120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0097 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0097  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  100 
 
 
155 aa  305  1e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0115417  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0777  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  46.09 
 
 
130 aa  99  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0574046  hitchhiker  0.00140169 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3741  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  48 
 
 
133 aa  95.5  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.217317  normal  0.012325 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4348  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  51.69 
 
 
119 aa  85.9  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00391365  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1570  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  47.17 
 
 
135 aa  83.6  1e-15  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.196284  normal  0.153025 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0586  signal transduction histidine kinase, LytS  44.35 
 
 
123 aa  81.3  4e-15  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0183303  hitchhiker  0.00998812 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0156  putative signal transduction histidine kinase  41.48 
 
 
132 aa  80.5  8e-15  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.888783  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2031  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  46.53 
 
 
121 aa  75.5  2e-13  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3278  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.58 
 
 
775 aa  75.5  2e-13  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771244  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1581  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.51 
 
 
149 aa  76.3  2e-13  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0308365  normal  0.151358 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8758  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.19 
 
 
192 aa  72  3e-12  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4499  ATP-binding region ATPase domain protein  39.1 
 
 
365 aa  70.9  6e-12  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000991404  normal  0.031146 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0664  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.73 
 
 
147 aa  69.7  1e-11  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.535186 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2086  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  42.06 
 
 
134 aa  69.3  2e-11  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.019454  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0743  putative PAS/PAC sensor protein  39.2 
 
 
855 aa  69.7  2e-11  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  35.83 
 
 
713 aa  68.2  4e-11  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4276  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40.65 
 
 
180 aa  67.4  7e-11  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0915518  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0104  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40 
 
 
141 aa  66.2  1e-10  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.141556  normal  0.0323603 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3148  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  49.44 
 
 
146 aa  66.6  1e-10  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00947281  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4034  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40.87 
 
 
129 aa  66.2  2e-10  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  36 
 
 
591 aa  66.2  2e-10  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2138  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  42.05 
 
 
155 aa  65.1  3e-10  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0220396  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4051  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  37.5 
 
 
281 aa  65.1  3e-10  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.932154  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5624  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  42.39 
 
 
143 aa  63.2  1e-09  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000415643  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4531  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.1 
 
 
135 aa  62.4  2e-09  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  0.468222 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0192  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.36 
 
 
177 aa  61.6  4e-09  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.513716 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4668  ATP-binding region ATPase domain protein  38.21 
 
 
148 aa  61.6  4e-09  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32040  histidine kinase  42.7 
 
 
156 aa  61.2  5e-09  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3856  normal  0.302354 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0121  putative PAS/PAC sensor protein  37.88 
 
 
470 aa  61.2  5e-09  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.660456  normal  0.370084 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1989  putative PAS/PAC sensor protein  36.89 
 
 
722 aa  60.8  6e-09  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965966  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0346  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40.48 
 
 
122 aa  60.8  7e-09  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.108962  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1542  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  41.41 
 
 
355 aa  60.5  9e-09  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0477003  hitchhiker  0.00647646 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6631  putative signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 
135 aa  58.2  4e-08  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0674873 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2800  putative signal transduction histidine kinase  36 
 
 
135 aa  57.8  6e-08  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.366639  normal  0.788147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  38.33 
 
 
573 aa  57.4  7e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3140  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 
745 aa  57  8e-08  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.444013  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  35.65 
 
 
697 aa  57  9e-08  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2536  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  40.66 
 
 
199 aa  56.6  1e-07  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6480  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  44.79 
 
 
134 aa  56.2  2e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.903724  normal  0.217215 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6464  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  31.45 
 
 
164 aa  55.8  2e-07  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.675812 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.08 
 
 
579 aa  56.2  2e-07  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.38 
 
 
738 aa  55.1  4e-07  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35220  PAS domain S-box  33.87 
 
 
771 aa  54.3  5e-07  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4290  ATPase domain-containing protein  32.48 
 
 
315 aa  54.3  5e-07  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.814219  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0713  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  43 
 
 
133 aa  54.3  6e-07  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2744  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.54 
 
 
155 aa  54.3  6e-07  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.813583  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2108  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.79 
 
