More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03062 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3244  amino acid/peptide transporter  66.05 
 
 		 495 aa  634    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.950565  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03062  putative proton-dependent peptide transporter  100 
 
 		 483 aa  970    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000506345  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3596  amino acid/peptide transporter  43.84 
 
 		 501 aa  376  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.161382  normal  0.0248648 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4332  amino acid/peptide transporter  42.83 
 
 		 497 aa  371  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0823  amino acid/peptide transporter  40.12 
 
 		 517 aa  350  4e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2925  amino acid/peptide transporter  41.3 
 
 		 528 aa  341  1e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69108  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1881  amino acid/peptide transporter  39.59 
 
 		 517 aa  342  1e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0879055  hitchhiker  0.00292537 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2274  amino acid/peptide transporter  39.75 
 
 		 520 aa  329  8e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000484906 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2335  amino acid/peptide transporter  38.4 
 
 		 524 aa  327  2.0000000000000001e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0988959  normal  0.193339 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1555  proton dependent peptide transporter  38.72 
 
 		 512 aa  325  9e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1664  amino acid/peptide transporter  38.72 
 
 		 512 aa  325  9e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1344  di-/tripeptide transporter  37.29 
 
 		 507 aa  319  5e-86  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.938084  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6851  amino acid/peptide transporter  42.41 
 
 		 498 aa  318  2e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0689877 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  39.58 
 
 		 499 aa  308  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3942  amino acid/peptide transporter  39.53 
 
 		 496 aa  303  3.0000000000000004e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0547773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5954  hypothetical protein  39.23 
 
 		 509 aa  300  3e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0911535  normal  0.0715474 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  39.96 
 
 		 504 aa  276  7e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0757  di-/tripeptide transporter  33.82 
 
 		 517 aa  274  3e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.548363  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1345  di-/tripeptide transporter  34.03 
 
 		 516 aa  274  3e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  37.64 
 
 		 451 aa  273  5.000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  37.75 
 
 		 497 aa  271  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0134  amino acid/peptide transporter  37.69 
 
 		 489 aa  269  7e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0457  hypothetical protein  35.86 
 
 		 446 aa  268  1e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0463  hypothetical protein  35.86 
 
 		 446 aa  268  1e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  36.71 
 
 		 497 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  35.5 
 
 		 527 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  37.45 
 
 		 498 aa  263  4e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0984  dipeptide/tripeptide permease  37.59 
 
 		 483 aa  261  1e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00152732  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  37.09 
 
 		 461 aa  260  4e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  33.81 
 
 		 479 aa  260  4e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0651  proton/peptide symporter family protein  36.42 
 
 		 461 aa  260  4e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000984184  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  34.26 
 
 		 489 aa  259  6e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000317071  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  35.83 
 
 		 462 aa  258  1e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1954  amino acid/peptide transporter  40.14 
 
 		 501 aa  259  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.457543 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  35.6 
 
 		 462 aa  258  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  36.87 
 
 		 461 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  34.93 
 
 		 489 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1397  amino acid/peptide transporter  36.18 
 
 		 489 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128075  normal  0.33376 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  35 
 
 		 516 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  34.72 
 
 		 489 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  34.72 
 
 		 489 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1649  amino acid/peptide transporter  34.07 
 
 		 490 aa  253  6e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000051541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2895  amino acid/peptide transporter  33.67 
 
 		 501 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000544318  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2266  amino acid/peptide transporter  33.2 
 
 		 490 aa  251  2e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000291592  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1421  amino acid/peptide transporter  33.47 
 
 		 494 aa  250  4e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0531  amino acid/peptide transporter  36.06 
 
 		 463 aa  250  4e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0236293  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2868  amino acid/peptide transporter  34.01 
 
 		 495 aa  250  5e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00750801  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1505  amino acid/peptide transporter  33.05 
 
 		 444 aa  249  6e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000267924 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3034  alkaline phosphatase  34.14 
 
 		 491 aa  249  6e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513893  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3037  amino acid/peptide transporter  33.67 
 
 		 501 aa  249  6e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000164206  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1468  amino acid/peptide transporter  33.67 
 
 		 501 aa  249  6e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0523  amino acid/peptide transporter  36.44 
 
 		 463 aa  249  7e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562889  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1444  proton/peptide symporter family protein  36.89 
 
