More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6258 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2201  N-6 DNA methylase  46.15 
 
 		 778 aa  641    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1367  putative DNA methylase HsdM  67.88 
 
 		 793 aa  1089    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2177  N-6 DNA methylase  46.14 
 
 		 793 aa  640    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2941  restriction/modification methyltransferase  76.37 
 
 		 783 aa  1246    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1782  N-6 DNA methylase  66.46 
 
 		 829 aa  1074    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.368234 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003234  type I restriction-modification system DNA-methyltransferase subunit M  67.55 
 
 		 794 aa  1090    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6258  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 787 aa  1628    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2269  type I restriction-modification system DNA methylase  45.31 
 
 		 763 aa  611  1e-173  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0278  type I restriction-modification system, M subunit  45.79 
 
 		 790 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4473  N-6 DNA methylase  44.61 
 
 		 677 aa  585  1.0000000000000001e-165  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1025 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1861  type I restriction-modification system specificity subunit  44.71 
 
 		 710 aa  578  1e-164  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1328  N-6 DNA methylase  38.38 
 
 		 806 aa  525  1e-147  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.909053  normal  0.133174 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1016  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  41.19 
 
 		 680 aa  521  1e-146  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3984  N-6 DNA methylase  39.25 
 
 		 676 aa  500  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  0.0238771 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0776  type I restriction-modification system, M subunit  49.64 
 
 		 636 aa  494  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0115537  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0795  N-6 DNA methylase  39.47 
 
 		 673 aa  495  9.999999999999999e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364287 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3570  N-6 DNA methylase  50 
 
 		 647 aa  489  1e-137  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4253  N-6 DNA methylase  37.96 
 
 		 708 aa  488  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196682  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0841  hypothetical protein  51.84 
 
 		 608 aa  486  1e-136  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0027333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0657  N-6 DNA methylase  49.27 
 
 		 725 aa  476  1e-133  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1480  N-6 DNA methylase  35.53 
 
 		 777 aa  476  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1155  N-6 DNA methylase  36.76 
 
 		 659 aa  462  9.999999999999999e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0234  N-6 DNA methylase  36.09 
 
 		 661 aa  461  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2687  N-6 DNA methylase  36.33 
 
 		 661 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.965628  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2604  N-6 DNA methylase  35.73 
 
 		 728 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.205723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0075  N-6 DNA methylase  35.42 
 
 		 658 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2680  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  35.01 
 
 		 676 aa  445  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.558636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0413  N-6 DNA methylase  35.42 
 
 		 661 aa  445  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.190573  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1792  N-6 DNA methylase  34.73 
 
 		 725 aa  438  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0174866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0276  N-6 DNA methylase  44.65 
 
 		 569 aa  438  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3935  N-6 DNA methylase  45.23 
 
 		 676 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1550  N-6 DNA methylase  35.41 
 
 		 673 aa  428  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.677514 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3359  N-6 DNA methylase  34.92 
 
 		 709 aa  411  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.270263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1222  N-6 DNA methylase  50.22 
 
 		 552 aa  412  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0488  N-6 DNA methylase  44.11 
 
 		 580 aa  409  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19026 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0960  N-6 DNA methylase  41.94 
 
 		 670 aa  408  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2608  N-6 DNA methylase  34.85 
 
 		 683 aa  404  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.648611  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3442  N-6 DNA methylase  43.47 
 
 		 592 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  0.982345 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0751  N-6 DNA methylase  33.5 
 
 		 686 aa  391  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.309292 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4916  N-6 DNA methylase  41.81 
 
 		 607 aa  387  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.660274 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1060  type I restriction-modification  42.99 
 
 		 675 aa  389  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000030221  normal  0.0378969 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1495  N-6 DNA methylase  33.25 
 
 		 661 aa  384  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.304059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0604  type I restriction-modification system, M subunit; N-6 adenine-specific DNA methylase  39.18 
 
 		 655 aa  375  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0641  N-6 DNA methylase  41.02 
 
 		 587 aa  370  1e-101  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1857  N-6 DNA methylase  40.55 
 
 		 611 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.618647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19060  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  39.65 
 
