More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1729 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1049  glycogen branching enzyme  58.44 
 
 		 755 aa  835    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145385  normal  0.795016 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03284  glycogen branching enzyme  47.09 
 
 		 728 aa  646    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0237204  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0282  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.09 
 
 		 728 aa  646    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.890555  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1321  glycogen branching enzyme  47.2 
 
 		 743 aa  658    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.975501  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06401  glycogen branching enzyme  44.68 
 
 		 755 aa  654    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.636304  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4058  glycogen branching enzyme  48.84 
 
 		 736 aa  706    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2343  glycogen branching enzyme  54.76 
 
 		 741 aa  808    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1475  glycogen branching enzyme  48.63 
 
 		 740 aa  679    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0239  glycogen branching enzyme  47.71 
 
 		 775 aa  667    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0137851  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2740  glycogen branching enzyme  47.66 
 
 		 736 aa  635    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.296268  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3960  1,4-alpha-glucan branching protein  45.25 
 
 		 763 aa  655    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.169565  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1494  glycogen branching enzyme  47.89 
 
 		 746 aa  672    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2762  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.6 
 
 		 741 aa  664    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0280  glycogen branching enzyme  47.09 
 
 		 728 aa  646    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.388281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6323  glycogen branching enzyme  48.84 
 
 		 712 aa  664    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0125562  normal  0.86015 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4006  glycogen branching enzyme  47.27 
 
 		 727 aa  642    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11358  glycogen branching enzyme  55.4 
 
 		 731 aa  809    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000136152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4647  glycogen branching enzyme  45.63 
 
 		 728 aa  637    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.616835 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2491  glycogen branching enzyme  46.33 
 
 		 741 aa  663    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00781855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1104  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.51 
 
 		 729 aa  652    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2714  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.37 
 
 		 784 aa  668    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0582  glycogen branching enzyme  61.15 
 
 		 749 aa  889    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0020  glycogen branching enzyme  44.41 
 
 		 755 aa  651    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.663134  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4229  glycogen branching enzyme  49.8 
 
 		 750 aa  659    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3911  glycogen branching enzyme  47.09 
 
 		 728 aa  646    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2058  glycogen branching enzyme  50.48 
 
 		 740 aa  713    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0222807  normal  0.370562 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1207  glycogen branching enzyme  48.64 
 
 		 716 aa  668    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5489  glycogen branching enzyme  48.17 
 
 		 732 aa  658    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461102  decreased coverage  0.0000652942 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1105  glycogen branching enzyme  51.36 
 
 		 748 aa  711    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4616  glycogen branching enzyme  45.31 
 
 		 764 aa  651    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.490681 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1316  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.95 
 
 		 728 aa  763    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0904  glycogen branching enzyme  48.87 
 
 		 749 aa  697    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2191  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.91 
 
 		 737 aa  726    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2536  glycogen branching enzyme  45.9 
 
 		 743 aa  644    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1331  glycogen branching enzyme  47.2 
 
 		 743 aa  658    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2448  glycogen branching enzyme  50.34 
 
 		 728 aa  701    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7032  glycogen branching enzyme  48.3 
 
 		 735 aa  660    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3714  glycogen branching enzyme  46.96 
 
 		 728 aa  646    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.470927  normal  0.781278 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1018  glycogen branching enzyme  45.91 
 
 		 765 aa  635    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.650452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1817  glycogen branching enzyme  48.29 
 
 		 736 aa  694    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.297047 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0511  glycogen branching enzyme  49.73 
 
 		 726 aa  721    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.971764  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2936  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.32 
 
 		 721 aa  650    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1597  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.5 
 
 		 760 aa  667    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14436 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1085  glycogen branching enzyme  45.88 
 
 		 774 aa  666    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217496 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0717  glycogen branching enzyme  49.59 
 
 		 746 aa  675    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2024  glycogen branching enzyme  51.5 
 
 		 677 aa  638    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.136929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1111  glycogen branching enzyme  50.48 
 
 		 728 aa  705    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.827586  normal  0.454122 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0147  glycogen branching enzyme  47.38 
 
 		 727 aa  642    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2576  glycogen branching enzyme  50.88 
 
 		 740 aa  710    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894399  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18371  glycogen branching enzyme  46.04 
 
