More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1480 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1480  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 777 aa  1599    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1155  N-6 DNA methylase  51.55 
 
 		 659 aa  742    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2687  N-6 DNA methylase  58.04 
 
 		 661 aa  642    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.965628  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1328  N-6 DNA methylase  69.59 
 
 		 806 aa  1129    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.909053  normal  0.133174 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0075  N-6 DNA methylase  52.53 
 
 		 658 aa  754    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0604  type I restriction-modification system, M subunit; N-6 adenine-specific DNA methylase  66.21 
 
 		 655 aa  677    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2608  N-6 DNA methylase  54.73 
 
 		 683 aa  768    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.648611  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0234  N-6 DNA methylase  58.57 
 
 		 661 aa  664    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0413  N-6 DNA methylase  58.91 
 
 		 661 aa  670    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.190573  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0488  N-6 DNA methylase  58.7 
 
 		 580 aa  597  1e-169  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19026 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1857  N-6 DNA methylase  58.75 
 
 		 611 aa  596  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.618647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1060  type I restriction-modification  59.72 
 
 		 675 aa  590  1e-167  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000030221  normal  0.0378969 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1016  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  42.29 
 
 		 680 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3984  N-6 DNA methylase  41.21 
 
 		 676 aa  565  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  0.0238771 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3935  N-6 DNA methylase  41.08 
 
 		 676 aa  562  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4916  N-6 DNA methylase  55.73 
 
 		 607 aa  551  1e-155  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.660274 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4253  N-6 DNA methylase  40.68 
 
 		 708 aa  548  1e-154  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196682  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2604  N-6 DNA methylase  40.35 
 
 		 728 aa  539  1e-151  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.205723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0795  N-6 DNA methylase  52.12 
 
 		 673 aa  535  1e-150  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364287 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1792  N-6 DNA methylase  39.58 
 
 		 725 aa  522  1e-146  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0174866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0751  N-6 DNA methylase  40.69 
 
 		 686 aa  515  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.309292 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0960  N-6 DNA methylase  48.86 
 
 		 670 aa  504  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1550  N-6 DNA methylase  49.72 
 
 		 673 aa  496  1e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.677514 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4760  type I restriction-modification system DNA methylase  48.73 
 
 		 659 aa  488  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.362482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1495  N-6 DNA methylase  46.34 
 
 		 661 aa  485  1e-135  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.304059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2680  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  45.99 
 
 		 676 aa  480  1e-134  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.558636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2941  restriction/modification methyltransferase  35.79 
 
 		 783 aa  480  1e-134  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19060  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  48.52 
 
 		 586 aa  478  1e-133  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0947092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6258  N-6 DNA methylase  35.53 
 
 		 787 aa  469  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  47.93 
 
 		 663 aa  466  9.999999999999999e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0684916  normal  0.490543 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0192  N-6 DNA methylase  46.81 
 
 		 583 aa  461  9.999999999999999e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341004 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0276  N-6 DNA methylase  47.43 
 
 		 569 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003234  type I restriction-modification system DNA-methyltransferase subunit M  35.56 
 
 		 794 aa  457  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3359  N-6 DNA methylase  44.07 
 
 		 709 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.270263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1367  putative DNA methylase HsdM  35.02 
 
 		 793 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2201  N-6 DNA methylase  37.06 
 
 		 778 aa  452  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0278  type I restriction-modification system, M subunit  38.1 
 
 		 790 aa  446  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2177  N-6 DNA methylase  35.97 
 
 		 793 aa  439  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2868  type I restriction-modification system DNA methylase  46.23 
 
 		 675 aa  438  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0465984  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1782  N-6 DNA methylase  35.1 
 
 		 829 aa  436  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.368234 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2269  type I restriction-modification system DNA methylase  36.1 
 
 		 763 aa  434  1e-120  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4454  N-6 DNA methylase  46.05 
 
 		 675 aa  432  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22800  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  43.6 
 
 		 644 aa  425  1e-117  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.386245 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0263  N-6 DNA methylase  43.73 
 
 		 589 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0641  N-6 DNA methylase  43.44 
 
