More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1929 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1929  trigger factor  100 
 
 		 440 aa  881    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  56.88 
 
 		 437 aa  528  1e-149  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  46.96 
 
 		 431 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  46.08 
 
 		 433 aa  397  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  41.94 
 
 		 433 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  41.61 
 
 		 435 aa  356  5e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  42.07 
 
 		 435 aa  356  5e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  35.45 
 
 		 439 aa  280  3e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  32.25 
 
 		 429 aa  229  7e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2692  trigger factor  30.7 
 
 		 443 aa  228  2e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538517  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  32.41 
 
 		 428 aa  228  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  33.03 
 
 		 446 aa  226  7e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  33.8 
 
 		 428 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  32.05 
 
 		 438 aa  219  1e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  33.49 
 
 		 435 aa  219  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  31.58 
 
 		 438 aa  218  2e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  32.35 
 
 		 435 aa  212  9e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  34.7 
 
 		 428 aa  210  3e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  34.7 
 
 		 428 aa  210  4e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3500  trigger factor  30.39 
 
 		 429 aa  209  6e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3422  trigger factor  31.21 
 
 		 430 aa  209  7e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.375201  normal  0.212187 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3436  trigger factor  30.39 
 
 		 429 aa  209  9e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  32.03 
 
 		 425 aa  207  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  32.03 
 
 		 425 aa  207  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3354  trigger factor  30.3 
 
 		 429 aa  206  8e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  32.26 
 
 		 425 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  30.47 
 
 		 432 aa  205  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  32.03 
 
 		 425 aa  204  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  31.8 
 
 		 425 aa  203  4e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  31.8 
 
 		 425 aa  203  4e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  31.8 
 
 		 425 aa  203  4e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  31.8 
 
 		 425 aa  203  4e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  31.8 
 
 		 425 aa  203  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  32.35 
 
 		 427 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  31.03 
 
 		 426 aa  200  5e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0510  trigger factor  31.25 
 
 		 448 aa  199  7e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.155195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  31.11 
 
 		 428 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  29.46 
 
 		 428 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  30.28 
 
 		 428 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1214  trigger factor  31.22 
 
 		 437 aa  197  4.0000000000000005e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  30.65 
 
 		 425 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0751  trigger factor  31.22 
 
 		 437 aa  196  7e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.173993  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0198  trigger factor  32.79 
 
 		 435 aa  194  3e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0109  trigger factor  30.16 
 
 		 432 aa  194  3e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17984 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  28.74 
 
 		 435 aa  194  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0307  trigger factor  29.36 
 
 		 445 aa  194  4e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121023  normal  0.638239 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1746  trigger factor  30.16 
 
 		 436 aa  192  8e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.132696 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  28.37 
 
 		 435 aa  192  9e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  30.52 
 
 		 446 aa  192  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  30.28 
 
 		 442 aa  192  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4984  trigger factor  28.05 
 
 		 448 aa  191  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  28.5 
 
 		 436 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3727  trigger factor  29.93 
 
 		 436 aa  190  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.267155  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  29.33 
 
 		 436 aa  189  5.999999999999999e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  29.47 
 
 		 433 aa  189  1e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  28.24 
 
 		 488 aa  187  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1741  trigger factor  28.77 
 
 		 437 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658695 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3605  trigger factor  28.44 
 
 		 471 aa  186  7e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3698  trigger factor  28.51 
 
 		 436 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2299  trigger factor  29.52 
 
 		 443 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457193 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  32.35 
 
 		 438 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  27.57 
 
 		 434 aa  184  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1901  trigger factor  29.29 
 
 		 437 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.191378  hitchhiker  0.00938494 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3470  trigger factor  29.29 
 
 		 437 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000745697 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3497  trigger factor  27.74 
 
 		 436 aa  182  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0314111  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23550  trigger factor  29.47 
 
 		 436 aa  180  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2049  trigger factor  27.97 
 
 		 436 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431317  normal  0.217945 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  28.41 
 
 		 435 aa  179  8e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  27.34 
 
 		 434 aa  179  9e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1735  trigger factor  29.32 
 
 		 433 aa  178  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0657081  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2496  trigger factor  28.8 
 
 		 434 aa  179  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377099  normal  0.020755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2564  trigger factor  28.8 
 
 		 434 aa  179  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.0625081 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  28.71 
 
 		 433 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2233  trigger factor  27.46 
 
 		 447 aa  178  2e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0292986  normal  0.151028 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  28.71 
 
 		 433 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4363  trigger factor  28.1 
 
 		 500 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2662  trigger factor  29.03 
 
 		 434 aa  178  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000102256  normal  0.690021 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  28.94 
 
 		 434 aa  177  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1431  trigger factor  27.97 
 
 		 432 aa  177  4e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0842369  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004045  cell division trigger factor  28.24 
 
 		 435 aa  176  6e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000395206  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41250  trigger factor  27.51 
 
 		 436 aa  176  7e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.755772 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2496  trigger factor  29.03 
 
 		 434 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000460382  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1940  trigger factor  27 
 
 		 447 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2222  trigger factor  28.87 
 
 		 438 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.939539  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3133  trigger factor  27.81 
 
 		 479 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  28.18 
 
 		 434 aa  174  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1793  trigger factor  28.6 
 
 		 434 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1830  trigger factor  28.86 
 
 		 443 aa  174  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2341  trigger factor  27.57 
 
 		 435 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0955017  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0066  trigger factor  27.7 
 
 		 469 aa  173  5e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0916  trigger factor  29.75 
 
 		 440 aa  173  6.999999999999999e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1826  trigger factor  28.86 
 
 		 443 aa  172  7.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  26.92 
 
 		 433 aa  172  9e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000677902  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2922  trigger factor  27.13 
 
 		 460 aa  172  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.583147  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  30.1 
 
 		 427 aa  172  1e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0903  trigger factor  26.81 
 
 		 432 aa  172  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000144682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1489  trigger factor  28.34 
 
 		 434 aa  171  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000061134  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  27.34 
 
 		 434 aa  171  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2925  trigger factor  29.93 
 
 		 455 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3171  trigger factor  29.93 
 
 		 455 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.904299 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>