More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1753 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  47.24 
 
 		 881 aa  765    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  41.03 
 
 		 858 aa  636    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  68.2 
 
 		 871 aa  1198    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  43.46 
 
 		 868 aa  681    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0095  DNA mismatch repair protein MutS  41.18 
 
 		 891 aa  644    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0480084 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2107  DNA mismatch repair protein MutS  47.45 
 
 		 882 aa  692    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317076 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  39.69 
 
 		 873 aa  656    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  43.35 
 
 		 854 aa  647    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  41.76 
 
 		 863 aa  666    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  47.25 
 
 		 932 aa  769    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  40.15 
 
 		 892 aa  638    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  44.79 
 
 		 863 aa  746    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  41.1 
 
 		 858 aa  648    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2734  DNA mismatch repair protein MutS  42.06 
 
 		 888 aa  642    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  42.57 
 
 		 896 aa  666    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  40.37 
 
 		 892 aa  640    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  40.35 
 
 		 890 aa  640    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  40.29 
 
 		 894 aa  639    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  40.83 
 
 		 872 aa  639    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1723  DNA mismatch repair protein MutS  41.01 
 
 		 855 aa  653    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3368  DNA mismatch repair protein MutS  41.94 
 
 		 888 aa  641    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.583963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  39.55 
 
 		 872 aa  659    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  45.09 
 
 		 869 aa  734    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  43.62 
 
 		 891 aa  699    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  42.35 
 
 		 900 aa  683    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1900  DNA mismatch repair protein MutS  42.76 
 
 		 868 aa  681    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  43.69 
 
 		 860 aa  708    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  41.82 
 
 		 854 aa  639    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  43.67 
 
 		 853 aa  671    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2983  DNA mismatch repair protein MutS  43.23 
 
 		 864 aa  689    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  40.67 
 
 		 859 aa  636    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  57.88 
 
 		 870 aa  998    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  40.57 
 
 		 895 aa  649    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  47.15 
 
 		 897 aa  706    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  41.65 
 
 		 873 aa  642    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  68.38 
 
 		 872 aa  1206    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  41.17 
 
 		 904 aa  645    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0355  DNA mismatch repair protein MutS  41.86 
 
 		 910 aa  637    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171458 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  40.37 
 
 		 892 aa  640    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  41.74 
 
 		 854 aa  646    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3781  DNA mismatch repair protein MutS  41.05 
 
 		 892 aa  641    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0472636 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  58.76 
 
 		 872 aa  1028    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2157  DNA mismatch repair protein MutS  47.23 
 
 		 882 aa  691    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.404203  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  44.93 
 
 		 863 aa  674    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1698  DNA mismatch repair protein MutS  47.34 
 
 		 882 aa  688    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  45.11 
 
 		 850 aa  673    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0842  DNA mismatch repair protein MutS  40.66 
 
 		 860 aa  646    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.899937  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  46.21 
 
 		 868 aa  763    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  41.21 
 
 		 875 aa  642    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  47.09 
 
 		 870 aa  775    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  39.84 
 
 		 874 aa  636    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  72.02 
 
 		 872 aa  1266    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  46.41 
 
 		 882 aa  677    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  41.5 
 
 		 878 aa  649    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  38.42 
 
 		 881 aa  637    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3868  DNA mismatch repair protein MutS  40.35 
 
 		 890 aa  640    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  42.18 
 
 		 887 aa  676    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  44.56 
 
 		 867 aa  710    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  41.17 
 
 		 859 aa  645    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  40.22 
 
 		 890 aa  637    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3816  DNA mismatch repair protein MutS  40.37 
 
 		 892 aa  639    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0516  DNA mismatch repair protein MutS  42.13 
 
 		 886 aa  662    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  44.34 
 
 		 882 aa  684    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1883  DNA mismatch repair protein MutS  41.67 
 
 		 858 aa  667    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  42.11 
 
 		 872 aa  667    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1753  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 837 aa  1712    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.581518  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  39.55 
 
 		 872 aa  659    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0147  DNA mismatch repair protein MutS  41.24 
 
 		 856 aa  644    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.692226  normal  0.372979 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  42.41 
 
 		 910 aa  708    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  42.35 
 
 		 910 aa  704    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  48.41 
 
 		 873 aa  786    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  46.22 
 
 		 865 aa  678    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  41.36 
 
 		 861 aa  636    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  42.44 
 
 		 903 aa  681    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  41.26 
 
 		 861 aa  636    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  44.19 
 
 		 859 aa  714    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05155  putative DNA mismatch repair protein MutS  40.18 
 
 		 869 aa  643    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  94.25 
 
 		 869 aa  1667    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  45.85 
 
 		 880 aa  710    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  46.2 
 
 		 823 aa  691    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  47.45 
 
 		 898 aa  713    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2247  DNA mismatch repair protein MutS  47.05 
 
 		 882 aa  692    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136567  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  42.38 
 
 		 862 aa  647    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  46.93 
 
 		 896 aa  792    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  45.22 
 
 		 857 aa  698    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  46.06 
 
 		 889 aa  763    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  43.15 
 
 		 868 aa  669    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  41.24 
 
 		 861 aa  636    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  60.96 
 
 		 870 aa  1060    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  40.91 
 
 		 856 aa  635  1e-180  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  40.8 
 
 		 856 aa  632  1e-180  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  42.33 
 
 		 855 aa  635  1e-180  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1431  DNA mismatch repair protein MutS  39.82 
 
 		 892 aa  633  1e-180  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.964721 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  40.83 
 
 		 863 aa  632  1e-180  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  41.13 
 
 		 856 aa  632  1e-180  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  40.13 
 
 		 887 aa  634  1e-180  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  41.24 
 
 		 861 aa  634  1e-180  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  39.63 
 
 		 871 aa  629  1e-179  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4050  DNA mismatch repair protein MutS  41.58 
 
 		 857 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.593835  hitchhiker  0.000000000609956 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  41.65 
 
 		 872 aa  630  1e-179  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>