More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2941 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0278  type I restriction-modification system, M subunit  46.88 
 
 
790 aa  635    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2201  N-6 DNA methylase  46.15 
 
 
778 aa  643    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2269  type I restriction-modification system DNA methylase  45.9 
 
 
763 aa  647    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1367  putative DNA methylase HsdM  68.02 
 
 
793 aa  1092    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6258  N-6 DNA methylase  76.37 
 
 
787 aa  1232    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2941  restriction/modification methyltransferase  100 
 
 
783 aa  1617    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1782  N-6 DNA methylase  67.61 
 
 
829 aa  1094    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.368234 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003234  type I restriction-modification system DNA-methyltransferase subunit M  67.85 
 
 
794 aa  1092    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2177  N-6 DNA methylase  47.01 
 
 
793 aa  671    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1861  type I restriction-modification system specificity subunit  44.29 
 
 
710 aa  595  1e-168  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4473  N-6 DNA methylase  45.29 
 
 
677 aa  586  1e-166  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.1025 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1016  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  41.78 
 
 
680 aa  537  1e-151  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0657  N-6 DNA methylase  41.75 
 
 
725 aa  533  1e-150  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4253  N-6 DNA methylase  39.38 
 
 
708 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196682  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1328  N-6 DNA methylase  36.73 
 
 
806 aa  512  1e-144  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.909053  normal  0.133174 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3984  N-6 DNA methylase  39.62 
 
 
676 aa  503  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  0.0238771 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3570  N-6 DNA methylase  51.94 
 
 
647 aa  500  1e-140  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0841  hypothetical protein  52.66 
 
 
608 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0027333  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3935  N-6 DNA methylase  38.34 
 
 
676 aa  490  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0795  N-6 DNA methylase  38.8 
 
 
673 aa  487  1e-136  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00364287 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0776  type I restriction-modification system, M subunit  49.54 
 
 
636 aa  483  1e-135  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0115537  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1480  N-6 DNA methylase  35.79 
 
 
777 aa  480  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1155  N-6 DNA methylase  37.4 
 
 
659 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0075  N-6 DNA methylase  35.72 
 
 
658 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0234  N-6 DNA methylase  36.2 
 
 
661 aa  459  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2687  N-6 DNA methylase  37.07 
 
 
661 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.965628  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1792  N-6 DNA methylase  35.06 
 
 
725 aa  449  1e-125  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0174866  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0413  N-6 DNA methylase  35.96 
 
 
661 aa  450  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.190573  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2604  N-6 DNA methylase  34.94 
 
 
728 aa  443  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.205723  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0276  N-6 DNA methylase  43.45 
 
 
569 aa  430  1e-119  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0960  N-6 DNA methylase  42.52 
 
 
670 aa  415  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1550  N-6 DNA methylase  35.23 
 
 
673 aa  414  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.677514 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1222  N-6 DNA methylase  49.35 
 
 
552 aa  412  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  34.4 
 
 
663 aa  412  1e-113  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0684916  normal  0.490543 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3359  N-6 DNA methylase  34.05 
 
 
709 aa  412  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.270263  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0751  N-6 DNA methylase  35.65 
 
 
686 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.309292 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3442  N-6 DNA methylase  43.77 
 
 
592 aa  403  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  normal  0.982345 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0488  N-6 DNA methylase  43.92 
 
 
580 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.19026 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1495  N-6 DNA methylase  33.55 
 
 
661 aa  395  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.304059  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1060  type I restriction-modification  42.88 
 
 
675 aa  386  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000030221  normal  0.0378969 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4916  N-6 DNA methylase  41.09 
 
 
607 aa  384  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.660274 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2680  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  40.49 
 
 
676 aa  385  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.558636  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0604  type I restriction-modification system, M subunit; N-6 adenine-specific DNA methylase  39.86 
 
 
655 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19060  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  40.35 
 
 
586 aa  377  1e-103  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0947092 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0641  N-6 DNA methylase  42.94 
 
 
587 aa  379  1e-103  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1857  N-6 DNA methylase  40.25 
 
