35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1572 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1572  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 161 aa  317  3.9999999999999996e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4997  putative signal transduction histidine kinase  52.27 
 
 		 152 aa  115  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0081  putative signal transduction histidine kinase  50.48 
 
 		 150 aa  96.3  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273591  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1303  hypothetical protein  43.38 
 
 		 143 aa  84  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0850702  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36370  histidine kinase  34.97 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3554  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.84 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3463  ATP-binding region ATPase domain protein  33.93 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.218355 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2474  hypothetical protein  38.74 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11800  histidine kinase  36.15 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.243176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3501  putative PAS/PAC sensor protein  34.17 
 
 		 1225 aa  47.8  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.480314  normal  0.404449 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0097  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.24 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0115417  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0346  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.65 
 
 		 122 aa  47  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.108962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6631  putative signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 		 135 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0674873 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0743  putative PAS/PAC sensor protein  30.97 
 
 		 855 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2138  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  36.97 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0220396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4531  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.41 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  0.468222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2800  putative signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 135 aa  44.3  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.366639  normal  0.788147 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3741  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.52 
 
 		 133 aa  44.3  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.217317  normal  0.012325 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.73 
 
 		 616 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1570  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40.91 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.196284  normal  0.153025 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3774  PAS  28.78 
 
 		 395 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.195933  normal  0.315596 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4290  ATPase domain-containing protein  33.7 
 
 		 315 aa  43.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.814219  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4325  putative two-component system histidine kinase  33.04 
 
 		 541 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2699  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 		 446 aa  42.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.112792  normal  0.0892885 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2284  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.67 
 
 		 323 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0993778  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2031  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.62 
 
 		 121 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1771  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.46 
 
 		 669 aa  42  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0501  histidine kinase  33.1 
 
 		 945 aa  42  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0931305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2889  histidine kinase  35.16 
 
 		 549 aa  41.6  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6600  histidine kinase  29.91 
 
 		 458 aa  41.6  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000947222 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3236  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.48 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2042  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 477 aa  41.2  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.562637  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1173  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.21 
 
 		 180 aa  40.8  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2352  histidine kinase  35.87 
 
 		 387 aa  40.8  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3706  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.47 
 
 		 133 aa  40.8  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0345536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>