168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4228 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4228  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 283 aa  587  1e-167  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.470343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6342  beta-lactamase domain protein  42.09 
 
 		 284 aa  222  4.9999999999999996e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4229  beta-lactamase domain protein  40 
 
 		 309 aa  213  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2297  metal-dependent hydrolase  40.14 
 
 		 280 aa  206  3e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0877  putative phytochrome sensor protein  40.47 
 
 		 603 aa  190  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0810026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0338  beta-lactamase-like protein  36.97 
 
 		 275 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1367  putative phytochrome sensor protein  40.74 
 
 		 607 aa  178  7e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2311  beta-lactamase domain protein  38.31 
 
 		 285 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2260  beta-lactamase domain protein  38.31 
 
 		 285 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1486  metal-dependent hydrolase  34.88 
 
 		 279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4027  beta-lactamase domain protein  34.63 
 
 		 296 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.961759 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2383  beta-lactamase domain-containing protein  34.14 
 
 		 320 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2865  beta-lactamase-like  36.12 
 
 		 304 aa  162  6e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.627483  normal  0.13634 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1865  beta-lactamase-like  36.79 
 
 		 305 aa  162  8.000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.523835  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2117  Beta-lactamase-like  37.84 
 
 		 298 aa  159  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3257  beta-lactamase domain-containing protein  35.63 
 
 		 308 aa  159  4e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0550  beta-lactamase domain protein  34.39 
 
 		 278 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.145975 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4119  hypothetical protein  34.1 
 
 		 284 aa  155  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.376643  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6341  beta-lactamase domain protein  35.06 
 
 		 322 aa  155  8e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3215  beta-lactamase domain-containing protein  32.01 
 
 		 295 aa  154  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3638  beta-lactamase domain protein  36.94 
 
 		 309 aa  154  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  hitchhiker  0.00134063 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1275  beta-lactamase-like  33.79 
 
 		 279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4637  beta-lactamase-like  35.07 
 
 		 301 aa  152  5.9999999999999996e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1985  beta-lactamase-like  32.25 
 
 		 295 aa  149  6e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278076  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02966  beta-lactamase-like protein  31.27 
 
 		 280 aa  146  4.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2296  beta-lactamase domain protein  35 
 
 		 302 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.557207 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0048  beta-lactamase domain-containing protein  34.35 
 
 		 333 aa  141  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.514639  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1811  Beta-lactamase-like  35.22 
 
 		 282 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0060  beta-lactamase domain protein  33.46 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1257  ElaC, metal-dependent hydrolase of the beta- lactamase superfamily  27.91 
 
 		 294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0627  hypothetical protein  34.71 
 
 		 305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1994  metallo-beta-lactamase family protein  29.63 
 
 		 320 aa  129  7.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0701342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5955  beta-lactamase domain protein  30.28 
 
 		 276 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.512599  normal  0.0645394 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2700  hypothetical protein  31.68 
 
 		 301 aa  125  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1541  metallo-beta-lactamase family protein  28.97 
 
 		 320 aa  119  6e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7099  putative hydrolase protein, beta-lactamase superfamily  28.52 
 
 		 276 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760297  normal  0.767931 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4587  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 276 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5603  metal dependant beta lactamase protein  30.8 
 
 		 276 aa  116  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3807  beta-lactamase superfamily hydrolase  29.22 
 
 		 323 aa  115  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200749 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0591  beta-lactamase domain-containing protein  29.82 
 
 		 323 aa  115  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.189752  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3546  hypothetical protein  33.01 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.285484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0276  beta-lactamase domain-containing protein  29.1 
 
 		 308 aa  106  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0537397  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4970  beta-lactamase domain protein  30.63 
 
 		 301 aa  106  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0202653 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1236  beta-lactamase superfamily hydrolase  29.17 
 
 		 320 aa  105  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0138314 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2334  beta-lactamase domain-containing protein  28.73 
 
 		 289 aa  103  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.121842  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1047  beta-lactamase domain-containing protein  27.17 
 
 		 313 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4920  beta-lactamase domain protein  28.9 
 
 		 301 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4456  beta-lactamase domain-containing protein  29.29 
 
 		 349 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2095  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  25.49 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1710  beta-lactamase domain-containing protein  29.38 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.635275  normal  0.117581 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  26.85 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14031  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.73 
 
 		 327 aa  58.9  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.694516  normal  0.113121 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0495  hypothetical protein  26.37 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.78198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  27.94 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3902  beta-lactamase-like  25.81 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1531  beta-lactamase domain-containing protein  26.86 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1012  beta-lactamase domain protein  26.92 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1765  beta-lactamase domain-containing protein  25.84 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000290014 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0641  ribonuclease Z  34.41 
 
 		 321 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.56652  decreased coverage  0.00172895 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2657  ribonuclease Z  25.68 
 
 		 305 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2449  ribonuclease Z  25.68 
 
 		 305 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15351  metallo-beta-lactamase superfamily protein  21.55 
 
 		 312 aa  53.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2542  ribonuclease Z  25.68 
 
 		 341 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.144505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0588  beta-lactamase domain-containing protein  27.35 
 
 		 254 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280528  normal  0.0107204 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0512  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  25.9 
 
 		 260 aa  53.5  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2497  ribonuclease Z  25.68 
 
 		 341 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.883053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2553  ribonuclease Z  25.68 
 
 		 305 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  24.44 
 
 		 256 aa  53.1  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0844  cyclic-AMP phosphodiesterase  23.67 
 
 		 255 aa  53.1  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  21.9 
 
 		 314 aa  52.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0920  RNAse Z  22.8 
 
 		 314 aa  52.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  33.33 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  33.33 
 
 		 311 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3410  ribonuclease Z  33.33 
 
 		 311 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  33.33 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15501  metallo-beta-lactamase superfamily protein  19.53 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1162  beta-lactamase domain-containing protein  27.98 
 
 		 257 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  33.33 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  33.33 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  33.33 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0134  cyclic-AMP phosphodiesterase  25.14 
 
 		 259 aa  51.2  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1447  RNAse Z  30 
 
 		 312 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4169  ribonuclease Z  42.67 
 
 		 314 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.0568624 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  33.33 
 
 		 305 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3374  beta-lactamase domain-containing protein  26.51 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285355  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2251  beta-lactamase-like  23.74 
 
 		 273 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174345  normal  0.0139422 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1860  beta-lactamase domain protein  25.99 
 
 		 297 aa  50.4  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.150092 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2424  ribonuclease Z  32.22 
 
 		 311 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  25.17 
 
 		 250 aa  49.7  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15101  metallo-beta-lactamase superfamily protein  30 
 
 		 312 aa  49.7  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2837  ribonuclease Z  29.35 
 
 		 307 aa  49.7  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  31.11 
 
 		 393 aa  49.7  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0652  beta-lactamase domain-containing protein  25.94 
 
 		 247 aa  49.7  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0429  ribonuclease Z  24.76 
 
 		 318 aa  49.3  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  24.47 
 
 		 309 aa  48.5  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2288  carbon-phosphorus lyase complex accessory protein  25.41 
 
 		 255 aa  48.5  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.52798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0532  ribonuclease Z  33.33 
 
 		 319 aa  48.5  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1966  beta-lactamase domain protein  23 
 
 		 262 aa  48.5  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0859  beta-lactamase domain protein  25.94 
 
 		 244 aa  47.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160927  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0210  putative hydrolase  26.92 
 
 		 314 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>