 		 587 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3442  N-6 DNA methylase  42.57 
 
 		 592 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  0.982345 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4473  N-6 DNA methylase  42.25 
 
 		 677 aa  384  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1025 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1861  type I restriction-modification system specificity subunit  39.56 
 
 		 710 aa  346  8.999999999999999e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0776  type I restriction-modification system, M subunit  38.95 
 
 		 636 aa  346  1e-93  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0115537  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1517  N-6 DNA methylase  35.66 
 
 		 691 aa  340  5.9999999999999996e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.140297 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0657  N-6 DNA methylase  32.1 
 
 		 725 aa  334  5e-90  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0841  hypothetical protein  38.36 
 
 		 608 aa  331  4e-89  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0027333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3570  N-6 DNA methylase  37.62 
 
 		 647 aa  324  5e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0768  N-6 DNA methylase  38.48 
 
 		 799 aa  317  5e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2227  N-6 DNA methylase  39.96 
 
 		 371 aa  296  9e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1222  N-6 DNA methylase  39.91 
 
 		 552 aa  293  8e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2256  N-6 DNA methylase  46.37 
 
 		 316 aa  285  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0633793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1365  N-6 DNA methylase  34.19 
 
 		 697 aa  221  5e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518057  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3989  N-6 DNA methylase  44.57 
 
 		 356 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  30.62 
 
 		 574 aa  181  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  30.45 
 
 		 633 aa  181  4.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  29.3 
 
 		 574 aa  180  8e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  30.7 
 
 		 574 aa  179  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  30.52 
 
 		 587 aa  176  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  30.22 
 
 		 508 aa  173  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  30.22 
 
 		 523 aa  173  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  27.39 
 
 		 822 aa  169  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  27.76 
 
 		 505 aa  168  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  26.35 
 
 		 496 aa  167  6.9999999999999995e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  33.55 
 
 		 585 aa  161  4e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  25.21 
 
 		 498 aa  160  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  27.6 
 
 		 495 aa  158  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  27.15 
 
 		 814 aa  157  9e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4043  N-6 DNA methylase  27.29 
 
 		 824 aa  153  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  25.83 
 
 		 500 aa  150  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  25.26 
 
 		 504 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  26 
 
 		 815 aa  148  3e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  26 
 
 		 808 aa  147  6e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0563  type I restriction-modification system, M subunit  27.04 
 
 		 908 aa  147  9e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170311  hitchhiker  0.0000000000000803096 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  25.93 
 
 		 505 aa  147  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  24.84 
 
 		 498 aa  146  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  0.0000000000157011 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3984  N-6 DNA methylase  26.98 
 
 		 505 aa  146  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  27.79 
 
 		 499 aa  146  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  27.39 
 
 		 499 aa  146  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1089  N-6 DNA methylase  24.8 
 
 		 527 aa  145  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4820  N-6 DNA methylase  27.23 
 
 		 496 aa  144  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0990  type I restriction-modification system, M subunit  28.15 
 
 		 501 aa  142  3e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.555022  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0103  N-6 DNA methylase  26.88 
 
 		 493 aa  140  7e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  25.79 
 
 		 522 aa  140  1e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2258  type I restriction-modification system, M subunit  27.16 
 
 		 891 aa  137  5e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2925  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  27.19 
 
 		 708 aa  137  8e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  25.05 
 
 		 503 aa  137  8e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05613  type I restriction-modification system specificity subunit  29.55 
 
 		 873 aa  137  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3427  type I restriction-modification system methylation subunit-like  27.19 
 
 		 504 aa  137  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  24.94 
 
 		 510 aa  134  5e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2348  type I restriction-modification system, M subunit  27.1 
 
 		 505 aa  134  6e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.427504  hitchhiker  0.00993981 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0161  type I restriction-modification system, M subunit  25.1 
 
 		 506 aa  134  9e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0454  type I restriction-modification system, M subunit  27.25 
 
 		 518 aa  133  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0466  type I restriction-modification system, M subunit  27.25 
 
 		 518 aa  133  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3154  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  26.65 
 
 		 508 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>