More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1593 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1593  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 278 aa  561  1.0000000000000001e-159  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2444  extracellular solute-binding protein family 3  63.39 
 
 		 294 aa  349  3e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.474573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22730  amino acid-binding protein  69.49 
 
 		 290 aa  327  1.0000000000000001e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.718318  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1246  extracellular solute-binding protein family 3  60.42 
 
 		 282 aa  323  3e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15430  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  64.83 
 
 		 297 aa  308  4e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0169266  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0021  amino acid ABC transporter periplasmic protein  54.74 
 
 		 279 aa  286  2e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0787  extracellular solute-binding protein  53.28 
 
 		 277 aa  283  3.0000000000000004e-75  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1590  extracellular solute-binding protein family 3  52.38 
 
 		 282 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000563013  normal  0.528565 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0809  extracellular solute-binding protein  55 
 
 		 285 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0671  extracellular solute-binding protein family 3  57.39 
 
 		 283 aa  248  6e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159271  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1497  extracellular solute-binding protein family 3  51.87 
 
 		 305 aa  238  8e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1470  extracellular solute-binding protein family 3  46.27 
 
 		 274 aa  231  9e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.506058  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2142  extracellular solute-binding protein  52.28 
 
 		 275 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.332487  hitchhiker  0.00274771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2155  extracellular solute-binding protein  52.28 
 
 		 275 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2201  extracellular solute-binding protein  52.28 
 
 		 275 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51731  normal  0.0309221 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2427  extracellular solute-binding protein  52.92 
 
 		 279 aa  229  4e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.45539  normal  0.110976 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3969  extracellular solute-binding protein  52.67 
 
 		 279 aa  228  6e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62818  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1124  extracellular solute-binding protein family 3  49.01 
 
 		 289 aa  227  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.901238  normal  0.221919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2222  glutamine ABC transporter (glutamine-binding protein)  50.44 
 
 		 269 aa  226  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3988  extracellular solute-binding protein family 3  53.66 
 
 		 321 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3287  extracellular solute-binding protein family 3  48.54 
 
 		 290 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4400  extracellular solute-binding protein family 3  49.17 
 
 		 281 aa  214  9e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1224  extracellular solute-binding protein  51.12 
 
 		 323 aa  212  5.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0186  extracellular solute-binding protein family 3  50.43 
 
 		 279 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3913  extracellular solute-binding protein family 3  41.86 
 
 		 296 aa  211  7.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1449  extracellular solute-binding protein family 3  50.21 
 
 		 295 aa  204  9e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1550  extracellular solute-binding protein family 3  41.25 
 
 		 294 aa  202  6e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.82369  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6801  extracellular solute-binding protein family 3  41.58 
 
 		 275 aa  192  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1790  extracellular solute-binding protein family 3  42.86 
 
 		 323 aa  189  5e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07790  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  41.13 
 
 		 278 aa  187  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3520  extracellular solute-binding protein  45.66 
 
 		 296 aa  187  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548658  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27710  amino acid-binding protein  47.21 
 
 		 304 aa  186  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.620875 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1430  extracellular solute-binding protein  44.9 
 
 		 294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36870  amino acid-binding protein  44.2 
 
 		 290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.567657  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1394  extracellular solute-binding protein  44.39 
 
 		 294 aa  181  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.041771 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2522  extracellular solute-binding protein family 3  41.85 
 
 		 295 aa  169  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000888885 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2802  extracellular solute-binding protein  40.62 
 
 		 294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.228556  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0327  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  36.09 
 
 		 308 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.503562  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2206  extracellular solute-binding protein family 3  40.87 
 
 		 355 aa  155  6e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4887  extracellular solute-binding protein family 3  37.9 
 
 		 315 aa  151  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  33.97 
 
 		 286 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  33.82 
 
 		 281 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4395  extracellular solute-binding protein family 3  39.27 
 
 		 340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7045  Serine/threonine protein kinase-like protein  34.66 
 
 		 600 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3984  extracellular solute-binding protein family 3  34.38 
 
