More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1953 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 203 aa  417  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  79.1 
 
 		 202 aa  337  5.9999999999999996e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  72.92 
 
 		 198 aa  302  2.0000000000000002e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  69.54 
 
 		 204 aa  292  3e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  70.37 
 
 		 204 aa  286  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  68.93 
 
 		 206 aa  261  4e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  68.57 
 
 		 212 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  70.67 
 
 		 189 aa  228  5e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  47.42 
 
 		 188 aa  177  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  46.31 
 
 		 211 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  46.5 
 
 		 218 aa  161  5.0000000000000005e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  43.28 
 
 		 208 aa  157  9e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  46.29 
 
 		 251 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  46.29 
 
 		 251 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4205  Lytic transglycosylase catalytic  46.29 
 
 		 251 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0370  Lytic transglycosylase catalytic  46.67 
 
 		 216 aa  152  5e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.149841 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  45.25 
 
 		 239 aa  151  5e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  45.25 
 
 		 239 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  45.25 
 
 		 239 aa  151  7e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  45.83 
 
 		 226 aa  150  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  45.56 
 
 		 239 aa  149  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  43.26 
 
 		 249 aa  149  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  44.75 
 
 		 204 aa  148  6e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  47.65 
 
 		 202 aa  147  7e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0192  transglycosylase, putative  46.67 
 
 		 221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0931975  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  45.36 
 
 		 243 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  45.45 
 
 		 200 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  46.86 
 
 		 237 aa  145  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  53.17 
 
 		 206 aa  144  6e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  42.86 
 
 		 299 aa  144  6e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  43.1 
 
 		 247 aa  143  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  41.29 
 
 		 260 aa  143  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  57.14 
 
 		 191 aa  142  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  40.2 
 
 		 195 aa  141  6e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1919  Lytic transglycosylase catalytic  39.8 
 
 		 199 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4758  transglycosylase SLT domain-containing protein  41 
 
 		 217 aa  139  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  55.08 
 
 		 233 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1360  Lytic transglycosylase catalytic  44.69 
 
 		 304 aa  139  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  44.71 
 
 		 245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  58.26 
 
 		 196 aa  137  7e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  53.44 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  41.18 
 
 		 285 aa  136  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2520  lytic transglycosylase, catalytic  40.29 
 
 		 280 aa  136  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  43.82 
 
 		 297 aa  136  2e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  52.38 
 
 		 244 aa  136  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3860  lytic transglycosylase, catalytic  42.37 
 
 		 329 aa  136  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1881  lytic transglycosylase catalytic  42.7 
 
 		 297 aa  135  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.520099  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  45.76 
 
 		 242 aa  135  5e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3220  lytic transglycosylase, catalytic  43.85 
 
 		 212 aa  134  9e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0352  lytic transglycosylase  38.17 
 
 		 273 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  52.42 
 
 		 217 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  55.08 
 
 		 283 aa  133  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00442  soluble lytic murein transglycosylase  55.17 
 
 		 328 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2008  transglycosylase SLT domain-containing protein  39 
 
 		 214 aa  132  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0393  lytic transglycosylase, catalytic  38.71 
 
 		 305 aa  132  3e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.168274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  38.77 
 
 		 296 aa  131  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  52.14 
 
 		 174 aa  130  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  57.63 
 
 		 208 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  47.2 
 
 		 280 aa  129  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  38.77 
 
 		 296 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  51.94 
 
 		 261 aa  127  8.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0367  lytic transglycosylase, catalytic  38.83 
 
 		 215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  46.76 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  39.34 
 
 		 209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3631  Lytic transglycosylase catalytic  39.34 
 
 		 209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3607  lytic transglycosylase, catalytic  40.12 
 
 		 326 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  52.89 
 
 		 216 aa  125  6e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  50.38 
 
 		 222 aa  124  9e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2827  Lytic transglycosylase catalytic  48.39 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6408  lytic transglycosylase catalytic  38.04 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  39.25 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  51.72 
 
 		 442 aa  124  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  39.47 
 
 		 209 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  61.76 
 
 		 199 aa  123  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4513  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 230 aa  122  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141969  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28610  lytic transglycosylase  55.17 
 
 		 201 aa  122  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1871  lytic transglycosylase, catalytic  49.57 
 
 		 281 aa  121  5e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000100876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  52.14 
 
 		 438 aa  121  6e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2441  lytic transglycosylase, catalytic  50.44 
 
 		 300 aa  121  7e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0168706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1015  lytic transglycosylase, catalytic  38.53 
 
 		 292 aa  121  7e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0929  Lytic transglycosylase catalytic  38.53 
 
 		 300 aa  121  8e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.316405  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  40.49 
 
 		 281 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  42.07 
 
 		 228 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3427  Lytic transglycosylase catalytic  38.92 
 
 		 295 aa  119  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  49.59 
 
 		 217 aa  119  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0748  lytic transglycosylase, catalytic  46.03 
 
 		 146 aa  119  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00376609  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  39.06 
 
 		 215 aa  117  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6881  Lytic transglycosylase catalytic  50.78 
 
 		 271 aa  117  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987079  normal  0.0912273 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  37.88 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6404  lytic transglycosylase catalytic  50.82 
 
 		 362 aa  117  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0649822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  38.66 
 
 		 218 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0406  Lytic transglycosylase catalytic  49.11 
 
 		 258 aa  116  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.717558  normal  0.0556667 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2611  lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 251 aa  116  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.59616 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  39.15 
 
 		 197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  50.85 
 
 		 291 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  52.59 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  39.33 
 
 		 197 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  50.4 
 
 		 278 aa  116  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  48.31 
 
 		 245 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0483  lytic transglycosylase, catalytic  48.72 
 
 		 299 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>