295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0521 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0277  amino acid/peptide transporter  74.95 
 
 		 499 aa  741    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000259644  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0521  dipeptide/tripeptide permease  100 
 
 		 498 aa  999    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000167951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0984  dipeptide/tripeptide permease  57.84 
 
 		 483 aa  538  1e-151  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00152732  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1444  proton/peptide symporter family protein  56.36 
 
 		 490 aa  524  1e-147  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000293034  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  50.61 
 
 		 497 aa  497  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2868  amino acid/peptide transporter  50.6 
 
 		 495 aa  498  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00750801  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  50 
 
 		 497 aa  484  1e-135  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  51.93 
 
 		 498 aa  474  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0734  di-/tripeptide transporter  47.8 
 
 		 497 aa  446  1.0000000000000001e-124  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0279102  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0750  amino acid/peptide transporter  45.14 
 
 		 501 aa  417  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.603499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0767  amino acid/peptide transporter  45.14 
 
 		 501 aa  417  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0392  di-tripeptide transporter, putative  43.39 
 
 		 501 aa  389  1e-107  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  41.38 
 
 		 499 aa  366  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5954  hypothetical protein  42.57 
 
 		 509 aa  358  1.9999999999999998e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0911535  normal  0.0715474 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4252  amino acid/peptide transporter  38.65 
 
 		 486 aa  326  7e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3942  amino acid/peptide transporter  38.76 
 
 		 496 aa  325  8.000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0547773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3792  amino acid/peptide transporter  37.78 
 
 		 482 aa  318  1e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0641583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0134  amino acid/peptide transporter  38.57 
 
 		 489 aa  315  9.999999999999999e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2556  amino acid/peptide transporter  38.11 
 
 		 484 aa  313  3.9999999999999997e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2746  amino acid/peptide transporter  36.89 
 
 		 482 aa  304  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.210246  normal  0.74954 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1954  amino acid/peptide transporter  37.91 
 
 		 501 aa  295  1e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.457543 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3596  amino acid/peptide transporter  36.27 
 
 		 501 aa  290  3e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.161382  normal  0.0248648 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4332  amino acid/peptide transporter  35.29 
 
 		 497 aa  289  7e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17650  amino acid/peptide transporter (peptide:H symporter)  36.51 
 
 		 511 aa  281  1e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3244  amino acid/peptide transporter  35.35 
 
 		 495 aa  280  3e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.950565  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0823  amino acid/peptide transporter  36.44 
 
 		 517 aa  272  8.000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1881  amino acid/peptide transporter  36.38 
 
 		 517 aa  271  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0879055  hitchhiker  0.00292537 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6851  amino acid/peptide transporter  35.89 
 
 		 498 aa  262  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0689877 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1393  amino acid/peptide transporter  33.78 
 
 		 501 aa  254  3e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.825614  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1664  amino acid/peptide transporter  35.85 
 
 		 512 aa  249  8e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1555  proton dependent peptide transporter  35.85 
 
 		 512 aa  249  8e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2925  amino acid/peptide transporter  35.68 
 
 		 528 aa  248  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69108  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  32.6 
 
 		 462 aa  247  3e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  32.21 
 
 		 462 aa  247  4e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2274  amino acid/peptide transporter  34.51 
 
 		 520 aa  246  4.9999999999999997e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000484906 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1344  di-/tripeptide transporter  31.84 
 
 		 507 aa  246  6e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.938084  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1468  amino acid/peptide transporter  33.27 
 
 		 501 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3037  amino acid/peptide transporter  33.27 
 
 		 501 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000164206  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2895  amino acid/peptide transporter  33.21 
 
 		 501 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000544318  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1505  amino acid/peptide transporter  30.69 
 
 		 444 aa  244  3e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000267924 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2545  amino acid/peptide transporter  33.65 
 
 		 501 aa  241  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  33.46 
 
 		 489 aa  238  2e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000317071  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2905  amino acid/peptide transporter  32.7 
 
 		 500 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2335  amino acid/peptide transporter  34.6 
 
 		 524 aa  237  4e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0988959  normal  0.193339 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03062  putative proton-dependent peptide transporter  35.21 
 
 		 483 aa  237  4e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000506345  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0463  hypothetical protein  32.19 
 
 		 446 aa  236  5.0000000000000005e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0457  hypothetical protein  32.19 
 
 		 446 aa  236  5.0000000000000005e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3034  alkaline phosphatase  32.76 
 
