61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0837 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0837  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  426  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2451  hypothetical protein  61.14 
 
 
201 aa  228  3e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.875999 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1092  hypothetical protein  60 
 
 
223 aa  220  9e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.462205  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3321  hypothetical protein  58.6 
 
 
197 aa  218  3.9999999999999997e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  hitchhiker  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1806  hypothetical protein  56.57 
 
 
220 aa  218  7e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.929401  normal  0.508252 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2260  hypothetical protein  50.25 
 
 
207 aa  187  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0300  hypothetical protein  54.59 
 
 
193 aa  186  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.401229  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1141  hypothetical protein  50 
 
 
204 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343798  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0284  hypothetical protein  47.92 
 
 
187 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1272  hypothetical protein  49.48 
 
 
196 aa  170  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1450  hypothetical protein  45.88 
 
 
203 aa  160  1e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1453  hypothetical protein  46.39 
 
 
203 aa  160  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0825  hypothetical protein  47 
 
 
204 aa  158  5e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0554  hypothetical protein  40.32 
 
 
177 aa  155  3e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2720  hypothetical protein  41.59 
 
 
232 aa  154  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1423  hypothetical protein  46.7 
 
 
190 aa  152  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0723696  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2239  hypothetical protein  43.62 
 
 
193 aa  150  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.892224 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1068  hypothetical protein  44.15 
 
 
179 aa  149  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0377724 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1136  hypothetical protein  40.21 
 
 
192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2426  hypothetical protein  45.9 
 
 
249 aa  145  3e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.763748  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0472  protein of unknown function DUF1568  42.78 
 
 
185 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2688  hypothetical protein  43.06 
 
 
239 aa  145  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968577  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1024  hypothetical protein  40.22 
 
 
163 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0275616 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3252  hypothetical protein  41.58 
 
 
174 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0995  hypothetical protein  40.22 
 
 
163 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0459  protein of unknown function DUF1568  41.67 
 
 
219 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1123  hypothetical protein  42.33 
 
 
198 aa  143  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1527  hypothetical protein  41.98 
 
 
199 aa  141  9e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0508  hypothetical protein  40.93 
 
 
197 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1035  hypothetical protein  40.3 
 
 
224 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2844  hypothetical protein  40.98 
 
 
168 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0315  hypothetical protein  42.41 
 
 
197 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0181  hypothetical protein  41.24 
 
 
200 aa  125  5e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1529  hypothetical protein  37.3 
 
 
192 aa  124  9e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2335  hypothetical protein  41.36 
 
 
198 aa  124  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000417097  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0440  hypothetical protein  37.89 
 
 
251 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0544  hypothetical protein  37.9 
 
 
221 aa  114  7.999999999999999e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1437  hypothetical protein  35.18 
 
 
200 aa  99.8  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0779  hypothetical protein  56.1 
 
 
107 aa  97.4  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0555  hypothetical protein  40.78 
 
 
127 aa  97.4  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1350  hypothetical protein  26.94 
 
 
258 aa  92.4  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0718437  normal  0.104355 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4519  hypothetical protein  39.33 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2775  hypothetical protein  43.66 
 
 
129 aa  58.5  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.963752  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1133  hypothetical protein  43.86 
 
 
153 aa  55.8  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000547954  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0243  hypothetical protein  26.01 
 
 
178 aa  54.3  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.273479  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1351  hypothetical protein  35.38 
 
 
165 aa  50.8  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0430442  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1352  hypothetical protein  35.38 
 
 
172 aa  51.2  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0376314  normal  0.0977946 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0943  protein of unknown function DUF1568  28.12 
 
 
163 aa  48.9  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1952  hypothetical protein  25.93 
 
 
178 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1473  transposase, putative  28.99 
 
 
179 aa  46.6  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1855  hypothetical protein  26.95 
 
 
175 aa  46.2  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0311  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  25.38 
 
 
1372 aa  46.2  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.220801 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0337  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  25.76 
 
 
1345 aa  46.2  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.038664  normal  0.920027 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4226  hypothetical protein  27.44 
 
 
177 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.853067  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4373  hypothetical protein  23.67 
 
 
178 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295832  normal  0.0449373 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4081  hypothetical protein  25.77 
 
 
177 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0580442  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1966  hypothetical protein  25.36 
 
 
231 aa  44.3  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.74185  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2835  hypothetical protein  25.29 
 
 
191 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3702  hypothetical protein  28.24 
 
 
208 aa  41.6  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000809832 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  21.76 
 
 
153 aa  42  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3286  protein of unknown function DUF1568  28.12 
 
 
214 aa  41.6  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00118326  unclonable  0.0000000135739 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>