More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_13670 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_13670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  100 
 
 
663 aa  1365    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0684916  normal  0.490543 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1495  N-6 DNA methylase  50.45 
 
 
661 aa  629  1e-179  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.304059  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1155  N-6 DNA methylase  48.46 
 
 
659 aa  624  1e-177  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0413  N-6 DNA methylase  46.46 
 
 
661 aa  616  1e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.190573  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0075  N-6 DNA methylase  48.14 
 
 
658 aa  611  1e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0234  N-6 DNA methylase  46.46 
 
 
661 aa  610  1e-173  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2687  N-6 DNA methylase  46.72 
 
 
661 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.965628  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1857  N-6 DNA methylase  49.3 
 
 
611 aa  599  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.618647  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2680  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  47.81 
 
 
676 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.558636  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0960  N-6 DNA methylase  47.01 
 
 
670 aa  581  1e-164  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0795  N-6 DNA methylase  46.15 
 
 
673 aa  572  1.0000000000000001e-162  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00364287 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3984  N-6 DNA methylase  45.02 
 
 
676 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  0.0238771 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3935  N-6 DNA methylase  44.87 
 
 
676 aa  571  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1016  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  44.51 
 
 
680 aa  566  1e-160  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4253  N-6 DNA methylase  43.7 
 
 
708 aa  565  1.0000000000000001e-159  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196682  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0604  type I restriction-modification system, M subunit; N-6 adenine-specific DNA methylase  47.03 
 
 
655 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2604  N-6 DNA methylase  43.59 
 
 
728 aa  557  1e-157  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.205723  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1792  N-6 DNA methylase  42.6 
 
 
725 aa  557  1e-157  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0174866  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2608  N-6 DNA methylase  43.38 
 
 
683 aa  550  1e-155  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.648611  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1550  N-6 DNA methylase  44.36 
 
 
673 aa  543  1e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.677514 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0488  N-6 DNA methylase  55.49 
 
 
580 aa  525  1e-148  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.19026 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1328  N-6 DNA methylase  37.62 
 
 
806 aa  516  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.909053  normal  0.133174 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1060  type I restriction-modification  54.99 
 
 
675 aa  504  1e-141  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000030221  normal  0.0378969 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3359  N-6 DNA methylase  40.7 
 
 
709 aa  504  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.270263  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0192  N-6 DNA methylase  50.85 
 
 
583 aa  487  1e-136  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341004 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4760  type I restriction-modification system DNA methylase  41.42 
 
 
659 aa  473  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.362482  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2868  type I restriction-modification system DNA methylase  40.6 
 
 
675 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0465984  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1480  N-6 DNA methylase  47.93 
 
 
777 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4454  N-6 DNA methylase  39.97 
 
 
675 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195788  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0751  N-6 DNA methylase  39.85 
 
 
686 aa  466  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.309292 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19060  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  49.89 
 
 
586 aa  466  9.999999999999999e-131  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0947092 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22800  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  40.54 
 
 
644 aa  461  9.999999999999999e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.386245 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4916  N-6 DNA methylase  50.3 
 
 
607 aa  461  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.660274 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0276  N-6 DNA methylase  46.7 
 
 
569 aa  436  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4473  N-6 DNA methylase  37.63 
 
 
677 aa  426  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.1025 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0641  N-6 DNA methylase  46.99 
 
 
587 aa  419  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3442  N-6 DNA methylase  45.22 
 
 
592 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  normal  0.982345 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1861  type I restriction-modification system specificity subunit  37.43 
 
 
710 aa  414  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2941  restriction/modification methyltransferase  34.4 
 
 
783 aa  412  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0263  N-6 DNA methylase  46.46 
 
 
589 aa  411  1e-113  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1517  N-6 DNA methylase  37.89 
 
 
691 aa  408  1.0000000000000001e-112  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.140297 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3570  N-6 DNA methylase  38.5 
 
 
647 aa  405  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0776  type I restriction-modification system, M subunit  34.67 
 
 
636 aa  390  1e-107  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0115537  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0657  N-6 DNA methylase  33.01 
 
 
725 aa  379  1e-103  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6258  N-6 DNA methylase  37.52 
 
