76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1247 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1247  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  301  2.0000000000000002e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1655  hypothetical protein  51.45 
 
 		 162 aa  136  8.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0265  hypothetical protein  48.91 
 
 		 163 aa  123  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.620382  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2776  hypothetical protein  40.52 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2295  hypothetical protein  35.92 
 
 		 200 aa  63.9  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147419  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1416  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.67 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.034656  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2967  hypothetical protein  36.22 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0014  putative signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6480  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.46 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.903724  normal  0.217215 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1448  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.14 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0047791  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0531  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8587  putative signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 158 aa  57  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00197112  normal  0.613164 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4525  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.48 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1945  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.84 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00291504  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2074  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.5 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2770  putative signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1233  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.6 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.226283  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1805  hypothetical protein  33.9 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3148  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.47 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00947281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3632  ATP-binding region ATPase domain protein  38.1 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1297  hypothetical protein  29.86 
 
 		 187 aa  53.9  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4605  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  45.57 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0019  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.75 
 
 		 255 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3058  hypothetical protein  34.09 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000540346  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0305  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.91 
 
 		 184 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12283  normal  0.285434 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4246  putative signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 164 aa  51.6  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0755  putative regulatory protein  37.5 
 
 		 164 aa  50.8  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364098  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0287  protein phosphatase 2C-like protein  32.81 
 
 		 743 aa  50.8  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.575817  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2643  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.88 
 
 		 688 aa  50.4  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000425716  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1650  putative signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0223546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4104  stage II sporulation E family protein  32.85 
 
 		 694 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2086  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.71 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.019454  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2480  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.71 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.252056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8758  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.19 
 
 		 192 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4135  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.04 
 
 		 188 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4348  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.46 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00391365  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1873  putative signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0156  putative signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.888783  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3499  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.5 
 
 		 187 aa  48.9  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1263  response regulator receiver  36.45 
 
 		 282 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0593741  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2582  putative signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0114014 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.38 
 
 		 616 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9396  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.8 
 
 		 171 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0586  signal transduction histidine kinase, LytS  30.83 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0183303  hitchhiker  0.00998812 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0097  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.65 
 
 		 155 aa  47.4  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0115417  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  31.34 
 
 		 1039 aa  47  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4370  putative signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0207  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.85 
 
 		 613 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00647646 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3612  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.27 
 
 		 185 aa  47  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  30.83 
 
 		 573 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0429  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.84 
 
 		 196 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0164  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 		 174 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1570  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.35 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.196284  normal  0.153025 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4276  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.58 
 
 		 180 aa  44.3  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0915518  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1989  putative PAS/PAC sensor protein  35.51 
 
 		 722 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1581  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40.74 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0308365  normal  0.151358 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2880  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.58 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0493061  normal  0.177095 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5447  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.18 
 
 		 178 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.279977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0976  hypothetical protein  39.33 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0519  putative signal transduction histidine kinase  28.68 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5624  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.35 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000415643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1919  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.04 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0524  putative PAS/PAC sensor protein  28.57 
 
 		 744 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00695402 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0664  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.2 
 
 		 147 aa  41.6  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.535186 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4524  protein serine/threonine phosphatase  32.62 
 
 		 693 aa  41.6  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0233  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.65 
 
 		 347 aa  41.6  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.211721  hitchhiker  0.0066599 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.78 
 
 		 738 aa  41.6  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3741  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.04 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.217317  normal  0.012325 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7320  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 288 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000252308  decreased coverage  0.00000000279842 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1009  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  28.22 
 
 		 743 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0777  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.94 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0574046  hitchhiker  0.00140169 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2138  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  28.57 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0220396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2511  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.56 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0391  hypothetical protein  35.11 
 
 		 136 aa  40.4  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7843  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.5 
 
 		 137 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5414  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3337  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 		 158 aa  40  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>