More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2201 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0278  type I restriction-modification system, M subunit  62.34 
 
 		 790 aa  949    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1861  type I restriction-modification system specificity subunit  60.67 
 
 		 710 aa  904    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2177  N-6 DNA methylase  58.7 
 
 		 793 aa  921    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1367  putative DNA methylase HsdM  46.3 
 
 		 793 aa  664    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2941  restriction/modification methyltransferase  46.15 
 
 		 783 aa  651    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3570  N-6 DNA methylase  76.52 
 
 		 647 aa  798    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4473  N-6 DNA methylase  47.94 
 
 		 677 aa  640    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1025 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2201  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 778 aa  1607    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003234  type I restriction-modification system DNA-methyltransferase subunit M  46.26 
 
 		 794 aa  669    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0841  hypothetical protein  63.42 
 
 		 608 aa  652    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0027333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2269  type I restriction-modification system DNA methylase  58.87 
 
 		 763 aa  895    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6258  N-6 DNA methylase  46.15 
 
 		 787 aa  634  1e-180  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1782  N-6 DNA methylase  45.32 
 
 		 829 aa  630  1e-179  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.368234 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0657  N-6 DNA methylase  45.01 
 
 		 725 aa  630  1e-179  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1222  N-6 DNA methylase  63.86 
 
 		 552 aa  595  1e-168  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1016  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  40.39 
 
 		 680 aa  503  1e-141  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1328  N-6 DNA methylase  37.41 
 
 		 806 aa  497  1e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.909053  normal  0.133174 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3984  N-6 DNA methylase  39.18 
 
 		 676 aa  488  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  0.0238771 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3935  N-6 DNA methylase  38.89 
 
 		 676 aa  485  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0776  type I restriction-modification system, M subunit  47.77 
 
 		 636 aa  473  1e-132  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0115537  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4253  N-6 DNA methylase  37.98 
 
 		 708 aa  467  9.999999999999999e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196682  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1480  N-6 DNA methylase  37.06 
 
 		 777 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0751  N-6 DNA methylase  38.02 
 
 		 686 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.309292 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1155  N-6 DNA methylase  36.98 
 
 		 659 aa  444  1e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0795  N-6 DNA methylase  45.42 
 
 		 673 aa  430  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364287 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0413  N-6 DNA methylase  35.77 
 
 		 661 aa  420  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.190573  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1792  N-6 DNA methylase  34.91 
 
 		 725 aa  419  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0174866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2604  N-6 DNA methylase  35.25 
 
 		 728 aa  415  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.205723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0276  N-6 DNA methylase  44.78 
 
 		 569 aa  415  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1550  N-6 DNA methylase  37.1 
 
 		 673 aa  409  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.677514 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3359  N-6 DNA methylase  34.13 
 
 		 709 aa  399  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.270263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1060  type I restriction-modification  44.47 
 
 		 675 aa  393  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000030221  normal  0.0378969 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0488  N-6 DNA methylase  43.92 
 
 		 580 aa  389  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19026 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0075  N-6 DNA methylase  41.1 
 
 		 658 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0234  N-6 DNA methylase  42.25 
 
 		 661 aa  381  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1857  N-6 DNA methylase  41.07 
 
 		 611 aa  378  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.618647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0604  type I restriction-modification system, M subunit; N-6 adenine-specific DNA methylase  43.51 
 
 		 655 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2687  N-6 DNA methylase  38.3 
 
 		 661 aa  372  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.965628  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19060  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  41.96 
 
 		 586 aa  367  1e-100  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0947092 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0960  N-6 DNA methylase  38.64 
 
 		 670 aa  367  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0192  N-6 DNA methylase  42.21 
 
 		 583 aa  363  5.0000000000000005e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341004 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0263  N-6 DNA methylase  40.98 
 
 		 589 aa  361  3e-98  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0641  N-6 DNA methylase  41.49 
 
 		 587 aa  360  5e-98  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3442  N-6 DNA methylase  40.04 
 
 		 592 aa  359  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  0.982345 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2608  N-6 DNA methylase  40.41 
 
 		 683 aa  359  9.999999999999999e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.648611  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4916  N-6 DNA methylase  39.81 
 
 		 607 aa  353  5e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.660274 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2680  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  38.93 
 
