160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2794 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 378 aa  775    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  54.86 
 
 		 368 aa  431  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  54.36 
 
 		 377 aa  414  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  50.92 
 
 		 370 aa  378  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  47.3 
 
 		 378 aa  377  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  48.81 
 
 		 364 aa  324  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  44.27 
 
 		 370 aa  325  1e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4237  hypothetical protein  44.01 
 
 		 370 aa  323  4e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  43.73 
 
 		 365 aa  309  5e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  44 
 
 		 363 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  44.8 
 
 		 363 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  43.86 
 
 		 367 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  43.86 
 
 		 367 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1775  endonuclease III  43.85 
 
 		 357 aa  297  2e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17856  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0490  hypothetical protein  41.25 
 
 		 416 aa  292  9e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2613  SMC domain protein  40.36 
 
 		 369 aa  279  7e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  41.45 
 
 		 373 aa  275  9e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1025  hypothetical protein  42.74 
 
 		 362 aa  272  7e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000305528 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  41.32 
 
 		 378 aa  264  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3708  ATPase-like protein  42.33 
 
 		 364 aa  260  3e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  36.58 
 
 		 369 aa  238  1e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1226  hypothetical protein  37.21 
 
 		 384 aa  224  2e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0562  hypothetical protein  38.4 
 
 		 370 aa  213  5.999999999999999e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.260913  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2314  hypothetical protein  33.68 
 
 		 376 aa  199  5e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198863 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  32.11 
 
 		 395 aa  157  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  28.4 
 
 		 382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  26.84 
 
 		 382 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  26.84 
 
 		 382 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  27.53 
 
 		 386 aa  127  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  28.87 
 
 		 397 aa  116  7.999999999999999e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  28.72 
 
 		 398 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  24.62 
 
 		 362 aa  106  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2311  SMC domain protein  25.87 
 
 		 397 aa  106  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  27.95 
 
 		 409 aa  102  8e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2161  hypothetical protein  27.27 
 
 		 392 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587323  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  25.52 
 
 		 409 aa  100  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0146  ATPase-like  33.17 
 
 		 226 aa  99.4  9e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1947  ATPase, RecF-like protein  26.41 
 
 		 388 aa  99  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.942384  normal  0.334746 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  26.11 
 
 		 399 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3749  hypothetical protein  33.88 
 
 		 394 aa  97.4  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  25.69 
 
 		 424 aa  95.9  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  32 
 
 		 390 aa  94  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  32 
 
 		 390 aa  94  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2281  ATPase  25.61 
 
 		 390 aa  93.6  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  24.6 
 
 		 385 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0592  hypothetical protein  25.91 
 
 		 361 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3070  SMC domain-containing protein  26.32 
 
 		 365 aa  92.4  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2974  hypothetical protein  26.82 
 
 		 393 aa  90.9  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00544047  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  24.94 
 
 		 395 aa  89.4  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  25.56 
 
 		 410 aa  89  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3510  hypothetical protein  25.12 
 
 		 390 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.807476 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  25.47 
 
 		 390 aa  87.8  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  26.49 
 
 		 369 aa  87.8  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  25.24 
 
 		 390 aa  87.8  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  25.18 
 
 		 393 aa  87  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3701  hypothetical protein  25.18 
 
 		 390 aa  86.3  9e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  24.88 
 
 		 390 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  24.63 
 
 		 390 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  23.97 
 
 		 411 aa  85.5  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1016  SMC domain-containing protein  27.69 
 
 		 386 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0527217  normal  0.402685 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3194  ATPase-like protein  27.16 
 
 		 387 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794504  normal  0.0937144 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  25.35 
 
 		 390 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2001  SMC domain-containing protein  26.21 
 
 		 387 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3134  hypothetical protein  24.63 
 
 		 390 aa  84  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1792  hypothetical protein  32 
 
 		 390 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2525  hypothetical protein  26.63 
 
 		 387 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125523  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2274  hypothetical protein  26.1 
 
 		 392 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.618217  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1754  hypothetical protein  25.57 
 
 		 405 aa  82.8  0.000000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  25.76 
 
 		 386 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  25 
 
 		 388 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  23.73 
 
 		 393 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3220  SMC domain-containing protein  22.07 
 
 		 394 aa  79.7  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2706  hypothetical protein  22.08 
 
 		 395 aa  79.3  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2035  hypothetical protein  48.1 
 
 		 388 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  26.65 
 
 		 388 aa  79.3  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1387  ATPase-like protein  25 
 
 		 392 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2434  hypothetical protein  31.37 
 
 		 392 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329765  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2313  hypothetical protein  31.37 
 
 		 392 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.969478  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3397  hypothetical protein  21.84 
 
 		 395 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3924  ATPase-like protein  27.41 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.801052  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1418  hypothetical protein  31.37 
 
 		 436 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.936146  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1909  hypothetical protein  31.37 
 
 		 436 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3395  hypothetical protein  31.37 
 
 		 436 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1182  hypothetical protein  31.37 
 
 		 436 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  22.87 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  22.82 
 
 		 380 aa  74.7  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  25.64 
 
 		 390 aa  74.3  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5526  hypothetical protein  24.26 
 
 		 384 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768664  normal  0.0253524 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  23.72 
 
 		 394 aa  72.8  0.000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5019  ATPase, RecF-like protein  43.9 
 
 		 388 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1691  SMC domain protein  35.34 
 
 		 385 aa  71.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  hitchhiker  0.000000699352 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2255  ATPase, RecF-like  28.43 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0343  hypothetical protein  23.41 
 
 		 385 aa  72  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.261126 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  25 
 
 		 367 aa  70.5  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6253  ATPase, RecF-like protein  24.74 
 
 		 393 aa  69.7  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1824  ATPase-like protein  33.6 
 
 		 391 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.248078  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  21.84 
 
 		 399 aa  69.3  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3600  ATPase-like protein  24.86 
 
 		 416 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02963  hypothetical protein  25.11 
 
 		 376 aa  69.3  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6192  ATPase-like  33.61 
 
 		 391 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>