 
611 aa  375  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.618647  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22800  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  40.15 
 
 
644 aa  367  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.386245 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0263  N-6 DNA methylase  41.59 
 
 
589 aa  364  4e-99  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2608  N-6 DNA methylase  38.9 
 
 
683 aa  360  4e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.648611  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2868  type I restriction-modification system DNA methylase  31.94 
 
 
675 aa  345  2e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0465984  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0192  N-6 DNA methylase  38.4 
 
 
583 aa  334  4e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341004 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4454  N-6 DNA methylase  31.43 
 
 
675 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195788  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4760  type I restriction-modification system DNA methylase  34.21 
 
 
659 aa  298  3e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.362482  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0768  N-6 DNA methylase  33.01 
 
 
799 aa  278  3e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161666  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1517  N-6 DNA methylase  30.89 
 
 
691 aa  263  6.999999999999999e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.140297 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2256  N-6 DNA methylase  40.31 
 
 
316 aa  219  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0633793  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2227  N-6 DNA methylase  52.66 
 
 
371 aa  199  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1213  type I restriction-modification system specificity subunit  53.12 
 
 
196 aa  197  7e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1365  N-6 DNA methylase  29.73 
 
 
697 aa  169  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518057  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  27.69 
 
 
822 aa  160  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  28.46 
 
 
574 aa  159  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  28.72 
 
 
587 aa  157  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  32.6 
 
 
505 aa  155  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  28.05 
 
 
574 aa  150  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  27.79 
 
 
574 aa  149  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  26.25 
 
 
633 aa  146  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  26.33 
 
 
585 aa  145  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  26.92 
 
 
522 aa  145  3e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  26.14 
 
 
808 aa  142  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4043  N-6 DNA methylase  27.22 
 
 
824 aa  140  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1672  N-6 DNA methylase  28.01 
 
 
516 aa  139  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.179457  hitchhiker  0.001187 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05613  type I restriction-modification system specificity subunit  29.43 
 
 
873 aa  139  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1089  N-6 DNA methylase  26.82 
 
 
527 aa  139  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  28.05 
 
 
504 aa  138  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2273  N-6 DNA methylase  25.97 
 
 
522 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.443565  hitchhiker  0.00000125043 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  30.94 
 
 
496 aa  137  7.000000000000001e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0563  type I restriction-modification system, M subunit  26.36 
 
 
908 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170311  hitchhiker  0.0000000000000803096 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0826  type I restriction-modification system, M subunit  25.26 
 
 
520 aa  135  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.580356  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0964  N-6 DNA methylase  25.26 
 
 
520 aa  135  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.311438  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1644  N-6 DNA methylase  30.86 
 
 
498 aa  135  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0286  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  26.27 
 
 
497 aa  134  6e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1159  N-6 DNA methylase  26.51 
 
 
516 aa  133  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000301602  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  26.72 
 
 
505 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2210  N-6 DNA methylase  25.77 
 
 
522 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  30.31 
 
 
498 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4014  N-6 DNA methylase  24.69 
 
 
816 aa  132  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  28.21 
 
 
510 aa  131  4.0000000000000003e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  26.8 
 
 
815 aa  131  5.0000000000000004e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  31.99 
 
 
500 aa  131  6e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  25.97 
 
 
495 aa  130  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1896  N-6 DNA methylase  27.05 
 
 
511 aa  130  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.836046  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0952  type I restriction-modification system, M subunit  31.16 
 
 
809 aa  129  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000609916 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0103  N-6 DNA methylase  26.47 
 
 
493 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  26.56 
 
 
503 aa  129  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3148  N-6 DNA methylase  28.66 
 
 
540 aa  129  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4006  N-6 DNA methylase  24.18 
 
 
514 aa  128  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1222  N-6 DNA methylase  26.34 
 
 
519 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5009  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  27.02 
 
 
860 aa  128  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.235997 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3154  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  25.77 
 
 
508 aa  127  6e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  30.03 
 
 
814 aa  127  8.000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>