More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1495 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1495  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 661 aa  1344    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.304059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  50.45 
 
 		 663 aa  629  1e-179  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0684916  normal  0.490543 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0413  N-6 DNA methylase  48.82 
 
 		 661 aa  628  1e-178  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.190573  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1155  N-6 DNA methylase  50 
 
 		 659 aa  622  1e-177  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2687  N-6 DNA methylase  49.49 
 
 		 661 aa  621  1e-176  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.965628  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0234  N-6 DNA methylase  48.97 
 
 		 661 aa  618  1e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0075  N-6 DNA methylase  47.79 
 
 		 658 aa  600  1e-170  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0604  type I restriction-modification system, M subunit; N-6 adenine-specific DNA methylase  48.31 
 
 		 655 aa  593  1e-168  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0795  N-6 DNA methylase  43.76 
 
 		 673 aa  580  1e-164  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364287 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1857  N-6 DNA methylase  48.12 
 
 		 611 aa  568  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.618647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2604  N-6 DNA methylase  43.75 
 
 		 728 aa  560  1e-158  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.205723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1550  N-6 DNA methylase  46.58 
 
 		 673 aa  558  1e-158  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.677514 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4253  N-6 DNA methylase  43.72 
 
 		 708 aa  555  1e-157  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196682  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3984  N-6 DNA methylase  42.53 
 
 		 676 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  0.0238771 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1060  type I restriction-modification  46.88 
 
 		 675 aa  551  1e-155  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000030221  normal  0.0378969 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1792  N-6 DNA methylase  43.06 
 
 		 725 aa  550  1e-155  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0174866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2608  N-6 DNA methylase  45.13 
 
 		 683 aa  551  1e-155  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.648611  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3935  N-6 DNA methylase  42.38 
 
 		 676 aa  548  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1016  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  42.32 
 
 		 680 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0960  N-6 DNA methylase  43.85 
 
 		 670 aa  531  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0192  N-6 DNA methylase  56.78 
 
 		 583 aa  524  1e-147  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341004 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0751  N-6 DNA methylase  41.46 
 
 		 686 aa  505  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.309292 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2680  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  43.11 
 
 		 676 aa  508  9.999999999999999e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.558636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1328  N-6 DNA methylase  48.32 
 
 		 806 aa  488  1e-136  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.909053  normal  0.133174 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0488  N-6 DNA methylase  52.07 
 
 		 580 aa  488  1e-136  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19026 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1480  N-6 DNA methylase  46.34 
 
 		 777 aa  485  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22800  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  43.5 
 
 		 644 aa  480  1e-134  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.386245 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4760  type I restriction-modification system DNA methylase  41.93 
 
 		 659 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.362482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19060  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  50.1 
 
 		 586 aa  463  1e-129  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0947092 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3359  N-6 DNA methylase  38.56 
 
 		 709 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.270263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4916  N-6 DNA methylase  49.4 
 
 		 607 aa  449  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.660274 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3442  N-6 DNA methylase  45.09 
 
 		 592 aa  434  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  0.982345 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0641  N-6 DNA methylase  44.74 
 
 		 587 aa  432  1e-120  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2868  type I restriction-modification system DNA methylase  39.42 
 
 		 675 aa  429  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0465984  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0263  N-6 DNA methylase  44.01 
 
 		 589 aa  421  1e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4454  N-6 DNA methylase  39.36 
 
 		 675 aa  416  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0276  N-6 DNA methylase  45.42 
 
 		 569 aa  412  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4473  N-6 DNA methylase  36.9 
 
 		 677 aa  403  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1025 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2941  restriction/modification methyltransferase  33.55 
 
 		 783 aa  395  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1367  putative DNA methylase HsdM  33.8 
 
 		 793 aa  390  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6258  N-6 DNA methylase  32.99 
 
 		 787 aa  379  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003234  type I restriction-modification system DNA-methyltransferase subunit M  33.16 
 
 		 794 aa  381  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0776  type I restriction-modification system, M subunit  34.35 
 
 		 636 aa  374  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0115537  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1861  type I restriction-modification system specificity subunit  36.35 
 
