More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2604 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_4253  N-6 DNA methylase  53.59 
 
 
708 aa  764    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196682  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1016  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  49.38 
 
 
680 aa  672    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2604  N-6 DNA methylase  100 
 
 
728 aa  1503    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.205723  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0795  N-6 DNA methylase  49.52 
 
 
673 aa  682    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00364287 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1792  N-6 DNA methylase  86.54 
 
 
725 aa  1302    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0174866  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2680  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  46.59 
 
 
676 aa  626  1e-178  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.558636  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0960  N-6 DNA methylase  46.36 
 
 
670 aa  624  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3935  N-6 DNA methylase  45.22 
 
 
676 aa  612  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3984  N-6 DNA methylase  45.08 
 
 
676 aa  610  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  0.0238771 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1155  N-6 DNA methylase  44.97 
 
 
659 aa  605  1.0000000000000001e-171  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0413  N-6 DNA methylase  43.37 
 
 
661 aa  593  1e-168  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.190573  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1550  N-6 DNA methylase  44.67 
 
 
673 aa  589  1e-167  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.677514 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0234  N-6 DNA methylase  43.64 
 
 
661 aa  592  1e-167  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2687  N-6 DNA methylase  43.9 
 
 
661 aa  587  1e-166  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.965628  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0075  N-6 DNA methylase  42.93 
 
 
658 aa  587  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  43.59 
 
 
663 aa  566  1e-160  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0684916  normal  0.490543 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1495  N-6 DNA methylase  43.75 
 
 
661 aa  563  1.0000000000000001e-159  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.304059  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0751  N-6 DNA methylase  44.02 
 
 
686 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.309292 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0604  type I restriction-modification system, M subunit; N-6 adenine-specific DNA methylase  43.29 
 
 
655 aa  559  1e-158  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3359  N-6 DNA methylase  42.61 
 
 
709 aa  556  1e-157  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.270263  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1328  N-6 DNA methylase  39.19 
 
 
806 aa  549  1e-155  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.909053  normal  0.133174 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1480  N-6 DNA methylase  40.35 
 
 
777 aa  547  1e-154  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22800  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  41.42 
 
 
644 aa  535  1e-150  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.386245 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2608  N-6 DNA methylase  41.58 
 
 
683 aa  532  1e-149  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.648611  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0488  N-6 DNA methylase  50.99 
 
 
580 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.19026 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1857  N-6 DNA methylase  49.14 
 
 
611 aa  495  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.618647  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1060  type I restriction-modification  48.51 
 
 
675 aa  493  9.999999999999999e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000030221  normal  0.0378969 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4916  N-6 DNA methylase  48.63 
 
 
607 aa  483  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.660274 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4760  type I restriction-modification system DNA methylase  37.5 
 
 
659 aa  462  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.362482  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4473  N-6 DNA methylase  39.4 
 
 
677 aa  459  9.999999999999999e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.1025 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0276  N-6 DNA methylase  46.18 
 
 
569 aa  455  1.0000000000000001e-126  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2941  restriction/modification methyltransferase  34.94 
 
 
783 aa  450  1e-125  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6258  N-6 DNA methylase  35.73 
 
 
787 aa  446  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0192  N-6 DNA methylase  44.42 
 
 
583 aa  439  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341004 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4454  N-6 DNA methylase  36.24 
 
 
675 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195788  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2868  type I restriction-modification system DNA methylase  36.46 
 
 
675 aa  432  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0465984  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003234  type I restriction-modification system DNA-methyltransferase subunit M  36.62 
 
 
794 aa  422  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2201  N-6 DNA methylase  35.41 
 
 
778 aa  425  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1367  putative DNA methylase HsdM  36.99 
 
 
793 aa  420  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19060  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  43.08 
 
 
586 aa  415  1e-114  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0947092 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0263  N-6 DNA methylase  44.51 
 
 
589 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1782  N-6 DNA methylase  35.02 
 
 
829 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.368234 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0278  type I restriction-modification system, M subunit  35.39 
 
 
790 aa  404  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1861  type I restriction-modification system specificity subunit  36.54 
 
 
710 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0641  N-6 DNA methylase  43.82 
 
 
587 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0776  type I restriction-modification system, M subunit  35.41 
 
