252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0438 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0438  heat-inducible transcription repressor HrcA  100 
 
 
354 aa  720    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000928252  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3462  heat-inducible transcription repressor HrcA  59.31 
 
 
359 aa  422  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000760738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4390  heat-inducible transcription repressor HrcA  59.03 
 
 
359 aa  420  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2696  heat-inducible transcription repressor HrcA  57.38 
 
 
376 aa  404  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.666448 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1183  heat-inducible transcription repressor  38.35 
 
 
345 aa  248  2e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000556143  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1210  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.96 
 
 
345 aa  245  6.999999999999999e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000297014  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1401  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.55 
 
 
345 aa  245  9e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  41.88 
 
 
344 aa  235  7e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.29 
 
 
343 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.61 
 
 
345 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.04 
 
 
343 aa  188  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.78 
 
 
351 aa  181  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.34 
 
 
347 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.69 
 
 
343 aa  180  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.69 
 
 
343 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.69 
 
 
344 aa  179  7e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.32 
 
 
345 aa  177  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.03 
 
 
344 aa  176  4e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.75 
 
 
344 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.68 
 
 
343 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1550  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.52 
 
 
339 aa  174  2.9999999999999996e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.49 
 
 
342 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0604  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.46 
 
 
343 aa  172  9e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.57 
 
 
343 aa  171  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.03 
 
 
348 aa  170  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.66 
 
 
347 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.63 
 
 
343 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3507  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.07 
 
 
343 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848963  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  29.05 
 
 
339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.56 
 
 
348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07690  heat shock gene repressor HrcA  32.65 
 
 
336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2109  heat-inducible transcription repressor  33.91 
 
 
339 aa  164  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  29.45 
 
 
339 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10320  heat shock gene repressor HrcA  33.43 
 
 
336 aa  162  8.000000000000001e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.319867  unclonable  0.00000000169449 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3576  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.95 
 
 
343 aa  162  9e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1026  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.14 
 
 
354 aa  162  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1584  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.08 
 
 
355 aa  162  1e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0405407  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1478  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.14 
 
 
351 aa  161  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.63 
 
 
337 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.08 
 
 
341 aa  160  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1648  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.33 
 
 
337 aa  159  5e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.685607  normal  0.0242929 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1772  heat-inducible transcription repressor  31.2 
 
 
336 aa  157  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1424  negative regulator of class I heat shock protein  31.09 
 
 
348 aa  157  3e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1264  heat-inducible transcription repressor  34.38 
 
 
339 aa  157  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00809958 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13540  heat-inducible transcription repressor  33.13 
 
 
341 aa  156  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1241  heat-inducible transcription repressor  32.94 
 
 
340 aa  156  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000248464  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0852  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.77 
 
 
352 aa  156  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000798952  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2423  heat-inducible transcription repressor  31.75 
 
 
339 aa  155  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.557325  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2766  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.75 
 
 
344 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0267465  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.1 
 
 
351 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0187  heat-inducible transcription repressor  33.9 
 
 
362 aa  153  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.476664  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.76 
 
 
340 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.330335 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13430  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.16 
 
 
341 aa  152  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0763  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.82 
 
 
336 aa  151  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.94526  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2667  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.91 
 
 
340 aa  150  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2293  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.91 
 
 
340 aa  150  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.627899  normal  0.0361411 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1487  heat-inducible transcription repressor  31.66 
 
 
336 aa  151  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0868  negative regulator of class I heat shock protein  29.07 
 
 
342 aa  150  3e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0305  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.82 
 
 
342 aa  150  4e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2127  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.38 
 
 
373 aa  150  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3836  heat-inducible transcription repressor  31.22 
 
 
340 aa  149  6e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  decreased coverage  0.000187974 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2313  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.38 
 
 
345 aa  149  7e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000876043  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1489  negative regulator of class I heat shock protein  29.21 
 
 
357 aa  149  7e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1086  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.32 
 
 
350 aa  149  7e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0111351  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.15 
 
 
357 aa  149  8e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3042  heat-inducible transcription repressor  27.4 
 
 
343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00211057  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3460  heat-inducible transcription repressor  31.01 
 
 
347 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3456  heat-inducible transcription repressor  31.03 
 
 
351 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1903  heat-inducible transcription repressor  33.24 
 
 
337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.518414  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3523  heat-inducible transcription repressor  31.01 
 
 
347 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0346852  normal  0.41387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3471  heat-inducible transcription repressor  31.01 
 
 
347 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00335096 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2842  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.61 
 
 
342 aa  147  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.57 
 
 
344 aa  147  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0333  heat-inducible transcription repressor  32.85 
 
 
362 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0187094  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1858  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.75 
 
 
350 aa  146  6e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0426  heat-inducible transcription repressor  31.99 
 
 
362 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3163  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.06 
 
 
344 aa  145  7.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3642  heat-inducible transcription repressor  29.74 
 
 
352 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175788  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3837  heat-inducible transcription repressor  30.75 
 
 
343 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.833698  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0930  heat-inducible transcription repressor  31.36 
 
 
342 aa  145  9e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1693  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.09 
 
 
357 aa  145  1e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.608682  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0901  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.78 
 
 
345 aa  145  1e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0102  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.74 
 
 
363 aa  145  1e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.354305  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1874  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.43 
 
 
357 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00580637  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12399  heat-inducible transcription repressor  30.29 
 
 
343 aa  144  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3579  heat-inducible transcription repressor  30.7 
 
 
354 aa  144  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.621722  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4397  heat-inducible transcription repressor  27.25 
 
 
338 aa  144  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.332663  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7058  heat-inducible transcription repressor  31.9 
 
 
343 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2480  heat-inducible transcription repressor  31.07 
 
 
352 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0838  heat-inducible transcription repressor  29.38 
 
 
343 aa  143  5e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197604  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  28.36 
 
 
339 aa  143  5e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4449  heat-inducible transcription repressor  27.25 
 
 
338 aa  143  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000694366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0801  heat-inducible transcription repressor  26.88 
 
 
338 aa  143  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000436482  hitchhiker  4.70073e-19 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4476  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.45 
 
 
354 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.457422 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0783  heat-inducible transcription repressor  31.29 
 
 
339 aa  142  7e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0540401 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0394  heat-inducible transcription repressor  31.99 
 
 
362 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2886  heat-inducible transcription repressor  30.42 
 
 
352 aa  142  8e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4435  heat-inducible transcription repressor  26.88 
 
 
338 aa  142  8e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000489937  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4063  heat-inducible transcription repressor  26.88 
 
 
338 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.526253  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0261  heat-inducible transcription repressor  32.07 
 
 
340 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>