 		 756 aa  639    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0939  glycogen branching enzyme  49.16 
 
 		 834 aa  651    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3681  glycogen branching enzyme  59.59 
 
 		 812 aa  857    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.024212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0999  glycogen branching enzyme  55.4 
 
 		 640 aa  682    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.970102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1882  glycogen branching enzyme  48.42 
 
 		 716 aa  665    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3632  glycogen branching enzyme  47.09 
 
 		 728 aa  646    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3113  glycogen branching enzyme  52.23 
 
 		 638 aa  647    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4118  glycogen branching enzyme  47.38 
 
 		 727 aa  642    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.595644 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0987  glycogen branching enzyme  48.18 
 
 		 729 aa  690    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0160232 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0542  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.7 
 
 		 732 aa  680    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3680  glycogen branching enzyme  48.77 
 
 		 716 aa  657    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1367  glycogen branching enzyme  48.83 
 
 		 725 aa  665    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2863  glycogen branching enzyme  47.54 
 
 		 736 aa  638    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3484  glycogen branching enzyme  48.9 
 
 		 716 aa  665    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3657  glycogen branching enzyme  49.25 
 
 		 736 aa  707    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0888692  normal  0.0129978 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1464  glycogen branching enzyme  48.79 
 
 		 716 aa  663    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1294  1,4-alpha-glucan branching enzyme  60.14 
 
 		 732 aa  902    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1332  glycogen branching enzyme  48.24 
 
 		 736 aa  659    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.802487  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3861  glycogen branching enzyme  54.25 
 
 		 759 aa  808    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0316  glycogen branching enzyme  51.84 
 
 		 722 aa  720    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1248  glycogen branching enzyme  51.89 
 
 		 745 aa  660    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6806  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.12 
 
 		 770 aa  673    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.606577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3847  glycogen branching enzyme  54.25 
 
 		 759 aa  811    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0235209 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1783  glycogen branching enzyme  50 
 
 		 728 aa  694    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2677  glycogen branching enzyme  49.73 
 
 		 738 aa  702    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810703  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1133  glycogen branching enzyme  48.17 
 
 		 725 aa  651    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1785  glycogen branching enzyme  48.7 
 
 		 736 aa  700    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146996  normal  0.282857 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1357  glycogen branching enzyme  47.2 
 
 		 743 aa  659    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.513069 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2745  glycogen branching enzyme  49.68 
 
 		 634 aa  643    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225912  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0889  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.21 
 
 		 807 aa  650    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1837  glycogen branching enzyme  45.57 
 
 		 776 aa  661    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2758  glycogen branching enzyme  47.07 
 
 		 745 aa  660    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2836  glycogen branching enzyme  47.34 
 
 		 745 aa  666    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0958  glycogen branching enzyme  51.56 
 
 		 695 aa  677    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32011 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2165  glycogen branching enzyme  47.27 
 
 		 744 aa  662    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5592  glycogen branching enzyme  47.64 
 
 		 733 aa  644    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36710  glycogen branching enzyme  46.33 
 
 		 732 aa  641    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.633943 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1168  glycogen branching enzyme  48.71 
 
 		 765 aa  665    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.159491 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0739  glycogen branching enzyme  58.8 
 
 		 1224 aa  884    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.345275  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6497  glycogen branching enzyme  48.24 
 
 		 736 aa  659    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3451  glycogen branching enzyme  50.69 
 
 		 642 aa  642    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000151331 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1392  glycogen branching enzyme  51.1 
 
 		 723 aa  649    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1518  glycogen branching enzyme  47.77 
 
 		 728 aa  672    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2934  glycogen branching enzyme  47.34 
 
 		 745 aa  662    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0676  glycogen branching enzyme  59.1 
 
 		 727 aa  882    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214818  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4428  glycogen branching enzyme  47.47 
 
 		 731 aa  683    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1806  glycogen branching enzyme  55.42 
 
 		 749 aa  820    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2453  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.9 
 
 		 841 aa  674    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3935  glycogen branching enzyme  54.25 
 
 		 759 aa  808    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.277318 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3153  glycogen branching enzyme  46.3 
 
 		 732 aa  636    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252202  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4302  glycogen branching enzyme  53.71 
 
 		 737 aa  797    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>