More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3359 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2680  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  53.86 
 
 		 676 aa  748    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.558636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3359  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 709 aa  1459    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.270263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0604  type I restriction-modification system, M subunit; N-6 adenine-specific DNA methylase  45.54 
 
 		 655 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0795  N-6 DNA methylase  45.28 
 
 		 673 aa  581  1e-164  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364287 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3984  N-6 DNA methylase  44.17 
 
 		 676 aa  568  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  0.0238771 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3935  N-6 DNA methylase  43.49 
 
 		 676 aa  568  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1016  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  43.89 
 
 		 680 aa  561  1e-158  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0960  N-6 DNA methylase  42.97 
 
 		 670 aa  559  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1792  N-6 DNA methylase  43.18 
 
 		 725 aa  559  1e-158  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0174866  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4253  N-6 DNA methylase  44.16 
 
 		 708 aa  554  1e-156  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196682  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2604  N-6 DNA methylase  42.26 
 
 		 728 aa  552  1e-156  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.205723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1155  N-6 DNA methylase  42.34 
 
 		 659 aa  548  1e-154  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0234  N-6 DNA methylase  41.46 
 
 		 661 aa  541  9.999999999999999e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0413  N-6 DNA methylase  41.36 
 
 		 661 aa  542  9.999999999999999e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.190573  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2608  N-6 DNA methylase  41.53 
 
 		 683 aa  536  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.648611  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1550  N-6 DNA methylase  42.9 
 
 		 673 aa  527  1e-148  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.677514 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1328  N-6 DNA methylase  39.25 
 
 		 806 aa  523  1e-147  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.909053  normal  0.133174 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2687  N-6 DNA methylase  41.21 
 
 		 661 aa  520  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.965628  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0075  N-6 DNA methylase  40.23 
 
 		 658 aa  510  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  40.7 
 
 		 663 aa  504  1e-141  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0684916  normal  0.490543 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0488  N-6 DNA methylase  50 
 
 		 580 aa  486  1e-136  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19026 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1060  type I restriction-modification  49.49 
 
 		 675 aa  479  1e-134  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000030221  normal  0.0378969 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4760  type I restriction-modification system DNA methylase  37.87 
 
 		 659 aa  481  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.362482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1857  N-6 DNA methylase  48.18 
 
 		 611 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.618647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0751  N-6 DNA methylase  37.6 
 
 		 686 aa  465  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.309292 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1495  N-6 DNA methylase  38.56 
 
 		 661 aa  453  1.0000000000000001e-126  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.304059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1480  N-6 DNA methylase  44.07 
 
 		 777 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22800  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  38.71 
 
 		 644 aa  449  1.0000000000000001e-124  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.386245 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0276  N-6 DNA methylase  45.76 
 
 		 569 aa  437  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2868  type I restriction-modification system DNA methylase  37.48 
 
 		 675 aa  437  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0465984  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4454  N-6 DNA methylase  37.12 
 
 		 675 aa  435  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1861  type I restriction-modification system specificity subunit  38.05 
 
 		 710 aa  429  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4916  N-6 DNA methylase  45.22 
 
 		 607 aa  429  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.660274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4473  N-6 DNA methylase  36.59 
 
 		 677 aa  421  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1025 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0192  N-6 DNA methylase  45.45 
 
 		 583 aa  413  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341004 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2941  restriction/modification methyltransferase  34.05 
 
 		 783 aa  412  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6258  N-6 DNA methylase  34.92 
 
 		 787 aa  402  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3570  N-6 DNA methylase  35.94 
 
 		 647 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2201  N-6 DNA methylase  33.79 
 
 		 778 aa  398  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3442  N-6 DNA methylase  40.97 
 
 		 592 aa  391  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  0.982345 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19060  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  41.51 
 
 		 586 aa  378  1e-103  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0947092 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1367  putative DNA methylase HsdM  33.54 
 
 		 793 aa  373  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003234  type I restriction-modification system DNA-methyltransferase subunit M  32.39 
 
 		 794 aa  370  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0641  N-6 DNA methylase  40.08 
 
 		 587 aa  367  1e-100  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0657  N-6 DNA methylase  32.48 
 