 		 491 aa  234  3e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513893  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0757  di-/tripeptide transporter  29.77 
 
 		 517 aa  231  3e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.548363  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  32.88 
 
 		 489 aa  230  4e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1345  di-/tripeptide transporter  29.66 
 
 		 516 aa  229  6e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1649  amino acid/peptide transporter  32.37 
 
 		 490 aa  229  6e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000051541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  31.98 
 
 		 489 aa  228  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  31.98 
 
 		 489 aa  228  2e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  31.49 
 
 		 479 aa  226  6e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  32.1 
 
 		 451 aa  226  7e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2266  amino acid/peptide transporter  31.01 
 
 		 490 aa  225  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000291592  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1397  amino acid/peptide transporter  31.6 
 
 		 489 aa  224  3e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128075  normal  0.33376 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1551  amino acid/peptide transporter  32.41 
 
 		 539 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1555  amino acid/peptide transporter  32.47 
 
 		 539 aa  220  5e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0945  amino acid/peptide transporter  32.2 
 
 		 534 aa  220  5e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.985856  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2795  amino acid/peptide transporter  31.93 
 
 		 539 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.274379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1585  amino acid/peptide transporter  32.47 
 
 		 539 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0955  amino acid/peptide transporter  33.97 
 
 		 510 aa  217  4e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334898  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1074  di-tripeptide ABC transporter membrane protein  34.47 
 
 		 510 aa  214  2.9999999999999995e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0523  amino acid/peptide transporter  30.3 
 
 		 463 aa  213  7.999999999999999e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562889  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0615  proton/peptide symporter family protein  31.99 
 
 		 492 aa  212  1e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0834  amino acid/peptide transporter  30.8 
 
 		 432 aa  212  1e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  normal  0.033682 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  34.81 
 
 		 516 aa  212  1e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1572  di-/tripeptide transporter  31.99 
 
 		 492 aa  211  2e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.827276  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0721  proton/peptide symporter family protein  29.82 
 
 		 461 aa  211  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000879332  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  31.68 
 
 		 516 aa  210  4e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4615  proton/peptide symporter family protein  29.41 
 
 		 461 aa  210  4e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000740471  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  29.21 
 
 		 461 aa  209  9e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000369558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  29.21 
 
 		 461 aa  209  9e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000039773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  29.21 
 
 		 461 aa  209  9e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  29.21 
 
 		 461 aa  209  9e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  30.86 
 
 		 527 aa  209  9e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0600  peptide symporter family protein  29.21 
 
 		 461 aa  209  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000822499  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0604  amino acid/peptide transporter  29.01 
 
 		 461 aa  209  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000192962  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0817  proton/peptide symporter family protein  29.21 
 
 		 461 aa  208  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000167379  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0744  proton/peptide symporter family protein  29.01 
 
 		 461 aa  207  4e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000387987 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0531  amino acid/peptide transporter  27.72 
 
 		 463 aa  204  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0236293  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  33.05 
 
 		 504 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  26.76 
 
 		 461 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04805  proton/peptide symporter family protein  30.07 
 
 		 533 aa  200  3.9999999999999996e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1105  alkaline phosphatase  30.74 
 
 		 544 aa  200  6e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.377732 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3773  amino acid/peptide transporter  28.85 
 
 		 471 aa  199  9e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0652  tripeptide permease TppB  29.39 
 
 		 504 aa  199  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.068993  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1525  di-/tripeptide transporter  29.39 
 
 		 528 aa  198  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0251804  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  27.9 
 
 		 461 aa  196  7e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4508  amino acid/peptide transporter  31.74 
 
 		 507 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0182547  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1927  amino acid/peptide transporter  30.5 
 
 		 464 aa  193  7e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3675  Dipeptide/tripeptide permease-like protein  29.15 
 
 		 520 aa  192  9e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290329  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3369  proton/peptide symporter family protein  30.21 
 
 		 544 aa  192  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31641  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04219  di-tripeptide transporter  33.12 
 
 		 502 aa  191  4e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189754  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3194.1  peptide transporter  34.51 
 
 		 324 aa  190  5e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4686  peptide transport protein, POT family  27.63 
 
 		 449 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000138038  hitchhiker  8.70422e-24 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0524  POT family peptide transport protein  27.63 
 
 		 449 aa  189  7e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.2191900000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0524  POT family peptide transport protein  27.63 
 
 		 449 aa  189  7e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000299815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>