 
787 aa  353  4e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0768  N-6 DNA methylase  40.21 
 
 
799 aa  350  4e-95  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161666  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2227  N-6 DNA methylase  50 
 
 
371 aa  350  5e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1782  N-6 DNA methylase  40.04 
 
 
829 aa  346  8e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.368234 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003234  type I restriction-modification system DNA-methyltransferase subunit M  37.61 
 
 
794 aa  345  1e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2177  N-6 DNA methylase  41.12 
 
 
793 aa  345  1e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1367  putative DNA methylase HsdM  39.85 
 
 
793 aa  343  7e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0841  hypothetical protein  40.16 
 
 
608 aa  342  1e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0027333  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2201  N-6 DNA methylase  38.3 
 
 
778 aa  341  2e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2269  type I restriction-modification system DNA methylase  41.03 
 
 
763 aa  336  7e-91  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0278  type I restriction-modification system, M subunit  41.19 
 
 
790 aa  332  1e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1222  N-6 DNA methylase  39.41 
 
 
552 aa  288  2.9999999999999996e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2256  N-6 DNA methylase  50.52 
 
 
316 aa  284  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0633793  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1365  N-6 DNA methylase  30.61 
 
 
697 aa  187  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518057  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  31.32 
 
 
523 aa  181  4e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  31.32 
 
 
508 aa  181  4.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  30.26 
 
 
633 aa  179  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  28.73 
 
 
574 aa  177  6e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  27.76 
 
 
574 aa  175  2.9999999999999996e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  29.61 
 
 
574 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0036  type I restriction enzyme  27.9 
 
 
510 aa  173  6.999999999999999e-42  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.27058  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  32.63 
 
 
496 aa  174  6.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  29.94 
 
 
498 aa  173  7.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  28.23 
 
 
505 aa  173  9e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  28.16 
 
 
587 aa  170  8e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  28.02 
 
 
504 aa  167  8e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  27.75 
 
 
510 aa  165  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  28.73 
 
 
505 aa  162  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  27.03 
 
 
495 aa  162  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2691  N-6 DNA methylase  30.04 
 
 
523 aa  162  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1888  type I restriction-modification system, M subunit  29.46 
 
 
526 aa  160  7e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  30.34 
 
 
585 aa  159  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1089  N-6 DNA methylase  28.26 
 
 
527 aa  159  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1896  N-6 DNA methylase  28.8 
 
 
511 aa  158  3e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.836046  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3551  type I restriction-modification system, M subunit  29.74 
 
 
499 aa  157  9e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.795147  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  27.84 
 
 
522 aa  156  9e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  31.01 
 
 
808 aa  156  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0990  type I restriction-modification system, M subunit  28.63 
 
 
501 aa  156  1e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.555022  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3984  N-6 DNA methylase  27.43 
 
 
505 aa  155  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2248  N-6 DNA methylase  28.76 
 
 
521 aa  155  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0522014  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  30.58 
 
 
498 aa  154  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  0.0000000000157011 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4014  N-6 DNA methylase  29.05 
 
 
816 aa  154  4e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  30.64 
 
 
500 aa  153  8e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0964  N-6 DNA methylase  27.36 
 
 
520 aa  153  8.999999999999999e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.311438  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0826  type I restriction-modification system, M subunit  27.36 
 
 
520 aa  153  8.999999999999999e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.580356  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  27.77 
 
 
499 aa  153  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1644  N-6 DNA methylase  27.47 
 
 
498 aa  152  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3148  N-6 DNA methylase  26.44 
 
 
540 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  28.6 
 
 
822 aa  152  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2273  N-6 DNA methylase  26.5 
 
 
522 aa  152  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.443565  hitchhiker  0.00000125043 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3758  N-6 DNA methylase  28.29 
 
 
511 aa  152  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.921564  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2348  type I restriction-modification system, M subunit  30.23 
 
 
505 aa  151  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.427504  hitchhiker  0.00993981 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3154  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  27.55 
 
 
508 aa  151  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3609  N-6 DNA methylase  25.74 
 
 
508 aa  150  6e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107088  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  25.49 
 
 
503 aa  150  6e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2453  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  28.04 
 
 
538 aa  150  6e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.53896  normal  0.845275 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>