 
636 aa  396  1e-109  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0115537  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3442  N-6 DNA methylase  42.86 
 
 
592 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  normal  0.982345 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1517  N-6 DNA methylase  35.24 
 
 
691 aa  393  1e-108  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.140297 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3570  N-6 DNA methylase  35.9 
 
 
647 aa  390  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0657  N-6 DNA methylase  34.15 
 
 
725 aa  385  1e-105  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2269  type I restriction-modification system DNA methylase  33.29 
 
 
763 aa  372  1e-101  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0841  hypothetical protein  38.75 
 
 
608 aa  351  3e-95  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0027333  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2227  N-6 DNA methylase  45.13 
 
 
371 aa  349  9e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2177  N-6 DNA methylase  38.31 
 
 
793 aa  348  3e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0768  N-6 DNA methylase  38 
 
 
799 aa  318  3e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161666  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2256  N-6 DNA methylase  49.83 
 
 
316 aa  292  2e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0633793  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1222  N-6 DNA methylase  36.83 
 
 
552 aa  276  9e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1365  N-6 DNA methylase  30.85 
 
 
697 aa  178  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518057  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  26.86 
 
 
505 aa  170  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  29.49 
 
 
574 aa  161  5e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  30.11 
 
 
587 aa  161  5e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  27.2 
 
 
574 aa  159  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  26.83 
 
 
633 aa  156  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  28.34 
 
 
574 aa  155  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0036  type I restriction enzyme  25.71 
 
 
510 aa  154  4e-36  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.27058  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  26.6 
 
 
495 aa  152  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  25.16 
 
 
510 aa  151  4e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0826  type I restriction-modification system, M subunit  26.23 
 
 
520 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.580356  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0964  N-6 DNA methylase  26.23 
 
 
520 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.311438  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  35.06 
 
 
585 aa  147  6e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  26.57 
 
 
508 aa  146  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  26.57 
 
 
523 aa  146  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  28.12 
 
 
496 aa  145  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0306  N-6 DNA methylase  24.72 
 
 
547 aa  144  8e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1888  type I restriction-modification system, M subunit  27.17 
 
 
526 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  25.15 
 
 
522 aa  143  9.999999999999999e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  25.76 
 
 
498 aa  141  3.9999999999999997e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3989  N-6 DNA methylase  48.59 
 
 
356 aa  140  7.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0877  putative type I restriction-modification system, M subunit  24.28 
 
 
529 aa  139  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2743  type I restriction system adenine methylase  24.95 
 
 
518 aa  139  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3551  type I restriction-modification system, M subunit  28.51 
 
 
499 aa  138  3.0000000000000003e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.795147  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1159  N-6 DNA methylase  25.35 
 
 
516 aa  138  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000301602  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0034  N-6 DNA methylase  25.15 
 
 
544 aa  138  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.966218 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12769  type I restriction/modification system DNA methylase hsdM  24.59 
 
 
540 aa  137  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2248  N-6 DNA methylase  24.84 
 
 
521 aa  137  7.000000000000001e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0522014  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  26.32 
 
 
505 aa  136  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2273  N-6 DNA methylase  25.72 
 
 
522 aa  136  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.443565  hitchhiker  0.00000125043 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0286  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  29.65 
 
 
497 aa  135  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1359  N-6 DNA methylase  23.46 
 
 
529 aa  135  3e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1089  N-6 DNA methylase  25.55 
 
 
527 aa  134  6e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0019  N-6 DNA methylase  24.79 
 
 
501 aa  134  6e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00151011 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  25.53 
 
 
504 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4262  type I restriction-modification system, M subunit  28.28 
 
 
527 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2793  type I restriction-modification system, M subunit  25.51 
 
 
525 aa  133  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2418  N-6 DNA methylase  25.51 
 
 
525 aa  133  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.572428  normal  0.0719197 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2017  N-6 DNA methylase  23.45 
 
 
517 aa  133  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.54323  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  26.22 
 
 
822 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2210  N-6 DNA methylase  25.5 
 
 
522 aa  132  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0039  N-6 DNA methylase  25 
 
 
501 aa  132  3e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  27.99 
 
 
815 aa  131  4.0000000000000003e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>