 		 490 aa  249  1e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000293034  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2556  amino acid/peptide transporter  34.92 
 
 		 484 aa  247  4e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0604  amino acid/peptide transporter  37.67 
 
 		 461 aa  246  9e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000192962  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1393  amino acid/peptide transporter  33.4 
 
 		 501 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.825614  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2904  amino acid/peptide transporter  33.54 
 
 		 497 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0580  proton/peptide symporter family protein  37.53 
 
 		 452 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00403619  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0614  proton/peptide symporter family protein  37.53 
 
 		 452 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000352854  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4686  peptide transport protein, POT family  37.87 
 
 		 449 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000138038  hitchhiker  8.70422e-24 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  35.22 
 
 		 516 aa  244  3e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0734  di-/tripeptide transporter  33.18 
 
 		 497 aa  243  3.9999999999999997e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0279102  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0510  permease  35.78 
 
 		 463 aa  243  5e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0528  amino acid/peptide transporter  37.64 
 
 		 449 aa  243  6e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000146171  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3369  proton/peptide symporter family protein  35.49 
 
 		 544 aa  243  6e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31641  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0721  proton/peptide symporter family protein  36.78 
 
 		 461 aa  242  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000879332  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2905  amino acid/peptide transporter  33.54 
 
 		 500 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3792  amino acid/peptide transporter  35.26 
 
 		 482 aa  241  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0641583  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  36.56 
 
 		 461 aa  240  4e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000369558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0524  POT family peptide transport protein  36.73 
 
 		 449 aa  240  5e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.2191900000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0524  POT family peptide transport protein  36.73 
 
 		 449 aa  240  5e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000299815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0600  peptide symporter family protein  36.34 
 
 		 461 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000822499  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  36.34 
 
 		 461 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000039773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  36.34 
 
 		 461 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  36.34 
 
 		 461 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4615  proton/peptide symporter family protein  36.34 
 
 		 461 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000740471  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2545  amino acid/peptide transporter  32.88 
 
 		 501 aa  239  9e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0744  proton/peptide symporter family protein  36.34 
 
 		 461 aa  239  9e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000387987 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0817  proton/peptide symporter family protein  36.12 
 
 		 461 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000167379  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1927  amino acid/peptide transporter  37.44 
 
 		 464 aa  238  2e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1058  amino acid/peptide transporter  36.61 
 
 		 467 aa  237  3e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0521  dipeptide/tripeptide permease  34.99 
 
 		 498 aa  237  4e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000167951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0955  amino acid/peptide transporter  34.29 
 
 		 510 aa  236  7e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334898  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04805  proton/peptide symporter family protein  31.28 
 
 		 533 aa  236  7e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0750  amino acid/peptide transporter  32.21 
 
 		 501 aa  235  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.603499  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0742  proton/peptide symporter family protein  37.18 
 
 		 395 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0767  amino acid/peptide transporter  32.21 
 
 		 501 aa  235  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0277  amino acid/peptide transporter  35.67 
 
 		 499 aa  234  2.0000000000000002e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000259644  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2746  amino acid/peptide transporter  35.06 
 
 		 482 aa  229  7e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.210246  normal  0.74954 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1105  alkaline phosphatase  34.1 
 
 		 544 aa  229  8e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.377732 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4252  amino acid/peptide transporter  35.96 
 
 		 486 aa  227  4e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1074  di-tripeptide ABC transporter membrane protein  33.41 
 
 		 510 aa  227  5.0000000000000005e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17650  amino acid/peptide transporter (peptide:H symporter)  34.32 
 
 		 511 aa  220  3.9999999999999997e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1551  amino acid/peptide transporter  33.85 
 
 		 539 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1555  amino acid/peptide transporter  33.85 
 
 		 539 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2795  amino acid/peptide transporter  34.19 
 
 		 539 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.274379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0922  amino acid/peptide transporter  31.32 
 
 		 477 aa  218  2.9999999999999998e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000322625  unclonable  8.27442e-19 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1585  amino acid/peptide transporter  34.19 
 
 		 539 aa  217  4e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0392  di-tripeptide transporter, putative  32.58 
 
 		 501 aa  216  5e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3773  amino acid/peptide transporter  33.62 
 
 		 471 aa  217  5e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>