More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3873 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3873  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 257 aa  508  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422733 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01390  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  65.61 
 
 		 251 aa  327  1.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.253341 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5382  short chain dehydrogenase  52.55 
 
 		 256 aa  262  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5001  short chain dehydrogenase  52.55 
 
 		 256 aa  262  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5089  short chain dehydrogenase  52.55 
 
 		 256 aa  262  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.415289 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13825  short chain dehydrogenase  52.16 
 
 		 254 aa  258  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1177  short chain dehydrogenase  51.72 
 
 		 260 aa  250  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.39 
 
 		 251 aa  248  9e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.150929 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5628  short chain dehydrogenase  50.57 
 
 		 260 aa  246  3e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.41 
 
 		 253 aa  238  9e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29884  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 		 254 aa  237  1e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.6 
 
 		 249 aa  207  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22830  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  45.49 
 
 		 247 aa  194  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.702609 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48 
 
 		 250 aa  186  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2462  putative short chain dehydrogenase  47.18 
 
 		 255 aa  186  4e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3435  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.13 
 
 		 249 aa  180  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.907428  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.03 
 
 		 247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0680281  normal  0.231101 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.108863  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3135  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.44 
 
 		 246 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12109  short-chain type dehydrogenase  42.04 
 
 		 249 aa  161  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0969854  normal  0.809118 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2832  short chain dehydrogenase  40.41 
 
 		 244 aa  158  9e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0580098  normal  0.214495 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.362714  normal  0.975867 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4050  short chain dehydrogenase  36.59 
 
 		 243 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.119249  normal  0.0322229 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4024  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 		 247 aa  149  6e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0286474  normal  0.0317437 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2567  short chain dehydrogenase  36.99 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0171  short chain dehydrogenase  37.25 
 
 		 246 aa  146  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.808724 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 		 252 aa  141  9e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1219  short chain dehydrogenase  32.65 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03335  putative oxidoreductase  34.68 
 
 		 240 aa  137  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.472323  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0143  short chain dehydrogenase  33.88 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.896795 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1950  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 		 246 aa  136  4e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.26 
 
 		 254 aa  135  7.000000000000001e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.904003  normal  0.571542 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1597  short chain dehydrogenase  38.87 
 
 		 245 aa  132  6e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139184  normal  0.109463 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2164  short chain dehydrogenase  36.47 
 
 		 247 aa  129  6e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2273  short chain dehydrogenase  34.01 
 
 		 246 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.869936  normal  0.452458 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.39 
 
 		 247 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.500614 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3786  short chain dehydrogenase  35.06 
 
 		 246 aa  125  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7180  short chain dehydrogenase  36.14 
 
 		 248 aa  123  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6249  short chain dehydrogenase  31.3 
 
 		 245 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2301  short chain dehydrogenase  32.52 
 
 		 246 aa  122  7e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00458311  hitchhiker  0.00750193 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0896  short chain dehydrogenase  34.39 
 
 		 246 aa  122  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.15 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.54 
 
 		 248 aa  118  7e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3976  short chain dehydrogenase  36.65 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00930617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5791  short chain dehydrogenase  34.92 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 		 255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.376241  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1026  short chain dehydrogenase  32.93 
 
 		 270 aa  108  6e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.969015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1708  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.82 
 
 		 250 aa  105  8e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.361807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.91 
 
 		 245 aa  100  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0498  short chain dehydrogenase  29.67 
 
 		 243 aa  98.2  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.795397 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.15 
 
 		 241 aa  97.1  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.914636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.3 
 
 		 249 aa  95.5  8e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.726547  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.49 
 
 		 254 aa  86.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.23 
 
 		 254 aa  86.7  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.3 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.9 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.786749  normal  0.588294 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01434  Short chain dehydrogenase family protein  27.64 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2801  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.64 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2296  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.69 
 
 		 238 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0366896 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0117  short chain dehydrogenase  28.11 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2218  short chain dehydrogenase  23.44 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.74 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0361  short chain dehydrogenase  30.61 
 
 		 244 aa  72  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000319132  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0621  hypothetical protein  27.27 
 
 		 248 aa  71.6  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4895  short chain dehydrogenase  27.95 
 
 		 258 aa  71.6  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000739396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0469  short chain dehydrogenase  25.69 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1537  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.36 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0604  hypothetical protein  27.27 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200417  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1759  hypothetical protein  30.51 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.26 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01070  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.42 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.256883 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6048  short chain dehydrogenase  31.71 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.549002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.94 
 
 		 247 aa  67  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1857  short chain dehydrogenase  28.51 
 
 		 245 aa  67  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.960393 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.97 
 
 		 247 aa  67  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.425796  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33490  short-chain alcohol dehydrogenase  29.95 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.343117  normal  0.392445 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0408  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.83 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2361  short chain dehydrogenase  27.31 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.96 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2238  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.38 
 
 		 317 aa  65.9  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0946  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.97 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.841301 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1759  hypothetical protein  29.66 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3968  short chain dehydrogenase  28.38 
 
 		 269 aa  65.5  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0231224  normal  0.018096 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8710  Short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity-like protein  30 
 
 		 258 aa  65.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.98 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.33 
 
 		 242 aa  65.1  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.61 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.25 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.646056  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0916  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.85 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5291  short chain dehydrogenase  28.22 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5878  gluconate 5-dehydrogenase  27.98 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.854497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1138  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.46 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.697899  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0885  short chain dehydrogenase  25.31 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0517  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.92 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3408  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.77 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>