More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1684 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1684  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  100 
 
 		 248 aa  509  1e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  48.78 
 
 		 260 aa  227  1e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000326151  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  35.18 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  33.2 
 
 		 274 aa  122  5e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0358  cinnamoyl ester hydrolase  32.54 
 
 		 281 aa  115  6e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17390  hypothetical protein  37.56 
 
 		 268 aa  103  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  31.51 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  30.7 
 
 		 261 aa  92.8  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  27.91 
 
 		 259 aa  88.6  9e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0322  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  25.94 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000337661  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  28.79 
 
 		 255 aa  81.6  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3320  putative hydrolase  24.48 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.859437  normal  0.797481 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25940  hypothetical protein  28.11 
 
 		 214 aa  75.1  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.375139 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0929  putative hydrolase  26.8 
 
 		 252 aa  72.4  0.000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.119531  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0212  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  26.87 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0544  hypothetical protein  26.05 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00193081  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0700  hypothetical protein  26.05 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000140392  hitchhiker  0.000000000902529 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2237  hypothetical protein  25.1 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2838  hypothetical protein  31.62 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0121852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3237  hypothetical protein  31.62 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3126  hypothetical protein  26.45 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3372  hypothetical protein  26.45 
 
 		 341 aa  63.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0891  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 		 274 aa  62  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  25.21 
 
 		 311 aa  62  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 		 273 aa  62  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3343  hypothetical protein  26.58 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.975652  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0808  hypothetical protein  30.5 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.324402  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  27.37 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3112  hypothetical protein  26.13 
 
 		 337 aa  59.3  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.200391  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2843  hypothetical protein  24.8 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0732715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3325  hypothetical protein  26.7 
 
 		 317 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  31.91 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3018  hypothetical protein  24.43 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.277726  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0444  hypothetical protein  31.91 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.082475  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2097  hypothetical protein  31.91 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.172355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3963  hypothetical protein  29.08 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2258  hypothetical protein  30.5 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2030  hypothetical protein  29.08 
 
 		 220 aa  57  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1610  putative alpha/beta hydrolase domain protein  27.66 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0158907 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3348  hypothetical protein  25.68 
 
 		 339 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.077916  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  27.46 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_004310  BR0929  hypothetical protein  29.79 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.172272  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0963  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 374 aa  56.2  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0623938  hitchhiker  0.00346396 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0923  hypothetical protein  29.79 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.60534  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3346  hypothetical protein  25.68 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2367  hypothetical protein  29.08 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.560308  normal  0.32794 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1470  hypothetical protein  27.16 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.473504  normal  0.0195157 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3801  alpha/beta hydrolase fold protein  25.21 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0096  hypothetical protein  28.37 
 
 		 230 aa  55.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.596881  normal  0.945434 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3047  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  27.71 
 
 		 322 aa  54.7  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0033788  normal  0.0365868 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2959  hypothetical protein  28.37 
 
 		 219 aa  55.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1239  hypothetical protein  30.5 
 
 		 217 aa  55.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  29.91 
 
 		 292 aa  54.7  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2740  hypothetical protein  28.47 
 
 		 215 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.194803  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  22.84 
 
 		 415 aa  54.7  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  25.11 
 
 		 284 aa  54.3  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  28.16 
 
 		 305 aa  53.9  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0472  putative hydrolase  25.49 
 
 		 279 aa  53.9  0.000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.465833  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  21.59 
 
 		 254 aa  53.9  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  34.07 
 
 		 402 aa  53.5  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1713  alpha/beta hydrolase fold protein  23.98 
 
 		 267 aa  53.5  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  27.67 
 
 		 259 aa  53.1  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1634  putative alpha/beta hydrolase  29.79 
 
 		 217 aa  53.1  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000174471 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4471  hypothetical protein  27.66 
 
 		 223 aa  52.8  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71583 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1939  lysophospholipase L2, putative  25.6 
 
 		 250 aa  52.8  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2996  hypothetical protein  27.66 
 
 		 215 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0535528 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2454  hypothetical protein  27.66 
 
 		 215 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1783  hypothetical protein  27.66 
 
 		 224 aa  52.8  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.025534  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2450  hypothetical protein  28.24 
 
 		 258 aa  52.4  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13780  alpha/beta hydrolase family protein  26.79 
 
 		 451 aa  52.4  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1666  hypothetical protein  27.66 
 
 		 215 aa  52.8  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.622986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2330  hypothetical protein  27.66 
 
 		 215 aa  52.4  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2109  putative alpha/beta hydrolase protein  27.66 
 
 		 225 aa  52.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0628011 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1902  putative alpha/beta hydrolase protein  27.66 
 
 		 225 aa  52.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149979 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2478  hypothetical protein  32.09 
 
 		 442 aa  52  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.991617 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1067  hypothetical protein  37.97 
 
 		 145 aa  52  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0889291  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3674  Acylglycerol lipase  23.74 
 
 		 280 aa  52  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  36.52 
 
 		 412 aa  52  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6145  peptidase S15  33.01 
 
 		 380 aa  52  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000966122  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05175  alpha/beta hydrolase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07060)  32.32 
 
 		 405 aa  51.6  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0627526  normal  0.0627844 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  22.43 
 
 		 363 aa  51.6  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1289  hypothetical protein  27.82 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.506664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  28.29 
 
 		 318 aa  51.6  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2799  hydrolase  26.95 
 
 		 218 aa  52  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0285215  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 253 aa  52  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2433  hypothetical protein  26.54 
 
 		 225 aa  52  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0301699  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  36.14 
 
 		 408 aa  51.6  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0501  hypothetical protein  29.84 
 
 		 436 aa  51.6  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.672777  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0099  alpha/beta fold family hydrolase  27.35 
 
 		 220 aa  51.6  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000675213 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  21.49 
 
 		 343 aa  51.2  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03205  Alpha/beta superfamily hydrolase  22.08 
 
 		 281 aa  50.8  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1093  hypothetical protein  27.82 
 
 		 219 aa  51.2  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.408425 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  24.1 
 
 		 271 aa  50.8  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1592  peptidase S15  30.28 
 
 		 580 aa  50.8  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000232254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2516  alpha/beta superfamily hydrolase  34.41 
 
 		 634 aa  50.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0300353 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1199  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 		 290 aa  50.1  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3482  hypothetical protein  35.71 
 
 		 272 aa  50.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00930264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3265  hypothetical protein  26.24 
 
 		 218 aa  49.7  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1310  hypothetical protein  26.24 
 
 		 227 aa  49.7  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.305066  normal  0.638588 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1283  hypothetical protein  31.3 
 
 		 224 aa  49.7  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0971816  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>