More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1016 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_0413  N-6 DNA methylase  47.65 
 
 		 661 aa  650    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.190573  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1016  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  100 
 
 		 680 aa  1396    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3984  N-6 DNA methylase  63.88 
 
 		 676 aa  874    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  0.0238771 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0075  N-6 DNA methylase  46.54 
 
 		 658 aa  636    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3935  N-6 DNA methylase  63.88 
 
 		 676 aa  875    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1155  N-6 DNA methylase  49.63 
 
 		 659 aa  655    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2604  N-6 DNA methylase  49.38 
 
 		 728 aa  662    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.205723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1550  N-6 DNA methylase  51.39 
 
 		 673 aa  677    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.677514 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0795  N-6 DNA methylase  58.55 
 
 		 673 aa  756    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364287 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0604  type I restriction-modification system, M subunit; N-6 adenine-specific DNA methylase  49.78 
 
 		 655 aa  638    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1792  N-6 DNA methylase  49.24 
 
 		 725 aa  662    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0174866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2608  N-6 DNA methylase  47.81 
 
 		 683 aa  639    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.648611  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4253  N-6 DNA methylase  52.25 
 
 		 708 aa  694    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196682  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0751  N-6 DNA methylase  52.92 
 
 		 686 aa  710    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.309292 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0234  N-6 DNA methylase  48.53 
 
 		 661 aa  654    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0960  N-6 DNA methylase  49.21 
 
 		 670 aa  633  1e-180  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2687  N-6 DNA methylase  46.33 
 
 		 661 aa  618  1e-176  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.965628  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2680  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  46.24 
 
 		 676 aa  610  1e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.558636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0276  N-6 DNA methylase  59.66 
 
 		 569 aa  589  1e-167  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1328  N-6 DNA methylase  41.99 
 
 		 806 aa  577  1.0000000000000001e-163  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.909053  normal  0.133174 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1480  N-6 DNA methylase  42.29 
 
 		 777 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  44.51 
 
 		 663 aa  566  1e-160  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0684916  normal  0.490543 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3359  N-6 DNA methylase  43.89 
 
 		 709 aa  561  1e-158  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.270263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1060  type I restriction-modification  56.58 
 
 		 675 aa  547  1e-154  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000030221  normal  0.0378969 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4760  type I restriction-modification system DNA methylase  42.19 
 
 		 659 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.362482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1495  N-6 DNA methylase  42.32 
 
 		 661 aa  540  9.999999999999999e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.304059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4473  N-6 DNA methylase  46.94 
 
 		 677 aa  542  9.999999999999999e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1025 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0488  N-6 DNA methylase  55.51 
 
 		 580 aa  538  1e-151  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19026 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2941  restriction/modification methyltransferase  41.78 
 
 		 783 aa  537  1e-151  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1857  N-6 DNA methylase  52.03 
 
 		 611 aa  535  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.618647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1861  type I restriction-modification system specificity subunit  44.48 
 
 		 710 aa  525  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2868  type I restriction-modification system DNA methylase  41.21 
 
 		 675 aa  514  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0465984  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4454  N-6 DNA methylase  41.23 
 
 		 675 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22800  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  43.29 
 
 		 644 aa  513  1e-144  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.386245 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6258  N-6 DNA methylase  41.19 
 
 		 787 aa  511  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2201  N-6 DNA methylase  40.26 
 
 		 778 aa  502  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003234  type I restriction-modification system DNA-methyltransferase subunit M  39.77 
 
 		 794 aa  498  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1367  putative DNA methylase HsdM  39.9 
 
 		 793 aa  494  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4916  N-6 DNA methylase  52.49 
 
 		 607 aa  491  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.660274 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0776  type I restriction-modification system, M subunit  42.9 
 
 		 636 aa  491  1e-137  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0115537  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0278  type I restriction-modification system, M subunit  40.91 
 
 		 790 aa  478  1e-133  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1782  N-6 DNA methylase  38.24 
 
 		 829 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.368234 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3570  N-6 DNA methylase  40.8 
 
 		 647 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19060  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  49.06 
 
