59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0755 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0755  putative regulatory protein  100 
 
 		 164 aa  333  3.9999999999999995e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364098  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3612  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  61.96 
 
 		 185 aa  200  8e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2776  hypothetical protein  37.3 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3632  ATP-binding region ATPase domain protein  36.36 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0979  hypothetical protein  34.59 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.454512  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1655  hypothetical protein  40.82 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.4 
 
 		 616 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1416  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.15 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.034656  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3148  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.04 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00947281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6480  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.77 
 
 		 134 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.903724  normal  0.217215 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2967  hypothetical protein  32.63 
 
 		 166 aa  52  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0192  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.58 
 
 		 177 aa  51.6  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.513716 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1247  hypothetical protein  37.5 
 
 		 148 aa  50.8  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4605  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35 
 
 		 155 aa  50.8  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1448  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.17 
 
 		 164 aa  50.8  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0047791  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1233  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  41.25 
 
 		 151 aa  50.8  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.226283  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0664  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.25 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.535186 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1570  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.65 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.196284  normal  0.153025 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0121  putative PAS/PAC sensor protein  37.07 
 
 		 470 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.660456  normal  0.370084 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4525  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  41.24 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0014  putative signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 160 aa  48.5  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1945  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.54 
 
 		 142 aa  48.5  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00291504  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  40 
 
 		 1039 aa  48.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1263  response regulator receiver  32.17 
 
 		 282 aa  48.1  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0593741  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0429  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  44.12 
 
 		 196 aa  47.4  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7320  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.08 
 
 		 288 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000252308  decreased coverage  0.00000000279842 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1989  putative PAS/PAC sensor protein  31.67 
 
 		 722 aa  47  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4370  putative signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 134 aa  47  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9396  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.68 
 
 		 171 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.33 
 
 		 549 aa  45.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7843  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.89 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5414  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0531  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.19 
 
 		 207 aa  45.8  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111836  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0586  signal transduction histidine kinase, LytS  31.09 
 
 		 123 aa  45.4  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0183303  hitchhiker  0.00998812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8758  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.9 
 
 		 192 aa  44.7  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1173  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.61 
 
 		 180 aa  43.9  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2379  putative serine/threonine kinaseanti-sigma factor  33.33 
 
 		 197 aa  43.9  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.084958 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2480  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.99 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.252056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5315  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.33 
 
 		 750 aa  43.9  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.315721 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  32.52 
 
 		 697 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3058  hypothetical protein  34.78 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000540346  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2880  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.51 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0493061  normal  0.177095 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1297  hypothetical protein  47.76 
 
 		 187 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2074  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.19 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1650  putative signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 		 150 aa  42.4  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0223546  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2582  putative signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 150 aa  42.4  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0114014 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2770  putative signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 		 150 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416371  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4246  putative signal transduction histidine kinase  35.58 
 
 		 164 aa  42.4  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5041  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40.32 
 
 		 197 aa  42.4  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.486269 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3501  putative PAS/PAC sensor protein  30 
 
 		 1225 aa  42.4  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.480314  normal  0.404449 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0238  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.72 
 
 		 295 aa  42.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112494 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3463  ATP-binding region ATPase domain protein  32.14 
 
 		 188 aa  41.6  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.218355 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4051  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  27.35 
 
 		 281 aa  41.6  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.932154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0207  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.57 
 
 		 613 aa  41.6  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00647646 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3736  putative PAS/PAC sensor protein  32.63 
 
 		 1017 aa  41.6  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8587  putative signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 158 aa  41.2  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00197112  normal  0.613164 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1352  hypothetical protein  31.25 
 
 		 145 aa  41.2  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.935548  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2295  hypothetical protein  33.33 
 
 		 200 aa  41.2  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147419  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3278  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.6 
 
 		 775 aa  40.8  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771244  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  30.53 
 
 		 713 aa  40.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>