 		 710 aa  368  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0657  N-6 DNA methylase  33.88 
 
 		 725 aa  360  6e-98  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1517  N-6 DNA methylase  36.19 
 
 		 691 aa  358  1.9999999999999998e-97  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.140297 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2227  N-6 DNA methylase  51.56 
 
 		 371 aa  354  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0768  N-6 DNA methylase  39.67 
 
 		 799 aa  353  7e-96  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1782  N-6 DNA methylase  37.28 
 
 		 829 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.368234 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2201  N-6 DNA methylase  37.93 
 
 		 778 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0841  hypothetical protein  39.33 
 
 		 608 aa  324  3e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0027333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2177  N-6 DNA methylase  37.76 
 
 		 793 aa  310  5.9999999999999995e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0278  type I restriction-modification system, M subunit  36.76 
 
 		 790 aa  306  6e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3570  N-6 DNA methylase  39.41 
 
 		 647 aa  301  3e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2269  type I restriction-modification system DNA methylase  37.86 
 
 		 763 aa  300  4e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1222  N-6 DNA methylase  40.17 
 
 		 552 aa  281  3e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2256  N-6 DNA methylase  49.47 
 
 		 316 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0633793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3989  N-6 DNA methylase  41.51 
 
 		 356 aa  180  8e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1365  N-6 DNA methylase  30.57 
 
 		 697 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518057  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  30.13 
 
 		 496 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  31.03 
 
 		 523 aa  161  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  31.03 
 
 		 508 aa  161  5e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  27.69 
 
 		 498 aa  159  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0036  type I restriction enzyme  25 
 
 		 510 aa  159  2e-37  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.27058  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  28.48 
 
 		 574 aa  158  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  28.23 
 
 		 574 aa  158  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  27.21 
 
 		 505 aa  156  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  27.79 
 
 		 822 aa  154  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  30.05 
 
 		 633 aa  153  8e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  27.54 
 
 		 574 aa  152  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  26.48 
 
 		 495 aa  151  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  28.54 
 
 		 498 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  0.0000000000157011 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  28.31 
 
 		 500 aa  146  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  32.24 
 
 		 585 aa  146  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  26.3 
 
 		 587 aa  144  7e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2348  type I restriction-modification system, M subunit  28.88 
 
 		 505 aa  143  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.427504  hitchhiker  0.00993981 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1888  type I restriction-modification system, M subunit  27.8 
 
 		 526 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  28.57 
 
 		 504 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  28.1 
 
 		 505 aa  140  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  26.42 
 
 		 510 aa  139  1e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  27.08 
 
 		 499 aa  140  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  26.71 
 
 		 499 aa  137  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  26.19 
 
 		 503 aa  136  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7556  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  26.17 
 
 		 544 aa  134  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4014  N-6 DNA methylase  29.1 
 
 		 816 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2853  N-6 DNA methylase  28.6 
 
 		 810 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2743  type I restriction system adenine methylase  30.67 
 
 		 518 aa  132  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5009  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  27.04 
 
 		 860 aa  131  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235997 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2248  N-6 DNA methylase  26.33 
 
 		 521 aa  131  3e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0522014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0286  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  28 
 
 		 497 aa  131  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2017  N-6 DNA methylase  29.89 
 
 		 517 aa  132  3e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.54323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  26.99 
 
 		 522 aa  131  3e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2453  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  27.68 
 
 		 538 aa  131  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.53896  normal  0.845275 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1644  N-6 DNA methylase  32.23 
 
 		 498 aa  131  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2509  site-specific DNA-methyltransferase  29.97 
 
 		 540 aa  131  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.642426 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3758  N-6 DNA methylase  30.59 
 
 		 511 aa  130  9.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.921564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0005  type I restriction-modification system, M subunit  26.53 
 
 		 528 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3915  N-6 DNA methylase  26.24 
 
 		 541 aa  128  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1096  N-6 DNA methylase  26.35 
 
 		 543 aa  128  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0034  N-6 DNA methylase  26.46 
 
 		 544 aa  129  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966218 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>