224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1282 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1282  Thioredoxin domain  100 
 
 
319 aa  607  1e-172  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00790933  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2594  thioredoxin domain-containing protein  44.91 
 
 
339 aa  225  9e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.238157  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2327  thioredoxin domain protein  44.05 
 
 
334 aa  223  3e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28937e-05 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1092  Thioredoxin domain protein  50.32 
 
 
310 aa  220  2e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.509026  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1333  Thioredoxin domain protein  48.48 
 
 
311 aa  209  4e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1730  putative thioredoxin domain-containing protein  44.24 
 
 
313 aa  209  7e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2422  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.98 
 
 
319 aa  200  3e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1804  thioredoxin domain-containing protein  47.86 
 
 
314 aa  194  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1276  thioredoxin domain protein  44.96 
 
 
337 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10300  thioredoxin domain-containing protein  45.23 
 
 
313 aa  190  3e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3886  Thioredoxin domain protein  44.09 
 
 
312 aa  184  1e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.54182  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  43.04 
 
 
297 aa  179  5e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0921  thioredoxin domain-containing protein  43.73 
 
 
301 aa  173  4e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.460441 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09500  thioredoxin domain-containing protein  37.02 
 
 
346 aa  169  7e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.460116  normal  0.88242 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08240  thioredoxin domain-containing protein  40.52 
 
 
324 aa  162  9e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1704  thioredoxin domain protein  38.82 
 
 
310 aa  159  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.143587 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3607  thioredoxin domain-containing protein  42.71 
 
 
300 aa  158  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0364  putative thioredoxin  40.37 
 
 
320 aa  155  9e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.163537  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3988  thioredoxin domain-containing protein  42.18 
 
 
300 aa  155  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000709703 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4105  Thioredoxin domain protein  44.09 
 
 
321 aa  151  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28500  thioredoxin  40.88 
 
 
299 aa  150  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2392  putative thioredoxin  43.17 
 
 
309 aa  146  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1925  Thioredoxin domain-containing protein  39.19 
 
 
299 aa  144  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0139  hypothetical protein  32.52 
 
 
340 aa  144  2e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6079  thioredoxin domain protein  40.5 
 
 
326 aa  141  2e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19060  thioredoxin domain-containing protein  39.85 
 
 
299 aa  139  6e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.595284  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1048  thioredoxin domain-containing protein  39.81 
 
 
331 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157412  normal  0.991017 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1954  Thioredoxin domain protein  36.26 
 
 
313 aa  132  6e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3683  thioredoxin-related  40.64 
 
 
329 aa  131  1e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2342  thioredoxin domain-containing protein  37.81 
 
 
298 aa  126  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.299917  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1117  thioredoxin-related protein  36.73 
 
 
324 aa  125  1e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3862  thioredoxin domain-containing protein  35.16 
 
 
299 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3848  thioredoxin domain-containing protein  35.16 
 
 
299 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00807359 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3936  thioredoxin domain-containing protein  35.16 
 
 
299 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4303  thioredoxin domain-containing protein  34.98 
 
 
297 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.408854  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3098  thioredoxin  39.03 
 
 
333 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  3.2408e-10  hitchhiker  2.2841e-06 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11356  thioredoxin  32.06 
 
 
304 aa  105  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.75127e-15  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1268  Thioredoxin domain protein  37.29 
 
 
323 aa  97.8  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  29.77 
 
 
289 aa  84.7  2e-15  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  29.41 
 
 
293 aa  84.3  3e-15  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  28.87 
 
 
287 aa  82.8  6e-15  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  30.39 
 
 
293 aa  82  1e-14  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  27.42 
 
 
334 aa  80.5  3e-14  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  29.73 
 
 
289 aa  80.1  4e-14  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2254  Thioredoxin domain  29.26 
 
 
338 aa  80.1  5e-14  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.526752 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  27.1 
 
 
324 aa  78.6  1e-13  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  27.74 
 
 
324 aa  79  1e-13  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  29.15 
 
 
289 aa  78.2  2e-13  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  3.84652e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0054  thioredoxin domain-containing protein  29.35 
 
 
311 aa  77.8  2e-13  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  28.36 
 