 		 586 aa  361  3e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0947092 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0263  N-6 DNA methylase  40.7 
 
 		 589 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  37.86 
 
 		 663 aa  356  8.999999999999999e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0684916  normal  0.490543 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22800  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  39.1 
 
 		 644 aa  350  6e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.386245 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0192  N-6 DNA methylase  38.36 
 
 		 583 aa  335  3e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341004 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2868  type I restriction-modification system DNA methylase  30.25 
 
 		 675 aa  301  3e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0465984  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4760  type I restriction-modification system DNA methylase  33.94 
 
 		 659 aa  298  2e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.362482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4454  N-6 DNA methylase  34.4 
 
 		 675 aa  279  1e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0768  N-6 DNA methylase  34.3 
 
 		 799 aa  278  3e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1517  N-6 DNA methylase  32.01 
 
 		 691 aa  262  2e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.140297 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2256  N-6 DNA methylase  39.17 
 
 		 316 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0633793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1213  type I restriction-modification system specificity subunit  52.6 
 
 		 196 aa  198  3e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2227  N-6 DNA methylase  53.3 
 
 		 371 aa  197  6e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1365  N-6 DNA methylase  35.44 
 
 		 697 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518057  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  29.69 
 
 		 822 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  32.92 
 
 		 505 aa  150  7e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  28.66 
 
 		 808 aa  150  7e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  27.24 
 
 		 587 aa  150  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  26.6 
 
 		 585 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  27.98 
 
 		 574 aa  149  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  26.63 
 
 		 574 aa  147  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  27.47 
 
 		 574 aa  146  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  27.86 
 
 		 633 aa  145  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1159  N-6 DNA methylase  27.54 
 
 		 516 aa  143  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000301602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05613  type I restriction-modification system specificity subunit  30.29 
 
 		 873 aa  142  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4014  N-6 DNA methylase  27.07 
 
 		 816 aa  142  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4043  N-6 DNA methylase  25.88 
 
 		 824 aa  140  7e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  33.61 
 
 		 496 aa  140  7.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  28.08 
 
 		 522 aa  139  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5009  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  29.38 
 
 		 860 aa  138  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235997 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  26.36 
 
 		 814 aa  137  8e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  33.44 
 
 		 498 aa  137  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  32.59 
 
 		 504 aa  136  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0286  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  26.11 
 
 		 497 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06810  type I restriction enzyme M protein  27.44 
 
 		 526 aa  136  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  27.16 
 
 		 815 aa  134  5e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1644  N-6 DNA methylase  26.47 
 
 		 498 aa  134  6e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4931  type I restriction-modification system, M subunit  30.06 
 
 		 539 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.748503  normal  0.593383 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1896  N-6 DNA methylase  26.22 
 
 		 511 aa  133  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.836046  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2017  N-6 DNA methylase  29.62 
 
 		 517 aa  132  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.54323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  27.8 
 
 		 510 aa  132  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0563  type I restriction-modification system, M subunit  25.5 
 
 		 908 aa  132  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170311  hitchhiker  0.0000000000000803096 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3148  N-6 DNA methylase  28.62 
 
 		 540 aa  132  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  26.38 
 
 		 495 aa  131  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2789  N-6 DNA methylase  30.03 
 
 		 532 aa  131  5.0000000000000004e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3758  N-6 DNA methylase  25.58 
 
 		 511 aa  131  6e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.921564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0034  N-6 DNA methylase  25.54 
 
 		 544 aa  131  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966218 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4262  type I restriction-modification system, M subunit  28.14 
 
 		 527 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  33.98 
 
 		 500 aa  130  7.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12769  type I restriction/modification system DNA methylase hsdM  25 
 
 		 540 aa  130  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0877  putative type I restriction-modification system, M subunit  28.15 
 
 		 529 aa  130  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2453  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  29.36 
 
 		 538 aa  130  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.53896  normal  0.845275 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2273  N-6 DNA methylase  26 
 
 		 522 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.443565  hitchhiker  0.00000125043 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  31.33 
 
 		 505 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1120  type I restriction-modification system specificity subunit  26.96 
 
 		 527 aa  128  3e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>