More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0018 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 481 aa  985    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3269  response regulator  31.67 
 
 		 600 aa  233  5e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.633194  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0362  metal dependent phosphohydrolase  45.59 
 
 		 518 aa  206  5e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2803  metal dependent phosphohydrolase  40.28 
 
 		 448 aa  204  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361766  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  48.74 
 
 		 465 aa  203  6e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1158  metal dependent phosphohydrolase  41.9 
 
 		 314 aa  201  3e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.395393 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3335  metal dependent phosphohydrolase  40.74 
 
 		 611 aa  200  3.9999999999999996e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3089  metal dependent phosphohydrolase  51.89 
 
 		 366 aa  194  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2150  metal dependent phosphohydrolase  45 
 
 		 718 aa  193  6e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0849  metal dependent phosphohydrolase  41.77 
 
 		 710 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1779  metal dependent phosphohydrolase  41.2 
 
 		 703 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000172323 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2438  metal dependent phosphohydrolase  41.2 
 
 		 703 aa  190  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1889  metal dependent phosphohydrolase  36.99 
 
 		 487 aa  190  4e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.562954  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0995  metal dependent phosphohydrolase  52.35 
 
 		 547 aa  189  1e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.656707  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1135  metal dependent phosphohydrolase  52.35 
 
 		 547 aa  189  1e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1178  metal dependent phosphohydrolase  40.76 
 
 		 539 aa  189  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1201  metal dependent phosphohydrolase  44.03 
 
 		 719 aa  187  3e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2559  metal dependent phosphohydrolase  41.34 
 
 		 553 aa  187  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107172 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0032  putative PAS/PAC sensor protein  42.49 
 
 		 632 aa  187  4e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0790714  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2919  metal dependent phosphohydrolase  46.74 
 
 		 451 aa  187  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55477  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2622  HAMP domain/GAF domain/HD domain-containing protein  40.71 
 
 		 712 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0279  metal dependent phosphohydrolase  48.62 
 
 		 363 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258813  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0998  metal dependent phosphohydrolase  49.14 
 
 		 467 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000200271  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  45.24 
 
 		 792 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2856  putative PAS/PAC sensor protein  51.61 
 
 		 339 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220538  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0550  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  47.28 
 
 		 509 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2727  metal dependent phosphohydrolase  49.72 
 
 		 387 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328155  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1829  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  51.96 
 
 		 357 aa  183  7e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  48.63 
 
 		 1171 aa  182  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1941  metal dependent phosphohydrolase  50.59 
 
 		 357 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000817968  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0798  metal dependent phosphohydrolase  32.74 
 
 		 545 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0129  metal dependent phosphohydrolase  46.89 
 
 		 505 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0142  metal dependent phosphohydrolase  45.69 
 
 		 545 aa  180  4e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000694732  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  44.76 
 
 		 836 aa  180  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  54.49 
 
 		 880 aa  179  7e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  45.85 
 
 		 841 aa  179  7e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  53.66 
 
 		 860 aa  179  7e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2498  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.5 
 
 		 367 aa  179  8e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8321  putative metal dependent phosphohydrolase  44.97 
 
 		 451 aa  179  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0677  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.76 
 
 		 343 aa  179  9e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.756866  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1713  metal dependent phosphohydrolase  38.96 
 
 		 692 aa  179  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000361253  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2101  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  50.84 
 
 		 357 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2031  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  50.84 
 
 		 357 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0459  metal dependent phosphohydrolase  44.81 
 
 		 428 aa  178  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3292  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.56 
 
 		 502 aa  178  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1246  metal dependent phosphohydrolase  38.27 
 
 		 317 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1178  metal dependent phosphohydrolase  37.69 
 
 		 317 aa  177  4e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2753  hypothetical protein  44.02 
 
 		 308 aa  177  4e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1118  metal dependent phosphohydrolase  39.33 
 
 		 317 aa  177  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.328624  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3705  metal dependent phosphohydrolase  40.97 
 