 
151 aa  53.5  9e-07  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.262944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0838  putative PAS/PAC sensor protein  46.67 
 
 
754 aa  53.1  1e-06  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2511  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.01 
 
 
130 aa  53.5  1e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1327  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.87 
 
 
211 aa  52.8  2e-06  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1228  putative signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 
169 aa  52.4  2e-06  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.141602 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0918  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  36.26 
 
 
142 aa  52.4  2e-06  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.283269  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2966  protein serine/threonine phosphatase  38 
 
 
716 aa  52.8  2e-06  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451872  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3501  putative PAS/PAC sensor protein  35.23 
 
 
1225 aa  52  3e-06  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.480314  normal  0.404449 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2295  hypothetical protein  31.55 
 
 
200 aa  51.6  3e-06  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147419  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3236  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.13 
 
 
137 aa  51.6  4e-06  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  34.83 
 
 
1039 aa  51.6  4e-06  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0250  PAS containing protein phosphatase 2C-like  35.63 
 
 
753 aa  51.6  4e-06  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337993  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.04 
 
 
616 aa  51.2  5e-06  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0892  hypothetical protein  41.76 
 
 
195 aa  50.8  7e-06  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8367  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.5 
 
 
251 aa  50.4  8e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1009  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  36.14 
 
 
743 aa  50.4  9e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0207  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.77 
 
 
613 aa  50.1  1e-05  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00647646 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0665  protein serine/threonine phosphatase  32.42 
 
 
800 aa  50.1  1e-05  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0524  putative PAS/PAC sensor protein  34.72 
 
 
744 aa  49.7  1e-05  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695402 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3638  protein serine/threonine phosphatase  34.17 
 
 
693 aa  50.1  1e-05  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.718947  normal  0.379759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7179  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.67 
 
 
173 aa  50.1  1e-05  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0359047  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1945  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39 
 
 
142 aa  49.3  2e-05  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00291504  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2776  hypothetical protein  33.06 
 
 
137 aa  49.3  2e-05  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2641  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.17 
 
 
122 aa  49.3  2e-05  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  1.59202e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.58 
 
 
549 aa  49.3  2e-05  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2297  hypothetical protein  34.19 
 
 
134 aa  48.9  2e-05  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  2.00107e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0400  putative signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 
203 aa  49.3  2e-05  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2418  protein serine/threonine phosphatase  37.8 
 
 
746 aa  48.5  3e-05  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.724517 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3058  hypothetical protein  41.86 
 
 
134 aa  48.9  3e-05  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  5.40346e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0038  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
151 aa  48.1  4e-05  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.536506  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4050  serine phosphatase  39.18 
 
 
766 aa  48.1  5e-05  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4524  protein serine/threonine phosphatase  35.48 
 
 
693 aa  47.8  5e-05  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4605  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.38 
 
 
155 aa  47.4  6e-05  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4166  putative PAS/PAC sensor protein  40 
 
 
765 aa  47.4  7e-05  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.299427  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1247  hypothetical protein  34.65 
 
 
148 aa  47.4  7e-05  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4122  Stage II sporulation E family protein  37.5 
 
 
805 aa  47.4  7e-05  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.530219  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0168  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.22 
 
 
149 aa  47.4  7e-05  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129671  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5025  putative signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 
166 aa  47  9e-05  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  0.0584008 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1052  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.23 
 
 
655 aa  47  9e-05  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620454  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1263  response regulator receiver  31.53 
 
 
282 aa  47  9e-05  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0593741  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0531  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.03 
 
 
207 aa  46.2  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111836  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1572  putative signal transduction histidine kinase  39.24 
 
 
161 aa  47  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0287  protein phosphatase 2C-like protein  32.99 
 
 
743 aa  47  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.575817  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  32.93 
 
 
817 aa  47  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4525  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.34 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8468  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.63 
 
 
245 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.319959 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0025  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.74 
 
 
226 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.14 
 
 
1045 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0519  putative signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 
165 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0095  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.21 
 
 
174 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2474  hypothetical protein  36.56 
 
 
132 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2880  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.08 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0493061  normal  0.177095 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2074  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.25 
 
 
136 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4104  stage II sporulation E family protein  34.41 
 
 
694 aa  44.7  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>