More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3055 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 		 243 aa  488  1e-137  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00900  dienelactone hydrolase-like enzyme  57.2 
 
 		 241 aa  266  2e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  48.02 
 
 		 227 aa  193  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  47.03 
 
 		 227 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4229  Carboxymethylenebutenolidase  41.53 
 
 		 238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4117  Carboxymethylenebutenolidase  41.53 
 
 		 238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.63682  normal  0.0814825 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  37.17 
 
 		 254 aa  145  5e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1276  carboxymethylenebutenolidase  42.73 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04764  putative transmembrane protein  41.95 
 
 		 238 aa  142  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05691  putative transmembrane protein  41.95 
 
 		 238 aa  142  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3231  dienelactone hydrolase  44.5 
 
 		 228 aa  140  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.891917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6385  carboxymethylenebutenolidase  38.96 
 
 		 234 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4378  carboxymethylenebutenolidase  41.3 
 
 		 230 aa  140  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.112691 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4121  Carboxymethylenebutenolidase  38.86 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5994  carboxymethylenebutenolidase  38.86 
 
 		 237 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5750  carboxymethylenebutenolidase  39.3 
 
 		 237 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588229  normal  0.622374 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0548  carboxymethylenebutenolidase  37.99 
 
 		 235 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.833541 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4061  carboxymethylenebutenolidase  40.28 
 
 		 236 aa  137  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.86952  normal  0.797437 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5328  carboxymethylenebutenolidase  38.82 
 
 		 237 aa  137  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0616123 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1304  carboxymethylenebutenolidase  40.09 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1202  carboxymethylenebutenolidase  39.65 
 
 		 224 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6610  carboxymethylenebutenolidase  37.99 
 
 		 237 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1386  Carboxymethylenebutenolidase  39.04 
 
 		 224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670188  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6683  carboxymethylenebutenolidase  37.83 
 
 		 237 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00301563  normal  0.110469 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5840  carboxymethylenebutenolidase  37.39 
 
 		 237 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.163865  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6207  carboxymethylenebutenolidase  37.39 
 
 		 237 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00179618 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0926  carboxymethylenebutenolidase  39.47 
 
 		 246 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2303  putative carboxymethylenebutenolidase  37.44 
 
 		 224 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  35.4 
 
 		 296 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0841  dienelactone hydrolase  39.83 
 
 		 228 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.540975  normal  0.335069 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1199  Carboxymethylenebutenolidase  31.53 
 
 		 214 aa  116  3.9999999999999997e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  35.45 
 
 		 292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  37.23 
 
 		 291 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39889  predicted protein  36.61 
 
 		 240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  35.62 
 
 		 232 aa  112  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  32 
 
 		 407 aa  112  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  33.94 
 
 		 290 aa  111  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  32.16 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  33.18 
 
 		 290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  36.99 
 
 		 295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  36.24 
 
 		 234 aa  109  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  34.5 
 
 		 291 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3288  carboxymethylenebutenolidase  36.36 
 
 		 307 aa  108  9.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  33.05 
 
 		 410 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  36.24 
 
 		 295 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  35.93 
 
 		 291 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  34.72 
 
 		 230 aa  106  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  30.67 
 
 		 407 aa  106  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  34.5 
 
 		 295 aa  105  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  34.5 
 
 		 295 aa  105  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5500  dienelactone hydrolase  30.2 
 
 		 292 aa  105  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000914876  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  34.06 
 
 		 254 aa  105  9e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  34.26 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  34.26 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0735  carboxymethylenebutenolidase  37.07 
 
 		 296 aa  104  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  36.24 
 
 		 296 aa  103  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  34.06 
 
 		 295 aa  103  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  33.78 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  33.94 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  34.26 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001605  dienelactone hydrolase family  33.76 
 
 		 305 aa  102  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  36.82 
 
 		 295 aa  102  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2091  carboxymethylenebutenolidase  36.07 
 
 		 303 aa  102  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  36.09 
 
 		 295 aa  102  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  32.88 
 
 		 232 aa  102  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2950  Carboxymethylenebutenolidase  36 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4024  twin-arginine translocation pathway signal  28.07 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1756  Carboxymethylenebutenolidase  32.76 
 
 		 291 aa  101  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  34.39 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3834  dienelactone hydrolase family protein  34.39 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356995  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3413  dienelactone hydrolase family protein  34.39 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.934398  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0053  dienelactone hydrolase  34.39 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3160  carboxymethylenebutenolidase  34.1 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.300765  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  34.39 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3138  dienelactone hydrolase family protein  34.39 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  34.39 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  35.96 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3327  carboxymethylenebutenolidase  34.93 
 
 		 295 aa  99.8  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3316  carboxymethylenebutenolidase  34.93 
 
 		 297 aa  99.8  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0813595  normal  0.0640539 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05585  hypothetical protein  34.21 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  30.84 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2668  Carboxymethylenebutenolidase  34.93 
 
 		 297 aa  99.8  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  32.31 
 
 		 291 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  33.05 
 
 		 299 aa  99.8  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5324  carboxymethylenebutenolidase  34.98 
 
 		 298 aa  99.4  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6635  Carboxymethylenebutenolidase  36.68 
 
 		 295 aa  99  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  34.04 
 
 		 420 aa  99  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0111  carboxymethylenebutenolidase  33.02 
 
 		 232 aa  99  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2697  carboxymethylenebutenolidase  30.64 
 
 		 236 aa  98.6  7e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1016  Carboxymethylenebutenolidase  33.63 
 
 		 250 aa  98.6  8e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387888 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2733  carboxymethylenebutenolidase  33.06 
 
 		 290 aa  98.2  9e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0898  dienelactone hydrolase  38.36 
 
 		 228 aa  98.2  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0905953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  32.31 
 
 		 291 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37970  Dienelactone hydrolase-like protein  38.27 
 
 		 295 aa  98.2  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0184  carboxymethylenebutenolidase  34.86 
 
 		 230 aa  97.4  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.604168  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5771  carboxymethylenebutenolidase  33.61 
 
 		 248 aa  97.1  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  34.7 
 
 		 297 aa  97.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1943  carboxymethylenebutenolidase  32.74 
 
 		 302 aa  97.4  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0524201  normal  0.0241824 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  28.32 
 
 		 247 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0997  dienelactone hydrolase-related protein  29.15 
 
 		 285 aa  97.8  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.107963 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>