 		 444 aa  177  5e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  37.9 
 
 		 371 aa  176  6e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2059  metal dependent phosphohydrolase  47.57 
 
 		 430 aa  176  8e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000152605  hitchhiker  0.00000484417 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  48.6 
 
 		 508 aa  176  9e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4027  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.07 
 
 		 346 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247639  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1811  GGDEF/HD domain-containing protein  45.3 
 
 		 563 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.63619  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0880  metal dependent phosphohydrolase  39.92 
 
 		 311 aa  175  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.45566  normal  0.533895 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1991  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  48.59 
 
 		 357 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  48.59 
 
 		 506 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000458361  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3699  metal dependent phosphohydrolase  46.2 
 
 		 469 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.849083 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1202  metal dependent phosphohydrolase  47.09 
 
 		 177 aa  173  5.999999999999999e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.42 
 
 		 496 aa  173  5.999999999999999e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2645  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.56 
 
 		 364 aa  173  6.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2833  metal dependent phosphohydrolase  51.98 
 
 		 379 aa  173  6.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0209293  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1575  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  46.86 
 
 		 561 aa  173  6.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.874521  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0568  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 		 495 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.17826  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  39.62 
 
 		 1073 aa  172  9e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.41 
 
 		 491 aa  172  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1530  GGDEF/HD domain-containing protein  44.75 
 
 		 564 aa  172  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.890216  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.33 
 
 		 513 aa  172  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  45.99 
 
 		 876 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1579  metal dependent phosphohydrolase  44.02 
 
 		 618 aa  171  2e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0764  metal dependent phosphohydrolase  47.62 
 
 		 438 aa  171  4e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0725  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.62 
 
 		 498 aa  170  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1659  metal dependent phosphohydrolase  43.17 
 
 		 407 aa  170  5e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.244374  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1552  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  45.08 
 
 		 971 aa  170  5e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1194  metal dependent phosphohydrolase  46.2 
 
 		 339 aa  170  6e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  44.81 
 
 		 649 aa  170  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0823  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.93 
 
 		 755 aa  169  9e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0624  response regulator  41.95 
 
 		 334 aa  169  1e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2045  metal dependent phosphohydrolase  41.15 
 
 		 373 aa  169  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.803605  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15930  metal dependent phosphohydrolase  45.2 
 
 		 718 aa  168  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0679  metal dependent phosphohydrolase  50.56 
 
 		 571 aa  168  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0546  metal dependent phosphohydrolase  41.94 
 
 		 451 aa  168  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.880848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1669  metal dependent phosphohydrolase  42.4 
 
 		 499 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1645  metal dependent phosphohydrolase  42.39 
 
 		 615 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1326  metal dependent phosphohydrolase  47.67 
 
 		 428 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00151166  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0065  metal dependent phosphohydrolase  45.21 
 
 		 452 aa  167  4e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.041414  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0253  putative PAS/PAC sensor protein  45.45 
 
 		 453 aa  167  5e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1050  metal dependent phosphohydrolase  43.33 
 
 		 1313 aa  167  5e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0597  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.93 
 
 		 334 aa  167  5e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4444  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.92 
 
 		 526 aa  166  5.9999999999999996e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3236  metal dependent phosphohydrolase  45.55 
 
 		 636 aa  167  5.9999999999999996e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3082  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  46.11 
 
 		 550 aa  166  8e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000925788 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0863  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.56 
 
 		 351 aa  166  9e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0458  metal dependent phosphohydrolase  40.34 
 
 		 512 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.079509  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0691  metal dependent phosphohydrolase  48.35 
 
 		 392 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3638  metal dependent phosphohydrolase  41.3 
 
 		 252 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1360  metal dependent phosphohydrolase  47.4 
 
 		 428 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.624782  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0244  metal dependent phosphohydrolase  49.14 
 
 		 220 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100694  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0417  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  44.56 
 
 		 853 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>