 		 676 aa  348  3e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.558636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  37.37 
 
 		 663 aa  342  2e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0684916  normal  0.490543 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1495  N-6 DNA methylase  36.58 
 
 		 661 aa  329  1.0000000000000001e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.304059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22800  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  36.56 
 
 		 644 aa  318  3e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.386245 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4760  type I restriction-modification system DNA methylase  37.45 
 
 		 659 aa  311  2e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.362482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1213  type I restriction-modification system specificity subunit  76.06 
 
 		 196 aa  300  7e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4454  N-6 DNA methylase  36.61 
 
 		 675 aa  294  3e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2868  type I restriction-modification system DNA methylase  36.05 
 
 		 675 aa  290  7e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0465984  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1517  N-6 DNA methylase  34.07 
 
 		 691 aa  270  5.9999999999999995e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.140297 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0768  N-6 DNA methylase  34.69 
 
 		 799 aa  268  2.9999999999999995e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2227  N-6 DNA methylase  37.32 
 
 		 371 aa  221  5e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2256  N-6 DNA methylase  38.54 
 
 		 316 aa  198  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0633793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1365  N-6 DNA methylase  36.02 
 
 		 697 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518057  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  27.6 
 
 		 587 aa  142  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  28.11 
 
 		 822 aa  142  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  27.7 
 
 		 505 aa  139  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  27.77 
 
 		 574 aa  138  5e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  27.53 
 
 		 574 aa  134  9e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  26.51 
 
 		 574 aa  131  6e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0286  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  25.49 
 
 		 497 aa  127  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  27.48 
 
 		 522 aa  127  6e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1644  N-6 DNA methylase  28.21 
 
 		 498 aa  125  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1089  N-6 DNA methylase  27.09 
 
 		 527 aa  124  6e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  31.56 
 
 		 585 aa  124  8e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  26.56 
 
 		 510 aa  123  9.999999999999999e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  31.55 
 
 		 496 aa  124  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  27.16 
 
 		 808 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0405  type I restriction-modification system, M subunit  28.64 
 
 		 799 aa  121  4.9999999999999996e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1159  N-6 DNA methylase  27.64 
 
 		 516 aa  121  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000301602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0964  N-6 DNA methylase  28.79 
 
 		 520 aa  120  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.311438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0826  type I restriction-modification system, M subunit  28.79 
 
 		 520 aa  120  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.580356  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0466  type I restriction-modification system, M subunit  30.12 
 
 		 518 aa  119  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0454  type I restriction-modification system, M subunit  30.12 
 
 		 518 aa  119  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1895  type I restriction-modification system, M subunit  29.68 
 
 		 518 aa  119  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.646372  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1860  type I restriction-modification system, M subunit  29.68 
 
 		 518 aa  119  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.876278  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  26.26 
 
 		 633 aa  118  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0990  type I restriction-modification system, M subunit  26.6 
 
 		 501 aa  119  3e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.555022  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3154  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  26.83 
 
 		 508 aa  117  6e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  30.16 
 
 		 495 aa  117  8.999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2472  type I restriction-modification system, M subunit  25.2 
 
 		 518 aa  116  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0275864  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  29.55 
 
 		 815 aa  115  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  29.72 
 
 		 498 aa  115  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0877  putative type I restriction-modification system, M subunit  24.5 
 
 		 529 aa  114  6e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1412  type I restriction-modification system, M subunit  25.61 
 
 		 517 aa  113  1.0000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.446719  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  30.19 
 
 		 504 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2509  site-specific DNA-methyltransferase  28.46 
 
 		 540 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.642426 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0019  N-6 DNA methylase  26.04 
 
 		 501 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00151011 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4014  N-6 DNA methylase  25.58 
 
 		 816 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2789  N-6 DNA methylase  25 
 
 		 532 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2691  N-6 DNA methylase  25.79 
 
 		 523 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05613  type I restriction-modification system specificity subunit  27.84 
 
 		 873 aa  113  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1858  N-6 DNA methylase  28.62 
 
 		 540 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0942  Type I restriction-modification system M subunit  25 
 
 		 495 aa  112  3e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4043  N-6 DNA methylase  25.56 
 
 		 824 aa  112  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>