 		 586 aa  463  1e-129  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0947092 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0657  N-6 DNA methylase  39.27 
 
 		 725 aa  461  9.999999999999999e-129  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0192  N-6 DNA methylase  48 
 
 		 583 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341004 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0263  N-6 DNA methylase  48.36 
 
 		 589 aa  442  1e-123  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3442  N-6 DNA methylase  48.03 
 
 		 592 aa  444  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  0.982345 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0641  N-6 DNA methylase  48.67 
 
 		 587 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2177  N-6 DNA methylase  46.92 
 
 		 793 aa  437  1e-121  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1517  N-6 DNA methylase  37.09 
 
 		 691 aa  436  1e-121  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.140297 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0841  hypothetical protein  47.78 
 
 		 608 aa  434  1e-120  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0027333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2269  type I restriction-modification system DNA methylase  47.51 
 
 		 763 aa  421  1e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1222  N-6 DNA methylase  44.89 
 
 		 552 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2227  N-6 DNA methylase  48.35 
 
 		 371 aa  351  3e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0768  N-6 DNA methylase  39.83 
 
 		 799 aa  338  9.999999999999999e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2256  N-6 DNA methylase  46.9 
 
 		 316 aa  276  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0633793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1365  N-6 DNA methylase  31.21 
 
 		 697 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518057  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  31.28 
 
 		 574 aa  180  8e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  30.19 
 
 		 505 aa  177  8e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  31.66 
 
 		 574 aa  176  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  30.88 
 
 		 574 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  32.14 
 
 		 587 aa  174  3.9999999999999995e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  35.2 
 
 		 585 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  27.45 
 
 		 522 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  29.72 
 
 		 822 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  26.49 
 
 		 505 aa  162  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  32.84 
 
 		 496 aa  162  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  27.21 
 
 		 504 aa  159  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3989  N-6 DNA methylase  55.88 
 
 		 356 aa  158  4e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  29.6 
 
 		 523 aa  157  5.0000000000000005e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  29.6 
 
 		 508 aa  157  7e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  31.91 
 
 		 498 aa  156  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3758  N-6 DNA methylase  27.31 
 
 		 511 aa  154  5.9999999999999996e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.921564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  27.91 
 
 		 499 aa  154  7e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  27.9 
 
 		 495 aa  154  7e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  27.86 
 
 		 633 aa  153  8.999999999999999e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  27.51 
 
 		 499 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0286  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  25 
 
 		 497 aa  152  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1213  type I restriction-modification system specificity subunit  44.92 
 
 		 196 aa  152  2e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  28.7 
 
 		 808 aa  150  7e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1644  N-6 DNA methylase  24.21 
 
 		 498 aa  147  5e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0103  N-6 DNA methylase  28.24 
 
 		 493 aa  145  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05613  type I restriction-modification system specificity subunit  32.03 
 
 		 873 aa  145  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3609  N-6 DNA methylase  27.55 
 
 		 508 aa  144  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2789  N-6 DNA methylase  26.36 
 
 		 532 aa  144  5e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  31.56 
 
 		 500 aa  144  5e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0034  N-6 DNA methylase  26.81 
 
 		 544 aa  143  9e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966218 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3154  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  28.07 
 
 		 508 aa  142  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0032  N-6 DNA methylase  27.75 
 
 		 544 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.885751  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1222  N-6 DNA methylase  23.58 
 
 		 519 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1089  N-6 DNA methylase  26.39 
 
 		 527 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  28.53 
 
 		 510 aa  142  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0826  type I restriction-modification system, M subunit  28.89 
 
 		 520 aa  142  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.580356  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0964  N-6 DNA methylase  28.89 
 
 		 520 aa  142  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.311438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4043  N-6 DNA methylase  28 
 
 		 824 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  27.7 
 
 		 815 aa  141  4.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4014  N-6 DNA methylase  27.88 
 
 		 816 aa  141  4.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  24.95 
 
 		 503 aa  140  7e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0877  putative type I restriction-modification system, M subunit  28.73 
 
 		 529 aa  140  7.999999999999999e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.528701 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>