 
281 aa  76.6  5e-13  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  28.8 
 
 
302 aa  76.3  6e-13  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  27.62 
 
 
287 aa  75.9  9e-13  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  26.3 
 
 
285 aa  75.5  1e-12  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  28.76 
 
 
290 aa  74.7  2e-12  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1269  putative thioredoxin  28 
 
 
289 aa  73.6  4e-12  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3161  thioredoxin domain-containing protein  28 
 
 
289 aa  73.6  4e-12  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.324735  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3023  putative thioredoxin  28 
 
 
289 aa  73.6  4e-12  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5094  thioredoxin  36.7 
 
 
306 aa  72.8  8e-12  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.443129  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0266  thioredoxin  29.29 
 
 
301 aa  72  1e-11  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  27.46 
 
 
290 aa  71.6  2e-11  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  31.51 
 
 
286 aa  70.9  3e-11  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  26.23 
 
 
281 aa  70.5  3e-11  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  28.01 
 
 
302 aa  70.5  4e-11  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  27.61 
 
 
290 aa  70.1  5e-11  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  27.61 
 
 
290 aa  70.1  5e-11  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  28.14 
 
 
280 aa  69.7  6e-11  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  31.02 
 
 
280 aa  69.7  7e-11  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  23.29 
 
 
285 aa  69.3  9e-11  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  28.38 
 
 
290 aa  69.3  9e-11  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0560  Thioredoxin domain protein  26.8 
 
 
272 aa  68.6  1e-10  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0577  thioredoxin domain protein  26.8 
 
 
272 aa  68.6  1e-10  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1155  thioredoxin domain-containing protein  28.96 
 
 
294 aa  68.9  1e-10  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155818  hitchhiker  3.15771e-06 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1467  thioredoxin  23.86 
 
 
268 aa  68.9  1e-10  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  28.67 
 
 
302 aa  68.6  1e-10  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0073  thioredoxin-related  27.99 
 
 
336 aa  68.9  1e-10  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0246134 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0541  protein YbbN  25.95 
 
 
284 aa  68.2  2e-10  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0531  protein YbbN  25.95 
 
 
284 aa  68.2  2e-10  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.735174  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  30.4 
 
 
286 aa  68.2  2e-10  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0294  putative thioredoxin protein  33.94 
 
 
314 aa  68.2  2e-10  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.918989  normal  0.0369237 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0427  protein YbbN  25.95 
 
 
284 aa  68.2  2e-10  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0596  protein YbbN  25.95 
 
 
284 aa  68.2  2e-10  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0571  protein YbbN  25.95 
 
 
284 aa  68.2  2e-10  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  27.42 
 
 
290 aa  67.4  3e-10  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  26.6 
 
 
330 aa  67.8  3e-10  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0081  thioredoxin-related  25.55 
 
 
310 aa  67  4e-10  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  26.21 
 
 
306 aa  66.6  5e-10  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2102  thioredoxin  27.62 
 
 
291 aa  66.2  6e-10  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  28.53 
 
 
306 aa  66.6  6e-10  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00443  predicted thioredoxin domain-containing protein  25.61 
 
 
284 aa  66.2  7e-10  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00448  hypothetical protein  25.61 
 
 
284 aa  66.2  7e-10  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3124  thioredoxin domain-containing protein  25.61 
 
 
284 aa  66.2  7e-10  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000112242 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3118  Thioredoxin domain protein  25.61 
 
 
284 aa  66.2  7e-10  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  27.4 
 
 
290 aa  65.9  1e-09  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  25.9 
 
 
287 aa  65.1  1e-09  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0966  thioredoxin domain-containing protein  25.95 
 
 
284 aa  65.5  1e-09  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3195  Thioredoxin domain protein  27.05 
 
 
286 aa  65.1  1e-09  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64186  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3007  Thioredoxin domain protein  27.68 
 
 
286 aa  65.1  1e-09  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  28.34 
 
 
280 aa  65.1  2e-09  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  27.36 
 
 
302 aa  65.1  2e-09  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.285443 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2526  Thioredoxin domain  27.36 
 
 
302 aa  64.7  2e-09  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>