 		 725 aa  362  1e-98  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0263  N-6 DNA methylase  38.48 
 
 		 589 aa  361  2e-98  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2177  N-6 DNA methylase  39.81 
 
 		 793 aa  357  5e-97  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0776  type I restriction-modification system, M subunit  38.22 
 
 		 636 aa  356  1e-96  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0115537  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0278  type I restriction-modification system, M subunit  38.7 
 
 		 790 aa  351  3e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2269  type I restriction-modification system DNA methylase  39.77 
 
 		 763 aa  342  1e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1782  N-6 DNA methylase  38.8 
 
 		 829 aa  333  5e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.368234 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0768  N-6 DNA methylase  37.42 
 
 		 799 aa  323  7e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0841  hypothetical protein  37.77 
 
 		 608 aa  318  2e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0027333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1517  N-6 DNA methylase  30.94 
 
 		 691 aa  316  7e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.140297 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1222  N-6 DNA methylase  43.24 
 
 		 552 aa  311  4e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2256  N-6 DNA methylase  47.77 
 
 		 316 aa  271  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0633793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2227  N-6 DNA methylase  38.97 
 
 		 371 aa  253  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1365  N-6 DNA methylase  28.4 
 
 		 697 aa  190  7e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518057  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  28.18 
 
 		 574 aa  154  8e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  27.88 
 
 		 496 aa  152  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  28.41 
 
 		 587 aa  151  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3989  N-6 DNA methylase  50.34 
 
 		 356 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  27.21 
 
 		 574 aa  147  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  28.04 
 
 		 510 aa  142  9.999999999999999e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  27.06 
 
 		 574 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  27.46 
 
 		 499 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  27.27 
 
 		 499 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  27.89 
 
 		 633 aa  142  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0964  N-6 DNA methylase  24.9 
 
 		 520 aa  141  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.311438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  26.57 
 
 		 522 aa  141  3e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0826  type I restriction-modification system, M subunit  24.9 
 
 		 520 aa  141  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.580356  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  26.46 
 
 		 505 aa  139  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  28.64 
 
 		 585 aa  139  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1159  N-6 DNA methylase  25.97 
 
 		 516 aa  139  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000301602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0036  type I restriction enzyme  25.17 
 
 		 510 aa  139  2e-31  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.27058  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0103  N-6 DNA methylase  26.77 
 
 		 493 aa  139  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  26.19 
 
 		 505 aa  137  8e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  26.97 
 
 		 498 aa  137  9e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  26.08 
 
 		 504 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3551  type I restriction-modification system, M subunit  27.55 
 
 		 499 aa  136  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.795147  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  26.26 
 
 		 822 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  23.81 
 
 		 495 aa  134  5e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1672  N-6 DNA methylase  27.01 
 
 		 516 aa  134  6.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.179457  hitchhiker  0.001187 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0306  N-6 DNA methylase  23.98 
 
 		 547 aa  134  7.999999999999999e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  26.08 
 
 		 500 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3154  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  26.85 
 
 		 508 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  25.74 
 
 		 815 aa  131  4.0000000000000003e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1089  N-6 DNA methylase  25.31 
 
 		 527 aa  131  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  26.59 
 
 		 498 aa  130  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  0.0000000000157011 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  25.61 
 
 		 508 aa  130  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  25.61 
 
 		 523 aa  130  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3984  N-6 DNA methylase  25.95 
 
 		 505 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1896  N-6 DNA methylase  25.28 
 
 		 511 aa  130  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.836046  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  26.65 
 
 		 503 aa  130  1.0000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0877  putative type I restriction-modification system, M subunit  25.22 
 
 		 529 aa  128  3e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2273  N-6 DNA methylase  24.37 
 
 		 522 aa  128  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.443565  hitchhiker  0.00000125043 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2908  N-6 DNA methylase  30.41 
 
 		 523 aa  127  7e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3609  N-6 DNA methylase  26.38 
 
 		 508 aa  127  8.000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0286  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  26.14 
 
 		 497 aa  126  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2210  N-6 DNA methylase  25.05 
 
 		 522 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>