92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4024 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4024  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 278 aa  548  1e-155  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.284823  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1438  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  52.88 
 
 		 291 aa  254  1.0000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.626738 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2679  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.85 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00635777  normal  0.660983 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3504  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.88 
 
 		 285 aa  83.6  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.45027 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0905  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.03 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965687  normal  0.246268 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4022  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.95 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4976  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.72 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000483065 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24010  metal-dependent hydrolase  31.69 
 
 		 286 aa  65.5  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.078651 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6090  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.72 
 
 		 258 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.16 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126817  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1208  hypothetical protein  30.25 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.16 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42531  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.21 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11000  metal-dependent hydrolase  33.67 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.95 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3092  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.13 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5588  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.91 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3948  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.46 
 
 		 470 aa  60.1  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284355  normal  0.0358268 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6314  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.91 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0901897 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0408  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  34.29 
 
 		 1153 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.73 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1880  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  34.29 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.850381  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1972  metal-dependent hydrolase  34.29 
 
 		 338 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1779  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.62 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03927  inositol phosphosphingolipid phospholipase C (Eurofung)  26.61 
 
 		 451 aa  56.6  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.635574 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5493  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.57 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306278  hitchhiker  0.00234729 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0964  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.13 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4283  Metal-dependent exonuclease protein  28.37 
 
 		 286 aa  55.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.74 
 
 		 282 aa  55.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0108  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  32.46 
 
 		 591 aa  54.3  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.64 
 
 		 257 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1729  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.96 
 
 		 284 aa  53.1  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.102373  normal  0.215205 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1052  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.43 
 
 		 287 aa  52.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00191941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0260  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.69 
 
 		 639 aa  52.8  0.000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.61014  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0904  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.7 
 
 		 289 aa  52.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.240953 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1818  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.42 
 
 		 284 aa  52  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543499  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1756  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.75 
 
 		 286 aa  52  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6261  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.42 
 
 		 284 aa  52  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1144  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.43 
 
 		 287 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.703964  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2849  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30 
 
 		 644 aa  52  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00190481  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2228  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.85 
 
 		 286 aa  52  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0303  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.94 
 
 		 249 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401875  normal  0.151363 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1842  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.85 
 
 		 286 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0201  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.67 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3513  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.46 
 
 		 236 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00703913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2702  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.21 
 
 		 265 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1068  exodeoxyribonuclease III Xth  26.94 
 
 		 262 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.139383  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2527  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.34 
 
 		 576 aa  51.6  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_118  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  30.65 
 
 		 639 aa  50.4  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1842  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.13 
 
 		 284 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.108875 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4612  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.89 
 
 		 268 aa  50.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0765415  normal  0.0123856 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.22 
 
 		 298 aa  50.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4928  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.76 
 
 		 375 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0055  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.43 
 
 		 286 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322839  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2196  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.43 
 
 		 286 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.420987  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2234  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.43 
 
 		 286 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187821  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0224  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.52 
 
 		 389 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.224894  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6275  Metal-dependent hydrolase-like protein  32.16 
 
 		 617 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0433121  decreased coverage  0.00812081 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1114  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.43 
 
 		 286 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1350.1  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.43 
 
 		 324 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0665906  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2361  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27 
 
 		 286 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.602573  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05370  phospholipase C, putative  27.8 
 
 		 529 aa  47  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3633  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.88 
 
 		 252 aa  47  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0240015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1289  hypothetical protein  27.94 
 
 		 290 aa  47  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891999  normal  0.614576 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5119  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.82 
 
 		 284 aa  46.6  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.11 
 
 		 260 aa  46.2  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1455  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.97 
 
 		 285 aa  46.2  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271612  normal  0.540274 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.77 
 
 		 242 aa  46.2  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0034  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.21 
 
 		 280 aa  45.8  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0129877 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3678  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.46 
 
 		 437 aa  45.8  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.64554  normal  0.322426 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0806  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.56 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636912  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.71 
 
 		 279 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.79 
 
 		 283 aa  45.4  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0877  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.56 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2555  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.37 
 
 		 257 aa  45.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.337597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.74 
 
 		 808 aa  45.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5302  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.77 
 
 		 289 aa  45.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.974618 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.16 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5307  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.95 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3661  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.05 
 
 		 356 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.680606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0649  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  30.67 
 
 		 250 aa  43.9  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.441021  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3873  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.09 
 
 		 288 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0800  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32 
 
 		 258 aa  43.9  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.179814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5450  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.83 
 
 		 257 aa  43.5  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2544  beta-hemolysin  21.54 
 
 		 334 aa  43.5  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.32 
 
 		 328 aa  43.5  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.4 
 
 		 245 aa  43.5  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51669  hitchhiker  0.00270426 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0246  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.21 
 
 		 389 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.44 
 
 		 265 aa  42.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5408  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.34 
 
 		 634 aa  42.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.521256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5732  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.16 
 
 		 300 aa  42.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.673881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3285  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.1 
 
 		 363 aa  42.4  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>