38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8468 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8468  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 245 aa  481  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319959 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7179  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  64.34 
 
 		 173 aa  159  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0359047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  35.71 
 
 		 817 aa  61.6  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3501  putative PAS/PAC sensor protein  41.24 
 
 		 1225 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.480314  normal  0.404449 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  36.21 
 
 		 591 aa  60.1  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.61 
 
 		 1045 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0743  putative PAS/PAC sensor protein  31.78 
 
 		 855 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  30.89 
 
 		 697 aa  55.8  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0346  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  41.18 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.108962  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0192  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.73 
 
 		 177 aa  54.7  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.513716 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2138  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  39 
 
 		 155 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0220396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  33.7 
 
 		 713 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2086  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.98 
 
 		 134 aa  53.9  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.019454  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8305  putative PAS/PAC sensor protein  36.7 
 
 		 528 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.817018 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5311  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.33 
 
 		 952 aa  52.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0207  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.63 
 
 		 613 aa  52  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00647646 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  39.17 
 
 		 616 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2295  hypothetical protein  35.48 
 
 		 200 aa  50.8  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147419  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4276  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.19 
 
 		 180 aa  50.1  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0915518  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  37.74 
 
 		 573 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6671  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.66 
 
 		 357 aa  49.3  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.314942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8758  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.91 
 
 		 192 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4051  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  29.27 
 
 		 281 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.932154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1241  putative PAS/PAC sensor protein  30.15 
 
 		 1432 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402812 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  36.36 
 
 		 1039 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2074  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  44.12 
 
 		 136 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0121  putative PAS/PAC sensor protein  36.54 
 
 		 470 aa  47  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.660456  normal  0.370084 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0097  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.63 
 
 		 155 aa  46.2  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0115417  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0218  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  37 
 
 		 331 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.614577  normal  0.286809 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6480  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40.22 
 
 		 134 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.903724  normal  0.217215 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2744  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.36 
 
 		 155 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.813583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0664  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.57 
 
 		 147 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.535186 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4499  ATP-binding region ATPase domain protein  35.54 
 
 		 365 aa  43.5  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000991404  normal  0.031146 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3278  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.09 
 
 		 775 aa  42.7  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771244  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1303  hypothetical protein  38.71 
 
 		 143 aa  42.7  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0850702  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.94 
 
 		 738 aa  42.7  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5201  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  39.29 
 
 		 728 aa  42  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171311  normal  0.162808 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0918  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  37.93 
 
 		 142 aa  41.6  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.283269  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>