More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0657 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1861  type I restriction-modification system specificity subunit  48.89 
 
 		 710 aa  666    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0657  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 725 aa  1479    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2201  N-6 DNA methylase  45.01 
 
 		 778 aa  645    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3570  N-6 DNA methylase  47.38 
 
 		 647 aa  640    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0841  hypothetical protein  58.66 
 
 		 608 aa  597  1e-169  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0027333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4473  N-6 DNA methylase  46.61 
 
 		 677 aa  572  1.0000000000000001e-162  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1025 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2177  N-6 DNA methylase  52.19 
 
 		 793 aa  546  1e-154  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2941  restriction/modification methyltransferase  41.75 
 
 		 783 aa  548  1e-154  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0278  type I restriction-modification system, M subunit  54.67 
 
 		 790 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1222  N-6 DNA methylase  61.8 
 
 		 552 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2269  type I restriction-modification system DNA methylase  52.12 
 
 		 763 aa  520  1e-146  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003234  type I restriction-modification system DNA-methyltransferase subunit M  40.27 
 
 		 794 aa  505  1e-141  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1782  N-6 DNA methylase  39.46 
 
 		 829 aa  498  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.368234 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1367  putative DNA methylase HsdM  40 
 
 		 793 aa  485  1e-135  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6258  N-6 DNA methylase  49.27 
 
 		 787 aa  478  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1016  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  39.55 
 
 		 680 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0776  type I restriction-modification system, M subunit  41.17 
 
 		 636 aa  464  1e-129  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0115537  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3984  N-6 DNA methylase  38.52 
 
 		 676 aa  452  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  0.0238771 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3935  N-6 DNA methylase  38.6 
 
 		 676 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0795  N-6 DNA methylase  40.48 
 
 		 673 aa  451  1e-125  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364287 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1155  N-6 DNA methylase  36.87 
 
 		 659 aa  415  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4253  N-6 DNA methylase  36.9 
 
 		 708 aa  410  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196682  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0234  N-6 DNA methylase  35.76 
 
 		 661 aa  402  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0413  N-6 DNA methylase  35.1 
 
 		 661 aa  402  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.190573  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0604  type I restriction-modification system, M subunit; N-6 adenine-specific DNA methylase  34.99 
 
 		 655 aa  395  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1792  N-6 DNA methylase  33.55 
 
 		 725 aa  395  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0174866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2604  N-6 DNA methylase  34.15 
 
 		 728 aa  389  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.205723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0960  N-6 DNA methylase  34.1 
 
 		 670 aa  392  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0075  N-6 DNA methylase  34.46 
 
 		 658 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1550  N-6 DNA methylase  35.23 
 
 		 673 aa  388  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.677514 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0488  N-6 DNA methylase  39.77 
 
 		 580 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19026 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2680  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  34.02 
 
 		 676 aa  381  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.558636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  33.05 
 
 		 663 aa  381  1e-104  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0684916  normal  0.490543 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2687  N-6 DNA methylase  34.48 
 
 		 661 aa  375  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.965628  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1060  type I restriction-modification  39.63 
 
 		 675 aa  374  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000030221  normal  0.0378969 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3442  N-6 DNA methylase  42.58 
 
 		 592 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  0.982345 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0751  N-6 DNA methylase  33.81 
 
 		 686 aa  372  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.309292 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3359  N-6 DNA methylase  32.48 
 
 		 709 aa  371  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.270263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2608  N-6 DNA methylase  35.02 
 
 		 683 aa  370  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.648611  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1495  N-6 DNA methylase  33.78 
 
 		 661 aa  367  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.304059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0276  N-6 DNA methylase  40.16 
 
 		 569 aa  365  2e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1857  N-6 DNA methylase  35.83 
 
 		 611 aa  362  1e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.618647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1328  N-6 DNA methylase  33.04 
 
 		 806 aa  360  5e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.909053  normal  0.133174 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4760  type I restriction-modification system DNA methylase  33.75 
 
 		 659 aa  350  4e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.362482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0192  N-6 DNA methylase  35.8 
 
 		 583 aa  349  1e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341004 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22800  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  32.74 
 
