More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0209 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0209  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  100 
 
 
235 aa  464  9.999999999999999e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.415502  normal  0.0513274 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0025  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  46.26 
 
 
219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.412211  normal  0.132054 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2535  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.01 
 
 
220 aa  167  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2186  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  39.71 
 
 
221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1720  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.59 
 
 
222 aa  148  7e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.739414  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1301  HAD superfamily hydrolase  38.69 
 
 
217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.193279  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1248  putative phosphatase  38.69 
 
 
245 aa  145  5e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0320167  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4333  HAD family hydrolase  34.13 
 
 
218 aa  145  8.000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3203  hydrolase  36.62 
 
 
220 aa  139  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3123  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  33.81 
 
 
221 aa  136  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025393 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2202  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  33.33 
 
 
221 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.958257  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2332  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  34.76 
 
 
221 aa  135  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150125  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2250  HAD superfamily hydrolase  34.29 
 
 
221 aa  135  8e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17199  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3215  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.23 
 
 
217 aa  132  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.246246 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2004  phosphoglycolate phosphatase  33.81 
 
 
221 aa  132  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000935232  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2064  HAD superfamily hydrolase  33.81 
 
 
221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2220  HAD superfamily hydrolase  33.81 
 
 
221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2248  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  33.81 
 
 
221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.2381099999999995e-27 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3263  HAD family hydrolase  34.6 
 
 
216 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2003  phosphoglycolate phosphatase  33.81 
 
 
221 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.196564  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2045  HAD family hydrolase  32.54 
 
 
225 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143641  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1821  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.11 
 
 
238 aa  125  7e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000701178 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40.31 
 
 
220 aa  124  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.133542 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0109  HAD family hydrolase  36.41 
 
 
224 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000398417 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0092  HAD family hydrolase  37.56 
 
 
216 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0112  HAD family hydrolase  35.92 
 
 
224 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0709114  normal  0.0897877 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.64 
 
 
217 aa  122  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.652563  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35600  predicted phosphatase  36.07 
 
 
220 aa  122  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0065  hypothetical protein  37.39 
 
 
221 aa  121  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00770  hypothetical protein  37.39 
 
 
221 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1212  hypothetical protein  35.29 
 
 
219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0173059  normal  0.0170431 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0094  HAD superfamily hydrolase  36.27 
 
 
216 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0048007 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2445  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.16 
 
 
232 aa  118  9e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0477823 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2643  HAD family hydrolase  33.04 
 
 
227 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735097  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0109  HAD family hydrolase  36.27 
 
 
237 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02117  indigoidine synthesis like protein  36.67 
 
 
214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4457  HAD family hydrolase  35.71 
 
 
215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1453  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.89 
 
 
228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.781565 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2080  hydrolase  35.65 
 
 
231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.025582  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2284  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  37.74 
 
 
223 aa  112  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08880  predicted phosphatase  35.38 
 
 
247 aa  108  5e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0898254  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0364  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.71 
 
 
229 aa  108  9.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2285  phosphatases  30.84 
 
 
221 aa  105  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.812545  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12262  hypothetical protein  37.43 
 
 
291 aa  105  8e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0568  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  39.27 
 
 
226 aa  104  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.939008  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1603  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.23 
 
 
219 aa  103  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.699082  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0469  phosphatase  31.86 
 
 
239 aa  103  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.876662  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3357  HAD family hydrolase  35.9 
 
 
225 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563769  normal  0.442665 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1452  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  37.17 
 
 
231 aa  102  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.546355 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3346  HAD family hydrolase  35.9 
 
 
225 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.307883  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3408  HAD family hydrolase  35.9 
 
 
225 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.155839  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0956  phosphatase, putative  25.59 
 
 
211 aa  99.8  3e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000103613  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2889  HAD family hydrolase  33.18 
 
 
228 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.119829  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0174  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.57 
 
 
221 aa  96.7  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000420461  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1536  haloacid dehalogenase-like hydrolase  32.47 
 
 
223 aa  96.7  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.344514  normal  0.620103 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3458  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.62 
 
 
252 aa  95.1  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00396228  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  29.67 
 
 
223 aa  95.1  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0886  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.84 
 
 
236 aa  94.7  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0500332 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3621  HAD family hydrolase  35.48 
 
 
228 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3132  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.37 
 
 
226 aa  94  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  29.44 
 
 
227 aa  92  7e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2658  haloacid dehalogenase-like hydrolase  30.97 
 
 
236 aa  89.4  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3098  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.82 
 
 
228 aa  88.6  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0621452  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.64 
 
 
221 aa  87.8  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  27.75 
 
 
229 aa  87.8  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3563  hydrolase  31.46 
 
 
232 aa  88.2  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2274  phosphoglycolate phosphatase  30.93 
 
 
216 aa  86.7  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0258  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.76 
 
 
220 aa  86.7  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  25.45 
 
 
225 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  25.45 
 
 
225 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1784  HAD family hydrolase  29.33 
 
 
226 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.889068  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0795  haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.28 
 
 
244 aa  83.6  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1175  HAD family hydrolase  30.16 
 
 
222 aa  83.6  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.341694  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2632  HAD family hydrolase  26.64 
 
 
216 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.861911  hitchhiker  0.000131082 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  25.45 
 
 
225 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0006  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 
226 aa  83.2  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.537352  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1156  phosphoglycolate phosphatase  33.65 
 
 
209 aa  83.2  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.53294 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  27.88 
 
 
217 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  24.23 
 
 
235 aa  82  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  27.52 
 
 
226 aa  81.6  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  33.66 
 
 
238 aa  81.6  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2034  HAD family hydrolase  26.15 
 
 
216 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.645104  normal  0.0672621 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  26.27 
 
 
226 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4445  phosphoglycolate phosphatase  33.8 
 
 
234 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0670358  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6944  phosphoglycolate phosphatase  33.18 
 
 
257 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0927  HAD family hydrolase  29.86 
 
 
210 aa  79.7  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2232  pyrophosphatase PpaX  27.62 
 
 
214 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  26.92 
 
 
214 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  28.17 
 
 
227 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03140  phosphoglycolate phosphatase  28.91 
 
 
216 aa  79.7  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0384  HAD family hydrolase  28.31 
 
 
222 aa  79.3  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000045535  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.13 
 
 
230 aa  79.3  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1595  HAD family hydrolase  26.7 
 
 
219 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  normal  0.0112895 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2473  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
248 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000591891  hitchhiker  0.00615598 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  27.04 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  24.67 
 
 
226 aa  79.3  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1367  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.59 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  25 
 
 
225 aa  79  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0791  HAD family hydrolase  32.68 
 
 
220 aa  78.6  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0218  HAD superfamily hydrolase  21.4 
 
 
215 aa  77.8  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>