 		 323 aa  132  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1256  Serine/threonine protein kinase-like protein  35.45 
 
 		 751 aa  131  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37210  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  37.39 
 
 		 324 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.734714  normal  0.110319 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4662  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  34.4 
 
 		 276 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.257219  hitchhiker  2.83751e-21 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  34.27 
 
 		 275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0553  extracellular solute-binding protein  34.4 
 
 		 276 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0676  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  34 
 
 		 276 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0769  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  34 
 
 		 276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0607  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  33.6 
 
 		 276 aa  126  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.510404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0552  glutamine ABC transporter substrate-binding protein  33.6 
 
 		 276 aa  126  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.368136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0640  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  33.6 
 
 		 276 aa  126  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0697  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.6 
 
 		 276 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0708  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.6 
 
 		 276 aa  125  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0551  glytamine ABC transporter substrate-binding protein  33.6 
 
 		 276 aa  125  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3508  extracellular solute-binding protein family 3  37.33 
 
 		 319 aa  125  9e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30080  amino acid-binding protein  36.53 
 
 		 324 aa  121  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3538  extracellular solute-binding protein family 3  39.66 
 
 		 328 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.139561  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0529  amino acid ABC transporter periplasmic protein  32.23 
 
 		 277 aa  117  3e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.488243  hitchhiker  0.00197621 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0201  extracellular solute-binding protein  31.43 
 
 		 324 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0704  extracellular solute-binding protein  33.64 
 
 		 332 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.721157  normal  0.0331446 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10416  glutamine-binding lipoprotein glnH  33.33 
 
 		 328 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000397853  normal  0.816893 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3062  extracellular solute-binding protein family 3  35.16 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  31.99 
 
 		 271 aa  113  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0527  amino acid ABC transporter periplasmic protein  30.16 
 
 		 273 aa  113  3e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000799284  normal  0.37581 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6294  extracellular solute-binding protein  31.96 
 
 		 305 aa  112  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102459  normal  0.206297 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  32.03 
 
 		 273 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  32.16 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0531  extracellular solute-binding protein  32.76 
 
 		 331 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0541  extracellular solute-binding protein  32.33 
 
 		 331 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0553  extracellular solute-binding protein  32.33 
 
 		 331 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104829  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1121  extracellular solute-binding protein family 3  31.4 
 
 		 245 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.591856  normal  0.275359 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2787  extracellular solute-binding protein family 3  29.76 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2764  extracellular solute-binding protein  30.53 
 
 		 275 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4387  extracellular solute-binding protein  32.75 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.974956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3756  extracellular solute-binding protein  32.46 
 
 		 302 aa  106  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4553  extracellular solute-binding protein family 3  32.11 
 
 		 323 aa  106  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0917  extracellular solute-binding protein  32.5 
 
 		 270 aa  106  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3754  extracellular solute-binding protein family 3  35 
 
 		 326 aa  105  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2218  extracellular solute-binding protein  30.83 
 
 		 275 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120709  normal  0.459989 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1093  extracellular solute-binding protein family 3  32.28 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253807  normal  0.019092 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1961  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.22 
 
 		 250 aa  102  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1495  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.05 
 
 		 247 aa  102  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000566563  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1773  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.17 
 
 		 247 aa  102  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000148695  normal  0.114873 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1600  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.17 
 
 		 247 aa  102  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1512  extracellular solute-binding protein  31.23 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3158  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.87 
 
 		 250 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0137955  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1487  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.87 
 
 		 250 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2029  extracellular solute-binding protein family 3  30.19 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00497658  hitchhiker  0.00148627 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2813  extracellular solute-binding protein  32.77 
 
 		 319 aa  100  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.243067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3272  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.87 
 
 		 250 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2098  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.45 
 
 		 250 aa  99.4  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.230871  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1406  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.45 
 
 		 250 aa  99.4  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.584446  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.45 
 
 		 250 aa  99.4  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1126  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.45 
 
 		 250 aa  99.4  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3699  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.02 
 
 		 248 aa  98.2  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0756284  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  32.5 
 
 		 254 aa  98.2  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>