 		 644 aa  348  2e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.386245 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0641  N-6 DNA methylase  38.33 
 
 		 587 aa  346  7e-94  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0263  N-6 DNA methylase  39.06 
 
 		 589 aa  346  1e-93  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19060  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  38.42 
 
 		 586 aa  345  2e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0947092 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1480  N-6 DNA methylase  32.1 
 
 		 777 aa  342  2e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2868  type I restriction-modification system DNA methylase  30.25 
 
 		 675 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0465984  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4454  N-6 DNA methylase  30.34 
 
 		 675 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1517  N-6 DNA methylase  31.83 
 
 		 691 aa  322  9.999999999999999e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.140297 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4916  N-6 DNA methylase  37.38 
 
 		 607 aa  304  5.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.660274 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0768  N-6 DNA methylase  34.88 
 
 		 799 aa  283  6.000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2227  N-6 DNA methylase  38.56 
 
 		 371 aa  233  8.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1213  type I restriction-modification system specificity subunit  54.26 
 
 		 196 aa  213  7e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2256  N-6 DNA methylase  36.07 
 
 		 316 aa  188  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0633793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1365  N-6 DNA methylase  30.71 
 
 		 697 aa  184  6e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518057  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  30.03 
 
 		 496 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  26.25 
 
 		 587 aa  116  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  26.27 
 
 		 498 aa  114  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  23.84 
 
 		 510 aa  112  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  27.73 
 
 		 574 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1089  N-6 DNA methylase  25.52 
 
 		 527 aa  111  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  29.69 
 
 		 505 aa  110  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  24.78 
 
 		 822 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2210  N-6 DNA methylase  25.79 
 
 		 522 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  25.36 
 
 		 522 aa  109  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2273  N-6 DNA methylase  25.42 
 
 		 522 aa  108  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.443565  hitchhiker  0.00000125043 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1159  N-6 DNA methylase  24.62 
 
 		 516 aa  107  9e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000301602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  24.52 
 
 		 633 aa  107  9e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  25.45 
 
 		 574 aa  107  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0036  type I restriction enzyme  28.62 
 
 		 510 aa  106  2e-21  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.27058  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0964  N-6 DNA methylase  24.84 
 
 		 520 aa  105  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.311438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0826  type I restriction-modification system, M subunit  24.84 
 
 		 520 aa  105  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.580356  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  28.16 
 
 		 523 aa  105  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  28.16 
 
 		 508 aa  105  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1672  N-6 DNA methylase  25.87 
 
 		 516 aa  104  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.179457  hitchhiker  0.001187 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  25.6 
 
 		 574 aa  104  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0697  N-6 DNA methylase  26.79 
 
 		 530 aa  104  7e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1594  N-6 DNA methylase  26.79 
 
 		 530 aa  104  7e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.153041  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1896  N-6 DNA methylase  25.96 
 
 		 511 aa  103  8e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.836046  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  29.62 
 
 		 500 aa  103  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0286  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  24.12 
 
 		 497 aa  103  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7556  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  26.21 
 
 		 544 aa  103  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1644  N-6 DNA methylase  23.28 
 
 		 498 aa  103  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  29.07 
 
 		 498 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  0.0000000000157011 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4262  type I restriction-modification system, M subunit  26.1 
 
 		 527 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1177  XRE family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 519 aa  102  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.602323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3108  N-6 DNA methylase  28.88 
 
 		 610 aa  100  7e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  25.83 
 
 		 585 aa  100  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3989  N-6 DNA methylase  41.32 
 
 		 356 aa  99.8  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3536  type I restriction-modification system, M subunit  27.93 
 
 		 863 aa  99.8  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0405  type I restriction-modification system, M subunit  27.89 
 
 		 799 aa  99  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3427  type I restriction-modification system methylation subunit-like  26.13 
 
 		 504 aa  99  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2691  N-6 DNA methylase  24.38 
 
 		 523 aa  99  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4162  type I restriction-modification system, M subunit  28.17 
 
 		 874 aa  98.2  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.235487 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3758  N-6 DNA methylase  23.4 
 
 		 511 aa  98.2  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.921564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  23.92 
 
 		 503 aa  97.4  8e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>