DNA methylase  41.35 
 
 		 763 aa  363  5.0000000000000005e-99  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1222  N-6 DNA methylase  44.39 
 
 		 552 aa  334  3e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0768  N-6 DNA methylase  38.46 
 
 		 799 aa  326  9e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2256  N-6 DNA methylase  45.94 
 
 		 316 aa  272  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0633793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1365  N-6 DNA methylase  31.83 
 
 		 697 aa  224  4e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518057  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  30.59 
 
 		 633 aa  197  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  29.57 
 
 		 574 aa  188  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  29.36 
 
 		 574 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  29.21 
 
 		 587 aa  178  3e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3989  N-6 DNA methylase  40.07 
 
 		 356 aa  177  6e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  28.11 
 
 		 574 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  33.01 
 
 		 585 aa  169  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  25.54 
 
 		 495 aa  169  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  27.65 
 
 		 815 aa  164  5.0000000000000005e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  27.41 
 
 		 814 aa  164  6e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  28.8 
 
 		 822 aa  162  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  27.27 
 
 		 505 aa  161  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  26.42 
 
 		 498 aa  160  6e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  28.21 
 
 		 523 aa  157  4e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  28.21 
 
 		 508 aa  157  5.0000000000000005e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  29.16 
 
 		 504 aa  157  7e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  26.99 
 
 		 496 aa  156  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  26.58 
 
 		 499 aa  154  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  26.86 
 
 		 499 aa  153  8e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  27.96 
 
 		 505 aa  152  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3984  N-6 DNA methylase  26.34 
 
 		 505 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0849  N-6 DNA methylase  27.31 
 
 		 492 aa  147  9e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4820  N-6 DNA methylase  26.9 
 
 		 496 aa  147  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0103  N-6 DNA methylase  25.15 
 
 		 493 aa  146  1e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2925  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  26.97 
 
 		 708 aa  144  5e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3427  type I restriction-modification system methylation subunit-like  26.27 
 
 		 504 aa  143  9e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  26.01 
 
 		 498 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  0.0000000000157011 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0614  type I restriction-modification system, M subunit  25.53 
 
 		 494 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0763672  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3154  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  26.26 
 
 		 508 aa  140  4.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1672  N-6 DNA methylase  26.16 
 
 		 516 aa  140  7e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.179457  hitchhiker  0.001187 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0563  type I restriction-modification system, M subunit  27.2 
 
 		 908 aa  140  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170311  hitchhiker  0.0000000000000803096 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  26.39 
 
 		 808 aa  140  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  26.09 
 
 		 500 aa  138  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0036  type I restriction enzyme  24.95 
 
 		 510 aa  138  4e-31  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.27058  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2258  type I restriction-modification system, M subunit  25.73 
 
 		 891 aa  137  4e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0606  type I restriction-modification system subunit M  22.47 
 
 		 523 aa  136  9.999999999999999e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3609  N-6 DNA methylase  26.13 
 
 		 508 aa  136  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  23.39 
 
 		 503 aa  135  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0990  type I restriction-modification system, M subunit  26.76 
 
 		 501 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.555022  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  25.24 
 
 		 510 aa  135  3e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4014  N-6 DNA methylase  27.12 
 
 		 816 aa  135  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7556  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  25.42 
 
 		 544 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>