More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0218 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0144  sensory box histidine kinase  55.64 
 
 		 709 aa  676    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  56.67 
 
 		 710 aa  717    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.283964 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0218  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 695 aa  1420    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3734  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.38 
 
 		 665 aa  624  1e-177  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3629  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.77 
 
 		 665 aa  619  1e-176  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0010  sensory box histidine kinase/response regulator  33.07 
 
 		 727 aa  242  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0011  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 715 aa  239  9e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 715 aa  237  5.0000000000000005e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.99155  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0011  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 726 aa  234  5e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1630  sensory box histidine kinase  34.17 
 
 		 710 aa  201  5e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00580838  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1945  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 		 690 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000961188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.65 
 
 		 561 aa  193  8e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.237401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1885  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.41 
 
 		 694 aa  192  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2062  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 		 697 aa  192  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2335  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 		 694 aa  189  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.88 
 
 		 725 aa  159  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209286  normal  0.144143 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1898  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.81 
 
 		 546 aa  155  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4240  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.51 
 
 		 1064 aa  153  8e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 		 718 aa  152  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108149  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 		 556 aa  151  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.12815  normal  0.758765 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 639 aa  152  3e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 		 880 aa  151  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0412  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.52 
 
 		 695 aa  150  6e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4852  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 884 aa  149  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2295  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 		 905 aa  149  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 		 885 aa  147  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0694  external sensor signal transduction histidine kinase  27.07 
 
 		 592 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.52754  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1645  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 		 906 aa  146  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.884619  normal  0.02986 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.24 
 
 		 1977 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.24 
 
 		 701 aa  145  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.91 
 
 		 875 aa  145  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0848  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.53 
 
 		 844 aa  145  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0819  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.38 
 
 		 844 aa  145  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 620 aa  145  3e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  36.13 
 
 		 461 aa  144  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1217  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.51 
 
 		 1877 aa  144  6e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 		 641 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.44 
 
 		 1274 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2558  histidine kinase  29.8 
 
 		 397 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.344287  hitchhiker  0.000338162 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 		 815 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 637 aa  142  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1369  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.01 
 
 		 767 aa  142  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0713189  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 		 911 aa  142  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 		 640 aa  140  6e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4476  histidine kinase  34.14 
 
 		 461 aa  140  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0860551  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 		 556 aa  140  8.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.936608  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4457  histidine kinase  34.67 
 
 		 461 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 		 763 aa  139  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1418  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.77 
 
 		 853 aa  139  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.01 
 
 		 482 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000480808 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0820  multisensor signal transduction histidine kinase  24.74 
 
 		 519 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.43 
 
 		 639 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0323  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.64 
 
 		 706 aa  138  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.976803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3771  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 		 1039 aa  137  7.000000000000001e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 		 1010 aa  136  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2563  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.39 
 
 		 543 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 		 581 aa  136  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4807  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.21 
 
 		 1287 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00341781  normal  0.634217 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 639 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 		 421 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00283134  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  33.08 
 
 		 617 aa  136  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0169  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.24 
 
 		 1168 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 		 571 aa  134  6.999999999999999e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  31.05 
 
 		 968 aa  133  9e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2497  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.07 
 
 		 1168 aa  133  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.436801 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1308  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.53 
 
 		 894 aa  133  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.455977  normal  0.863404 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1928  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 920 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3138  sensor histidine kinase/response regulator  30.03 
 
 		 484 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.312332  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0540  GAF sensor hybrid histidine kinase  26.23 
 
 		 1816 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.46685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1171  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.76 
 
 		 601 aa  132  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.764922  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1239  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.32 
 
 		 601 aa  131  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1024  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 		 631 aa  130  6e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.963931  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0666  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 		 917 aa  130  6e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.220304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 		 568 aa  130  6e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2650  ATP-binding region ATPase domain protein  32.45 
 
 		 913 aa  130  7.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.574534  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2329  histidine kinase  31.02 
 
 		 470 aa  130  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4466  histidine kinase  31.47 
 
 		 464 aa  130  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.734574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5380  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 625 aa  130  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00714338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1267  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 542 aa  129  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 		 975 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.817585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.6 
 
 		 1305 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0836  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  31.44 
 
 		 599 aa  129  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.397263 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3761  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.89 
 
 		 1155 aa  128  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358181  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 467 aa  129  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 		 827 aa  128  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1113  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 		 1042 aa  129  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 		 453 aa  128  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1885  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.77 
 
 		 792 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2587  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.92 
 
 		 1158 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0133  histidine kinase  32.37 
 
 		 482 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4316  sensor histidine kinase  27.44 
 
 		 1695 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.946527 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  29.85 
 
 		 1046 aa  127  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0644  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.2 
 
 		 754 aa  127  6e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.7 
 
 		 780 aa  127  6e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1854  histidine kinase  28.48 
 
 		 1111 aa  127  7e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.131557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3786  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.07 
 
 		 1155 aa  127  7e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2142  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.67 
 
 		 1149 aa  127  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694825  hitchhiker  0.00121197 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.66 
 
 		 1713 aa  127  7e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.280335  normal  0.123564 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 		 592 aa  127  9e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4407  histidine kinase  31.18 
 
 		 286 aa  126  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.449221  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>